251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6837 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6837  amidohydrolase 3  100 
 
 		 556 aa  1118    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1796  D-aminoacylase domain-containing protein  43.17 
 
 		 560 aa  442  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897442 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  41.42 
 
 		 560 aa  378  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1735  amidohydrolase 3  33.84 
 
 		 587 aa  298  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2680  amidohydrolase 3  34.62 
 
 		 579 aa  295  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0767  amidohydrolase 3  34.6 
 
 		 575 aa  294  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1738  amidohydrolase 3  34.61 
 
 		 580 aa  294  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.363684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0312  amidohydrolase 3  34.56 
 
 		 578 aa  288  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0136  amidohydrolase 3  34.9 
 
 		 574 aa  286  5.999999999999999e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0609  amidohydrolase 3  34.79 
 
 		 573 aa  286  8e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0622  amidohydrolase 3  34.79 
 
 		 573 aa  286  8e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0600  amidohydrolase 3  34.79 
 
 		 573 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2023  amidohydrolase 3  33.22 
 
 		 579 aa  280  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.730117 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5309  amidohydrolase 3  33.45 
 
 		 586 aa  279  9e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5398  amidohydrolase 3  33.45 
 
 		 586 aa  279  9e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.32221 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5688  amidohydrolase 3  33.45 
 
 		 586 aa  279  9e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.496605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3345  amidohydrolase 3  34.77 
 
 		 588 aa  278  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.783036 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0882  amidohydrolase 3  32.37 
 
 		 579 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5252  hypothetical protein  33.72 
 
 		 569 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7586  dihydroorotase  32.93 
 
 		 581 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  33.68 
 
 		 577 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6853  amidohydrolase 3  33.91 
 
 		 567 aa  266  5.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1432  hypothetical protein  32.52 
 
 		 582 aa  265  1e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0688  dihydroorotase  33.1 
 
 		 572 aa  262  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3646  amidohydrolase 3  32.81 
 
 		 589 aa  261  3e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668872  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3088  dihydroorotase  32.36 
 
 		 570 aa  260  4e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0576  amidohydrolase 3  31.14 
 
 		 578 aa  260  6e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1022  amidohydrolase 3  33.33 
 
 		 578 aa  257  5e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2152  amidohydrolase 3  32.64 
 
 		 581 aa  256  8e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3037  amidohydrolase 3  32.65 
 
 		 587 aa  254  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1641  amidohydrolase 3  31.12 
 
 		 590 aa  251  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0757893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3315  amidohydrolase 3  31.79 
 
 		 586 aa  250  4e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0820115 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0561  amidohydrolase 3  31.12 
 
 		 583 aa  247  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2013  dihydroorotase  32.57 
 
 		 566 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3590  dihydroorotase  30.47 
 
 		 574 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2206  Amidohydrolase 3  31.55 
 
 		 601 aa  238  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0568335 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2087  amidohydrolase 3  34.05 
 
 		 577 aa  236  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3369  amidohydrolase 3  31.48 
 
 		 582 aa  211  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559487  normal  0.377193 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3631  amidohydrolase 3  30.22 
 
 		 580 aa  202  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  26.96 
 
 		 534 aa  174  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.45 
 
 		 533 aa  174  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.26 
 
 		 532 aa  164  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1032  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.24 
 
 		 545 aa  164  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.396344 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2782  hypothetical protein  29.37 
 
 		 598 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3035  hypothetical protein  30.32 
 
 		 604 aa  160  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2752  hypothetical protein  29.04 
 
 		 598 aa  160  7e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0310233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2796  hypothetical protein  29.04 
 
 		 598 aa  160  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282284  normal  0.995463 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.28 
 
 		 529 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0978  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.93 
 
 		 488 aa  159  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3978  N-acyl-D-glutamate deacylase  28.97 
 
 		 534 aa  159  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12927  D-amino acid aminohydrolase  29.4 
 
 		 611 aa  155  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.185758 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3006  Amidohydrolase 3  29.17 
 
 		 533 aa  154  5e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0720  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.92 
 
 		 547 aa  154  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.066305 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1019  hypothetical protein  29.68 
 
 		 587 aa  152  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  26.87 
 
 		 533 aa  148  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2958  N-acyl-D-amino-acid deacylase  24.78 
 
 		 528 aa  147  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1417  dihydroorotase  28.74 
 
 		 558 aa  147  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0420  hypothetical protein  27.03 
 
 		 579 aa  145  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3836  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase  28.21 
 
 		 1076 aa  144  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5481  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.34 
 
 		 529 aa  144  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1467  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.56 
 
 		 565 aa  139  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  27.62 
 
 		 530 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  41.03 
 
 		 491 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1290  N-acyl-D-glutamate amidohydrolase  29.08 
 
 		 584 aa  135  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.333923  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1501  N-acyl-D-glutamate deacylase  24.71 
 
 		 487 aa  133  6.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0075  hypothetical protein  29.05 
 
 		 700 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.319032  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0091  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.73 
 
 		 499 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.64957  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1578  hypothetical protein  28.98 
 
 		 584 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211733  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1493  hypothetical protein  28.98 
 
 		 584 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154211  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1042  hypothetical protein  28.84 
 
 		 588 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1199  hypothetical protein  28.84 
 
 		 588 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202231  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4772  D-aminoacylase  35.22 
 
 		 487 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911342  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0385  hypothetical protein  28.84 
 
 		 699 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  40.51 
 
 		 486 aa  130  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4020  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.22 
 
 		 487 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1552  N-acyl-D-glutamate deacylase  27.05 
 
 		 507 aa  128  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  40.21 
 
 		 494 aa  127  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5490  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.53 
 
 		 532 aa  127  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2753  Amidohydrolase 3  24.91 
 
 		 530 aa  127  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1900  D-aminoacylase domain-containing protein  25.32 
 
 		 589 aa  125  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0350811  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4816  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.44 
 
 		 484 aa  125  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4959  N-acyl-D-amino-acid deacylase  40 
 
 		 478 aa  125  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.555934 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  35.37 
 
 		 485 aa  124  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  40.72 
 
 		 493 aa  124  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5254  N-acyl-D-amino-acid deacylase  39.57 
 
 		 478 aa  124  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  39.3 
 
 		 477 aa  123  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0310888  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3337  N-acyl-D-amino-acid deacylase  39.57 
 
 		 478 aa  123  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5030  N-acyl-D-amino-acid deacylase  39.57 
 
 		 478 aa  123  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.29 
 
 		 511 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  0.0756976 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1348  hypothetical protein  25.96 
 
 		 629 aa  120  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3947  N-acyl-D-glutamate deacylase  26.01 
 
 		 546 aa  120  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  37.88 
 
 		 486 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5117  N-acyl-D-amino acid deacylase family protein  34.93 
 
 		 504 aa  120  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  38.7 
 
 		 478 aa  120  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.602072  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0415  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.37 
 
 		 491 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06353  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  33.04 
 
 		 481 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0641  N-acyl-D-amino-acid deacylase  38.14 
 
 		 493 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0837  D-aminoacylase  35.65 
 
 		 493 aa  115  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0658  N-acyl-D-aspartate deacylase  35.65 
 
 		 493 aa  115  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0674  N-acyl-D-aspartate deacylase  35.65 
 
 		 493 aa  115  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>