270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3195 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01586  beta-D-glucuronidase  54.35 
 
 		 603 aa  643    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  54.68 
 
 		 603 aa  644    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  54.68 
 
 		 603 aa  645    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  67.34 
 
 		 598 aa  803    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01576  hypothetical protein  54.35 
 
 		 603 aa  643    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3313  beta-D-glucuronidase  55.7 
 
 		 603 aa  661    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  54.52 
 
 		 603 aa  644    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  54.52 
 
 		 603 aa  645    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.73903 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  100 
 
 		 590 aa  1198    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1692  beta-D-glucuronidase  54.52 
 
 		 603 aa  644    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  54.68 
 
 		 603 aa  644    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  51.59 
 
 		 644 aa  619  1e-176  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  43.51 
 
 		 601 aa  517  1.0000000000000001e-145  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  43.87 
 
 		 577 aa  507  9.999999999999999e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1670  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  43.33 
 
 		 598 aa  483  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2086  Beta-glucuronidase  47.94 
 
 		 512 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000473091  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0698  beta-D-glucuronidase  40.3 
 
 		 599 aa  457  1e-127  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  40.86 
 
 		 596 aa  456  1e-127  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1310  Beta-glucuronidase  41.39 
 
 		 588 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  35.71 
 
 		 564 aa  340  5e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  35.71 
 
 		 563 aa  340  5.9999999999999996e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  35.17 
 
 		 558 aa  302  1e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0530  Beta-galactosidase  26.22 
 
 		 591 aa  202  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  30.98 
 
 		 568 aa  196  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  30.94 
 
 		 604 aa  196  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  26.87 
 
 		 600 aa  190  7e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  28.62 
 
 		 603 aa  188  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  27.42 
 
 		 597 aa  187  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  28.49 
 
 		 587 aa  182  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  27.82 
 
 		 686 aa  176  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  28.6 
 
 		 738 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  25.04 
 
 		 598 aa  176  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2447  Beta-galactosidase  27.99 
 
 		 677 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  29.97 
 
 		 888 aa  171  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  27.15 
 
 		 607 aa  171  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0829  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  46.93 
 
 		 188 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  27.54 
 
 		 894 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  28.11 
 
 		 897 aa  164  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  29.96 
 
 		 670 aa  162  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  26.43 
 
 		 625 aa  159  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  28.9 
 
 		 707 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.28 
 
 		 858 aa  159  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  27.4 
 
 		 743 aa  157  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  28.82 
 
 		 717 aa  157  6e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  29.94 
 
 		 889 aa  155  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1086  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  26.95 
 
 		 614 aa  154  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.358579 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2878  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.84 
 
 		 614 aa  152  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832134 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  25.22 
 
 		 803 aa  150  6e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0729  beta-galactosidase  30.25 
 
 		 1023 aa  150  9e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0768617  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  24.49 
 
 		 862 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  27.61 
 
 		 785 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  28.73 
 
 		 704 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  30.18 
 
 		 832 aa  146  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  24.77 
 
 		 1043 aa  145  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  27.97 
 
 		 754 aa  144  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  24.44 
 
 		 848 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  28.27 
 
 		 1084 aa  141  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.66 
 
 		 747 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.15 
 
 		 748 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07790  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  29.25 
 
 		 651 aa  140  8.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.883217  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.23 
 
 		 1424 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  27.46 
 
 		 1035 aa  139  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  27.73 
 
 		 1084 aa  139  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  25.59 
 
 		 1019 aa  139  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14320  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  29.39 
 
 		 992 aa  139  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  28.82 
 
 		 1076 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  23.42 
 
 		 928 aa  137  5e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  26.4 
 
 		 1020 aa  137  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  27.77 
 
 		 781 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  29.49 
 
 		 815 aa  136  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.93 
 
 		 781 aa  137  8e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.14 
 
 		 1033 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  25.9 
 
 		 972 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  28.33 
 
 		 1077 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  24.94 
 
 		 1035 aa  135  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  27.56 
 
 		 923 aa  134  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  25.88 
 
 		 1017 aa  133  7.999999999999999e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  26.03 
 
 		 1043 aa  133  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  24.4 
 
 		 1129 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4911  Beta-galactosidase  29.12 
 
 		 1003 aa  132  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114803  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  24.96 
 
 		 1028 aa  130  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000620353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  27.34 
 
 		 1059 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26640  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  28.78 
 
 		 996 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  25.38 
 
 		 750 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0920  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.55 
 
 		 1005 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0700596  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2021  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.15 
 
 		 640 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  25.78 
 
 		 824 aa  128  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  28.38 
 
 		 575 aa  126  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2461  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  26.94 
 
 		 929 aa  125  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  27.57 
 
 		 1045 aa  124  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.91 
 
 		 1041 aa  124  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.38 
 
 		 805 aa  124  4e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.38 
 
 		 986 aa  124  6e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  23.89 
 
 		 1015 aa  124  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3173  beta-D-galactosidase  24.28 
 
 		 1029 aa  124  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00462554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3909  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.22 
 
 		 1600 aa  123  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  27.9 
 
 		 1063 aa  123  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.29 
 
 		 1013 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  23.54 
 
 		 1024 aa  123  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3466  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.26 
 
 		 968 aa  123  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.52907  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>