189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2732 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2732  recombinase  100 
 
 		 583 aa  1192    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2537  recombinase  61.69 
 
 		 556 aa  669    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4097  Recombinase  58.53 
 
 		 575 aa  610  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667971  normal  0.110676 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2909  recombinase  55.82 
 
 		 465 aa  500  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3165  recombinase  48.53 
 
 		 548 aa  488  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.944901  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3227  recombinase  48.53 
 
 		 548 aa  488  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.371696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3177  recombinase  48.53 
 
 		 548 aa  488  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.560591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3036  recombinase  47.13 
 
 		 548 aa  479  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3888  Recombinase  45.14 
 
 		 488 aa  311  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489882  normal  0.0312397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3861  Recombinase  41.48 
 
 		 409 aa  249  9e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3094  recombinase  41.4 
 
 		 386 aa  236  6e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5207  Resolvase domain protein  29.47 
 
 		 598 aa  174  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.914138 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0612  recombinase  28.92 
 
 		 656 aa  127  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2029  hypothetical protein  79.71 
 
 		 148 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.775035  normal  0.520928 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2656  hypothetical protein  31.78 
 
 		 331 aa  97.1  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000700215  hitchhiker  0.000699508 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  29.51 
 
 		 532 aa  88.6  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  26.93 
 
 		 510 aa  87.8  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  23.2 
 
 		 519 aa  85.1  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  23.19 
 
 		 522 aa  84.7  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  22.89 
 
 		 558 aa  84.3  0.000000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  25.3 
 
 		 517 aa  83.6  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  24.21 
 
 		 541 aa  83.6  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  26.54 
 
 		 506 aa  82.8  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  25.24 
 
 		 561 aa  81.3  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  30.45 
 
 		 540 aa  80.9  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  23.1 
 
 		 521 aa  80.9  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  21.57 
 
 		 522 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  24.8 
 
 		 526 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  23.33 
 
 		 520 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2661  hypothetical protein  36.89 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0202232  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  26.52 
 
 		 561 aa  76.6  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  27.25 
 
 		 541 aa  75.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  24.16 
 
 		 498 aa  75.9  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  26.48 
 
 		 555 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  25.61 
 
 		 580 aa  74.7  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  23.8 
 
 		 494 aa  74.3  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  23.5 
 
 		 543 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  26.23 
 
 		 547 aa  73.6  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  23.26 
 
 		 548 aa  72.4  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  21.28 
 
 		 485 aa  72.4  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  25.88 
 
 		 562 aa  72  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  24.17 
 
 		 484 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1541  recombinase  33.7 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.343961  normal  0.0432678 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  24.38 
 
 		 484 aa  70.5  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  24.57 
 
 		 509 aa  70.5  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  27.12 
 
 		 525 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  27.3 
 
 		 537 aa  68.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  25.42 
 
 		 565 aa  69.3  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  27.22 
 
 		 525 aa  68.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  27.42 
 
 		 569 aa  69.3  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  24 
 
 		 540 aa  68.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  27.81 
 
 		 576 aa  68.2  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  22.93 
 
 		 519 aa  67.8  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  26.03 
 
 		 552 aa  67.4  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  23.14 
 
 		 524 aa  67  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1974  Resolvase domain protein  28.01 
 
 		 503 aa  66.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0665076  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4607  DNA recombinase, putative  26.09 
 
 		 526 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  25.93 
 
 		 535 aa  66.6  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4586  DNA recombinase, putative  26.09 
 
 		 532 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  30.41 
 
 		 563 aa  65.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  26.74 
 
 		 549 aa  65.5  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  27.85 
 
 		 522 aa  65.1  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  26.58 
 
 		 551 aa  65.5  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  25.62 
 
 		 516 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  26.53 
 
 		 662 aa  63.9  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  24.4 
 
 		 518 aa  63.2  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  24.54 
 
 		 613 aa  63.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  25.2 
 
 		 505 aa  63.2  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  25.62 
 
 		 516 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  25.83 
 
 		 522 aa  62.4  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  21.63 
 
 		 553 aa  62.4  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  24.22 
 
 		 515 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  23.94 
 
 		 462 aa  62  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  25.39 
 
 		 554 aa  61.2  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  26.98 
 
 		 549 aa  61.6  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  25.39 
 
 		 542 aa  60.8  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  25.21 
 
 		 578 aa  60.8  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  25.21 
 
 		 601 aa  60.5  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  25.41 
 
 		 584 aa  60.5  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  27.85 
 
 		 523 aa  60.1  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4417  recombinase  24.75 
 
 		 517 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  25.33 
 
 		 534 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  24.86 
 
 		 590 aa  59.3  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  27.57 
 
 		 515 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  24.9 
 
 		 551 aa  59.3  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  27.85 
 
 		 523 aa  58.5  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  25.34 
 
 		 534 aa  58.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  30.94 
 
 		 558 aa  58.2  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  23.26 
 
 		 479 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  25.07 
 
 		 534 aa  58.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  25.46 
 
 		 537 aa  58.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  28.92 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  24.53 
 
 		 534 aa  58.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  25.16 
 
 		 546 aa  57.8  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  23.53 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  24.47 
 
 		 465 aa  57.8  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  25.07 
 
 		 534 aa  57.4  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  31.97 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  25.51 
 
 		 586 aa  57.4  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2129  hypothetical protein  72.73 
 
 		 106 aa  56.6  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>