More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3729 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  60.19 
 
 		 731 aa  786    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  49.86 
 
 		 728 aa  647    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  55.48 
 
 		 832 aa  714    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  58.49 
 
 		 734 aa  771    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  53.97 
 
 		 755 aa  671    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  99.46 
 
 		 734 aa  1413    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  100 
 
 		 793 aa  1554    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  51.61 
 
 		 737 aa  635  1e-180  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  52.39 
 
 		 723 aa  623  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  51.44 
 
 		 724 aa  595  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  48.37 
 
 		 735 aa  579  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  47.28 
 
 		 735 aa  557  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  44.01 
 
 		 787 aa  540  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  48.39 
 
 		 734 aa  536  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  42.74 
 
 		 742 aa  525  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  42.49 
 
 		 779 aa  522  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  46.88 
 
 		 729 aa  521  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  44.52 
 
 		 732 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  41.65 
 
 		 772 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  41.65 
 
 		 772 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  41.65 
 
 		 772 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  42.23 
 
 		 779 aa  506  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  44.37 
 
 		 917 aa  491  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  42.18 
 
 		 909 aa  487  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  40.71 
 
 		 920 aa  484  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  43.95 
 
 		 1002 aa  477  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  47.66 
 
 		 726 aa  468  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  44.65 
 
 		 1058 aa  464  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  33.24 
 
 		 829 aa  457  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  33.24 
 
 		 829 aa  457  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.02 
 
 		 1382 aa  447  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  42.9 
 
 		 854 aa  445  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  34.86 
 
 		 893 aa  442  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  43.12 
 
 		 903 aa  442  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  39.97 
 
 		 842 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  38.96 
 
 		 743 aa  440  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  44.67 
 
 		 732 aa  439  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  40.39 
 
 		 746 aa  437  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  44.4 
 
 		 738 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  39.97 
 
 		 784 aa  431  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  37.71 
 
 		 735 aa  426  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  40.77 
 
 		 732 aa  429  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  38.58 
 
 		 729 aa  424  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  43.51 
 
 		 843 aa  423  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  39.64 
 
 		 717 aa  424  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  38.29 
 
 		 735 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  40.57 
 
 		 787 aa  416  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  35.59 
 
 		 704 aa  415  1e-114  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  39.03 
 
 		 791 aa  413  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  42.05 
 
 		 807 aa  415  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  35.94 
 
 		 760 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  44.08 
 
 		 840 aa  412  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  40.6 
 
 		 752 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  43.02 
 
 		 958 aa  403  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  42.24 
 
 		 903 aa  399  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  40.62 
 
 		 737 aa  400  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  39.42 
 
 		 758 aa  398  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0755  MMPL domain protein  46.86 
 
 		 726 aa  399  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383711  hitchhiker  0.00656683 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  39.64 
 
 		 726 aa  397  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  39.13 
 
 		 876 aa  396  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  41.79 
 
 		 1092 aa  394  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  38.3 
 
 		 718 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  37.7 
 
 		 723 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  40.24 
 
 		 751 aa  382  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  37.13 
 
 		 737 aa  378  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1680  putative membrane transport protein  37.97 
 
 		 836 aa  362  1e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.507173  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  38.64 
 
 		 711 aa  359  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  36.1 
 
 		 749 aa  353  5e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  34.24 
 
 		 781 aa  347  6e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  38.12 
 
 		 715 aa  343  8e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  38.63 
 
 		 761 aa  343  9e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  35.3 
 
 		 740 aa  339  9.999999999999999e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  39.94 
 
 		 724 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  36.11 
 
 		 750 aa  333  8e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  38.48 
 
 		 743 aa  325  3e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  36.35 
 
 		 714 aa  320  9e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  35.87 
 
 		 968 aa  295  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  34.12 
 
 		 979 aa  294  3e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  34.3 
 
 		 983 aa  293  6e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  34.3 
 
 		 983 aa  293  6e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  35.66 
 
 		 978 aa  291  4e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5635  MMPL domain protein  34.83 
 
 		 734 aa  278  3e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.593241 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  32.26 
 
 		 966 aa  273  7e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  31.99 
 
 		 743 aa  271  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  32.07 
 
 		 770 aa  263  8e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  37.99 
 
 		 743 aa  254  5.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  29.76 
 
 		 741 aa  253  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  31.28 
 
 		 733 aa  252  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  29.09 
 
 		 758 aa  249  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.84 
 
 		 738 aa  246  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  32.62 
 
 		 717 aa  242  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  31.6 
 
 		 846 aa  241  4e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  29.93 
 
 		 766 aa  241  5.999999999999999e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  30.11 
 
 		 740 aa  238  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6982  MMPL domain protein  33.45 
 
 		 794 aa  237  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7430  MMPL domain protein  31.42 
 
 		 744 aa  237  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484594  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  31 
 
 		 736 aa  236  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0955  integral membrane protein  34.5 
 
 		 709 aa  235  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778456  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  25.6 
 
 		 730 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  25.17 
 
 		 730 aa  233  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>