More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0219 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0219  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  100 
 
 		 385 aa  787    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0231  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  38.56 
 
 		 342 aa  228  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13333  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 329 aa  115  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7635  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  26.28 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  25.4 
 
 		 324 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  30.6 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 346 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0397  AraC family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 327 aa  107  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 346 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 346 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 319 aa  107  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  24.42 
 
 		 321 aa  103  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3736  AraC family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2046  AraC family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 326 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  27.12 
 
 		 319 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1975  AraC family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 367 aa  94.4  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2110  transcriptional regulator, AraC family  27.8 
 
 		 305 aa  92  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7915  transcriptional regulator, AraC family  26.28 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0435476  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  24.84 
 
 		 330 aa  90.5  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3779  AraC family transcriptional regulator  21.52 
 
 		 339 aa  88.6  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0505426 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 319 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5309  AraC family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 314 aa  87  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0311783  normal  0.649515 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2723  helix-turn-helix domain-containing protein  25.76 
 
 		 313 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5301  AraC family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0210  AraC family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4410  helix-turn-helix domain-containing protein  26.14 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.316774 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2213  helix-turn-helix, AraC type  26.07 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4347  AraC family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.378595 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5215  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  25.42 
 
 		 311 aa  82.4  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329333  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 368 aa  81.6  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1165  AraC family transcriptional regulator  23.05 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2883  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  24.24 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 324 aa  79  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4895  AraC family transcriptional regulator  20.3 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  19.87 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4032  DNA-binding transcriptional activator FeaR  23.77 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000774169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  38.64 
 
 		 791 aa  77.8  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5130  AraC family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  40.19 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4494  AraC family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5729  AraC family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3050  transcriptional regulator, AraC family  23.65 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.239612  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  19.87 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  19.87 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  19.87 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  19.87 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  20.2 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  19.87 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57630  AraC family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.963773 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  19.87 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  20.73 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2823  AraC family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 332 aa  76.3  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599889  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5389  transcriptional regulator, AraC family  25.9 
 
 		 335 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112757 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  36.94 
 
 		 313 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3942  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.466068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3203  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123314  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  33.78 
 
 		 325 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  40.82 
 
 		 335 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3145  AraC family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 160 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3516  AraC family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2259  helix-turn-helix domain-containing protein  24.05 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2002  AraC family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0150  AraC family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291508 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  39.39 
 
 		 1373 aa  72.8  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  34.96 
 
 		 1374 aa  72.8  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6279  AraC family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 338 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147886  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0042  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 344 aa  72.8  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  25.78 
 
 		 791 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  36 
 
 		 347 aa  72  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  39.42 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321471  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2830  helix-turn-helix domain-containing protein  31.65 
 
 		 291 aa  72  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  28.03 
 
 		 305 aa  72  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1313  AraC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  40 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0534  transcriptional regulator, AraC family  27.67 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  36.45 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  38 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  38 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3660  AraC family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.954099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3145  AraC family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 336 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6715  AraC family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3261  helix-turn-helix domain-containing protein  26.23 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000231694  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3674  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.833381  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  38.24 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>