More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6901 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6901  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 		 400 aa  786    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.473487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0174  serine phosphatase  67.07 
 
 		 390 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.872629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1695  stage II sporulation E family protein  42.95 
 
 		 346 aa  208  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0870633  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2794  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  39.93 
 
 		 376 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242922  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0848  protein serine/threonine phosphatase  40.52 
 
 		 369 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509752  normal  0.225073 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5480  protein serine/threonine phosphatase  42.02 
 
 		 455 aa  166  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00189535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1556  serine phosphatase  39.75 
 
 		 363 aa  150  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.79241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1873  protein serine/threonine phosphatase  43.7 
 
 		 382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.755002  normal  0.205134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0249  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  39.36 
 
 		 359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2409  Stage II sporulation E family protein  40.28 
 
 		 400 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0085  protein serine/threonine phosphatase  42.8 
 
 		 375 aa  146  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.611394  normal  0.0411446 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0088  stage II sporulation E family protein  43.62 
 
 		 375 aa  143  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4609  protein serine/threonine phosphatase  42.21 
 
 		 395 aa  143  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.919573  decreased coverage  0.0000074817 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5915  protein serine/threonine phosphatase  46.52 
 
 		 372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3720  protein serine/threonine phosphatase  44.88 
 
 		 315 aa  139  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5452  protein serine/threonine phosphatase  37.25 
 
 		 400 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180738  normal  0.458665 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2796  protein phosphatase 2C-like  36.4 
 
 		 397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2103  Stage II sporulation E family protein  39.77 
 
 		 350 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1132  protein serine/threonine phosphatase  36.83 
 
 		 389 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.815308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3955  protein serine/threonine phosphatase  34.77 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0050262  normal  0.108854 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0093  stage II sporulation E family protein  25.3 
 
 		 464 aa  95.1  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.45 
 
 		 961 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0729  protein serine/threonine phosphatase  31.85 
 
 		 364 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950002  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.5 
 
 		 1332 aa  89.7  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1306  protein serine/threonine phosphatase  32.67 
 
 		 406 aa  89.4  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  32.14 
 
 		 451 aa  89.4  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1626  protein serine/threonine phosphatase  31.95 
 
 		 412 aa  87.4  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  33.47 
 
 		 376 aa  85.1  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2718  serine phosphatase  28.46 
 
 		 533 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3436  protein serine/threonine phosphatase  33.89 
 
 		 488 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  29.01 
 
 		 1083 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4118  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.49 
 
 		 847 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  33.58 
 
 		 1017 aa  84  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0122  Stage II sporulation E family protein  31.62 
 
 		 428 aa  84  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.671125  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26 
 
 		 486 aa  83.2  0.000000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.646626  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0916  putative PAS/PAC sensor protein  30.89 
 
 		 781 aa  82  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.557683 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1487  stage II sporulation E family protein  33.33 
 
 		 535 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  31.27 
 
 		 846 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.33 
 
 		 1017 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0864  putative PAS/PAC sensor protein  30.45 
 
 		 633 aa  82  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  32.13 
 
 		 591 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.84 
 
 		 957 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  27.1 
 
 		 705 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  31.17 
 
 		 692 aa  80.1  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.38 
 
 		 1051 aa  80.1  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2171  protein serine/threonine phosphatase  31.28 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.529271  hitchhiker  0.000569605 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4712  protein serine/threonine phosphatase  34.8 
 
 		 431 aa  79.7  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4921  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.65 
 
 		 549 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.923256  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5158  serine phosphatase  30.61 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.04 
 
 		 1004 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5247  putative GAF sensor protein  30.61 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  29.48 
 
 		 705 aa  77  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  31.6 
 
 		 467 aa  77  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0442  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.39 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.723738  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2798  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.6 
 
 		 538 aa  77.4  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  30.83 
 
 		 453 aa  77  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  26.88 
 
 		 708 aa  76.6  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2344  response regulator receiver:protein phosphatase 2C-like  30.07 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5539  putative GAF sensor protein  30.61 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0659  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.36 
 
 		 450 aa  75.1  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2410  protein serine/threonine phosphatase  32.03 
 
 		 660 aa  74.7  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.82 
 
 		 579 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0541  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.05 
 
 		 445 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.8 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  29.25 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.67 
 
 		 738 aa  73.9  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  30.61 
 
 		 694 aa  74.3  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  28.17 
 
 		 581 aa  73.6  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3855  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.01 
 
 		 560 aa  73.9  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.574477  normal  0.471316 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  26.12 
 
 		 451 aa  73.6  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  31.3 
 
 		 697 aa  73.6  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1450  hypothetical protein  24.78 
 
 		 472 aa  73.6  0.000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3121  protein serine/threonine phosphatase  32.52 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5396  protein serine/threonine phosphatase  28.71 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5165  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.33 
 
 		 583 aa  73.2  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115407  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4764  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.55 
 
 		 482 aa  73.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0579698  hitchhiker  0.0000553449 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  30.56 
 
 		 693 aa  72.8  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2264  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  29.81 
 
 		 525 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4019  putative PAS/PAC sensor protein  34.02 
 
 		 614 aa  72.4  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6523  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.2 
 
 		 422 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98735  normal  0.0636909 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35020  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  29.64 
 
 		 437 aa  72.8  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3071  protein serine/threonine phosphatase  33.88 
 
 		 260 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136695 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0032  stage II sporulation E family protein  30 
 
 		 365 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3739  response regulator receiver modulated serine phosphatase  33.92 
 
 		 523 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.433453  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  28.97 
 
 		 706 aa  71.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2891  protein serine/threonine phosphatase  27.15 
 
 		 477 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.772324 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  28.77 
 
 		 443 aa  72  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0479  response regulator receiver modulated serine phosphatase  34.31 
 
 		 529 aa  70.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  25 
 
 		 445 aa  70.9  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  28.41 
 
 		 566 aa  70.5  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  24.3 
 
 		 445 aa  70.1  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11395  hypothetical protein  30.85 
 
 		 653 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  30.15 
 
 		 438 aa  69.7  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0844  stage II sporulation E family protein  26.47 
 
 		 454 aa  69.7  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3716  protein serine/threonine phosphatase  26.8 
 
 		 474 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.412464  normal  0.388868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3662  protein serine/threonine phosphatase  26.8 
 
 		 474 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.84 
 
 		 549 aa  69.7  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  29.72 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5033  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.4 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185229  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.16 
 
 		 572 aa  69.3  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>