More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4100 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4100  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  457  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  44.91 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2185  transcriptional regulator, IclR family  41.44 
 
 		 259 aa  129  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1725  IclR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 279 aa  122  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200124  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 264 aa  122  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  40.45 
 
 		 270 aa  122  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0559  regulatory proteins, IclR  35.14 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3545  transcriptional regulator, IclR family  40 
 
 		 254 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0480157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1675  regulatory proteins, IclR  35.65 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1725  regulatory proteins, IclR  35.65 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.581067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1741  regulatory proteins, IclR  35.65 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2456  transcriptional regulator, IclR family  39.09 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248538  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  38.17 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15210  transcriptional regulator  43.35 
 
 		 257 aa  108  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  39.8 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0434  transcriptional regulator, IclR family  35.35 
 
 		 284 aa  106  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0531  regulatory protein, IclR  35.86 
 
 		 215 aa  105  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 258 aa  102  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  40.83 
 
 		 253 aa  101  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  36.91 
 
 		 266 aa  99.8  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  36.91 
 
 		 266 aa  99.8  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 249 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 249 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2824  transcriptional regulator, IclR family  36 
 
 		 260 aa  95.9  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00611258  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4896  transcriptional regulator, IclR family  37.56 
 
 		 256 aa  95.9  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3424  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 		 272 aa  95.5  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  39.71 
 
 		 264 aa  95.5  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  34.74 
 
 		 246 aa  95.1  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2285  transcriptional regulator  32.49 
 
 		 261 aa  92  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1652  IclR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 267 aa  87.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0306  IclR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 324 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.963545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 272 aa  86.3  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 267 aa  86.3  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0315  IclR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 308 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535373  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0325  IclR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 286 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058841  normal  0.452901 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  33.19 
 
 		 267 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  31.69 
 
 		 294 aa  85.5  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  32.82 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  27.6 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  32.26 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  26.83 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  31.63 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  36.11 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4529  IclR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143169 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  30.61 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4083  transcriptional regulator, IclR family  35.35 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4551  regulatory protein, IclR  35.19 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  33.8 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2006  IclR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3586  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.16 
 
 		 569 aa  79  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6222  IclR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 269 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 269 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1495  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2223  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  29.5 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3857  transcriptional regulator, IclR family  31.69 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0697  IclR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.734635  decreased coverage  0.00216711 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  28.22 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  30.1 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  24.89 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  33.03 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2606  IclR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339666  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1869  IclR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32806  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  30.1 
 
 		 277 aa  75.5  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4081  IclR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 291 aa  75.1  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  30.49 
 
 		 248 aa  75.1  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4376  transcriptional regulator, IclR family  31.84 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  31.36 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  31.28 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3839  transcriptional regulator, IclR family  34.44 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3479  regulatory proteins, IclR  30.54 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0476526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  26.87 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  29.5 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  29.55 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5946  IclR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3928  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  33.63 
 
 		 290 aa  72  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  31.19 
 
 		 264 aa  72  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3482  IclR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>