More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3392 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  59 
 
 		 734 aa  741    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  99.46 
 
 		 793 aa  1413    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  55.52 
 
 		 832 aa  687    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  100 
 
 		 734 aa  1420    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  54.44 
 
 		 755 aa  642    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  60.98 
 
 		 731 aa  771    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  52.12 
 
 		 723 aa  618  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  49.22 
 
 		 728 aa  614  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  52.21 
 
 		 737 aa  608  9.999999999999999e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  51.53 
 
 		 724 aa  575  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  48.21 
 
 		 735 aa  550  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  47.35 
 
 		 735 aa  530  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  44.07 
 
 		 787 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  48.54 
 
 		 734 aa  513  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  47.35 
 
 		 729 aa  509  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  43.24 
 
 		 742 aa  501  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  42.71 
 
 		 779 aa  500  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  44.08 
 
 		 732 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  42.11 
 
 		 772 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  42.11 
 
 		 772 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  42.11 
 
 		 772 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  43.74 
 
 		 917 aa  478  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  41.78 
 
 		 779 aa  475  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  43.08 
 
 		 909 aa  474  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  40.99 
 
 		 920 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  48.09 
 
 		 726 aa  464  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  44.51 
 
 		 1002 aa  456  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  34.35 
 
 		 829 aa  447  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  34.35 
 
 		 829 aa  447  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  43.28 
 
 		 903 aa  443  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  42.9 
 
 		 854 aa  443  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  44.32 
 
 		 1058 aa  441  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  35.53 
 
 		 893 aa  432  1e-120  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  41.38 
 
 		 842 aa  434  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  42.17 
 
 		 732 aa  429  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.03 
 
 		 1382 aa  424  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  38.44 
 
 		 729 aa  423  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  43.51 
 
 		 843 aa  424  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  40.19 
 
 		 784 aa  425  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  38.06 
 
 		 735 aa  421  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  44.89 
 
 		 732 aa  417  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  44.08 
 
 		 840 aa  412  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  39.94 
 
 		 717 aa  412  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  38.46 
 
 		 743 aa  414  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  40.21 
 
 		 746 aa  411  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  44.28 
 
 		 738 aa  412  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  35.95 
 
 		 704 aa  409  1e-113  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  39.34 
 
 		 735 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  42.86 
 
 		 958 aa  403  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  42.18 
 
 		 807 aa  402  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  44.71 
 
 		 787 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  38.92 
 
 		 791 aa  400  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  36.79 
 
 		 760 aa  402  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  42.24 
 
 		 903 aa  400  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  41.79 
 
 		 1092 aa  395  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  41.07 
 
 		 752 aa  392  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0755  MMPL domain protein  47.1 
 
 		 726 aa  390  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383711  hitchhiker  0.00656683 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  41.01 
 
 		 737 aa  387  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  39.24 
 
 		 876 aa  385  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  38.47 
 
 		 723 aa  382  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  39.83 
 
 		 726 aa  381  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  40.51 
 
 		 751 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  39.48 
 
 		 758 aa  378  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  38.36 
 
 		 718 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  37.92 
 
 		 737 aa  369  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1680  putative membrane transport protein  37.97 
 
 		 836 aa  363  6e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.507173  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  36.48 
 
 		 749 aa  351  3e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  39.11 
 
 		 711 aa  347  5e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  34.13 
 
 		 781 aa  344  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  38.78 
 
 		 715 aa  343  5.999999999999999e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  38.63 
 
 		 761 aa  343  8e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  39.94 
 
 		 724 aa  339  9.999999999999999e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  35.42 
 
 		 740 aa  329  9e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  36.34 
 
 		 750 aa  320  7.999999999999999e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  38.8 
 
 		 743 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  37.05 
 
 		 714 aa  313  1e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  35.87 
 
 		 968 aa  295  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  34.12 
 
 		 979 aa  294  5e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  34.3 
 
 		 983 aa  293  8e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  34.3 
 
 		 983 aa  293  8e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  35.66 
 
 		 978 aa  291  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5635  MMPL domain protein  34.83 
 
 		 734 aa  278  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.593241 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  32.77 
 
 		 966 aa  272  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  31.79 
 
 		 770 aa  261  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  32.54 
 
 		 743 aa  260  7e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  37.99 
 
 		 743 aa  254  4.0000000000000004e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  29.76 
 
 		 741 aa  251  3e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  29.23 
 
 		 758 aa  248  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  31.38 
 
 		 733 aa  241  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.33 
 
 		 738 aa  242  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6982  MMPL domain protein  34.18 
 
 		 794 aa  237  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  31.14 
 
 		 736 aa  237  6e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  32.68 
 
 		 717 aa  236  9e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0955  integral membrane protein  34.6 
 
 		 709 aa  236  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  32.7 
 
 		 846 aa  236  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  29.99 
 
 		 740 aa  233  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0204  MMPL domain protein  43.51 
 
 		 776 aa  233  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  25.03 
 
 		 730 aa  232  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7430  MMPL domain protein  31.54 
 
 		 744 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  31.46 
 
 		 745 aa  230  6e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>