More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0135 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0135  ribonuclease  100 
 
 		 463 aa  931    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1764  ribonuclease  46.37 
 
 		 465 aa  410  1e-113  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1186  ribonuclease  43.14 
 
 		 454 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00382378  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1269  ribonuclease  42.29 
 
 		 459 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.373877  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1450  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.28 
 
 		 471 aa  285  1.0000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.107409  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  35.14 
 
 		 562 aa  282  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1614  ribonuclease E and G  36.4 
 
 		 476 aa  280  4e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0133634  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  35.68 
 
 		 487 aa  277  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  37.16 
 
 		 564 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  34.37 
 
 		 489 aa  262  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  34.37 
 
 		 489 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  34.37 
 
 		 489 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  34.72 
 
 		 483 aa  261  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  37.41 
 
 		 559 aa  259  6e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  33.97 
 
 		 492 aa  258  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4556  ribonuclease G  35.75 
 
 		 485 aa  255  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  33.41 
 
 		 483 aa  254  3e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  33.97 
 
 		 492 aa  253  6e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  34.61 
 
 		 494 aa  252  8.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00268  ribonuclease G  33.94 
 
 		 488 aa  248  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  34.16 
 
 		 489 aa  248  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002387  cytoplasmic axial filament protein CafA and Ribonuclease G  34.91 
 
 		 489 aa  246  4.9999999999999997e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  34.58 
 
 		 530 aa  246  4.9999999999999997e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  33.78 
 
 		 489 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2121  ribonuclease  40.05 
 
 		 474 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000296404  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  36.82 
 
 		 571 aa  244  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1281  ribonuclease E and G  33.95 
 
 		 687 aa  244  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000695712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1593  ribonuclease  34.86 
 
 		 605 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.435522  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  33.98 
 
 		 922 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  31.08 
 
 		 497 aa  243  6e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  31.08 
 
 		 497 aa  243  7e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0578  ribonuclease G  34.39 
 
 		 502 aa  243  7e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.4987  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0483  ribonuclease G  34.01 
 
 		 488 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.605278 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1735  ribonuclease  32.59 
 
 		 499 aa  243  7.999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  34.23 
 
 		 908 aa  242  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  30.39 
 
 		 543 aa  241  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  33.74 
 
 		 1427 aa  241  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4094  ribonuclease G  34.01 
 
 		 488 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0487  ribonuclease G  35.97 
 
 		 489 aa  241  2.9999999999999997e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0311265  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3404  ribonuclease, Rne/Rng family  35.01 
 
 		 669 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  34.9 
 
 		 1194 aa  240  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  35.11 
 
 		 496 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1502  ribonuclease, Rne/Rng family  34.05 
 
 		 1080 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.69502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0487  RNAse G  30.75 
 
 		 528 aa  240  5e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.258598  normal  0.0128564 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3468  ribonuclease G  33.78 
 
 		 502 aa  239  5e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.893805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3644  ribonuclease G  33.78 
 
 		 502 aa  239  5e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  34.36 
 
 		 531 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1200  ribonuclease, Rne/Rng family  33.33 
 
 		 496 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  35.11 
 
 		 496 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  34.89 
 
 		 411 aa  239  8e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0313  RNAse E  35.05 
 
 		 646 aa  239  9e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  34.06 
 
 		 990 aa  239  9e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0668  ribonuclease, Rne/Rng family  33.72 
 
 		 713 aa  238  1e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  34.66 
 
 		 1007 aa  238  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  34.24 
 
 		 1041 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17041  ribonuclease E/G  34.1 
 
 		 606 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.925066  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3527  ribonuclease  31.82 
 
 		 515 aa  238  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255196  normal  0.0164409 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  34.72 
 
 		 503 aa  238  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1719  ribonuclease, Rne/Rng family  31.7 
 
 		 495 aa  238  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  33.26 
 
 		 503 aa  238  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  34.79 
 
 		 1334 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2082  ribonuclease  31.38 
 
 		 491 aa  238  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0471  ribonuclease G  34.46 
 
 		 502 aa  238  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  32.3 
 
 		 490 aa  237  3e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0878  ribonuclease  34.41 
 
 		 808 aa  237  3e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1186  ribonuclease, Rne/Rng family  32.18 
 
 		 974 aa  237  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16241  ribonuclease E/G  37.87 
 
 		 624 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1914  ribonuclease G  31.7 
 
 		 495 aa  237  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3482  ribonuclease  32.78 
 
 		 1024 aa  237  4e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16921  ribonuclease E/G  33.84 
 
 		 602 aa  237  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.987709  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0482  ribonuclease  30.97 
 
 		 528 aa  237  4e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000399886  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1064  ribonuclease, Rne/Rng family  34.22 
 
 		 653 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1093  ribonuclease, Rne/Rng family  34.22 
 
 		 653 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0501  ribonuclease G  33.78 
 
 		 502 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.188021  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23721  ribonuclease E/G  34.78 
 
 		 647 aa  236  9e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  33.49 
 
 		 515 aa  235  1.0000000000000001e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0522  ribonuclease G  33.78 
 
 		 488 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.440198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3861  ribonuclease  32.3 
 
 		 1058 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688294 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2137  ribonuclease  32.79 
 
 		 482 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3818  ribonuclease G  33.78 
 
 		 502 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0526  ribonuclease G  33.78 
 
 		 488 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0293  ribonuclease  34.75 
 
 		 525 aa  235  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806151 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3330  ribonuclease G  34.68 
 
 		 496 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2233  ribonuclease E  35.42 
 
 		 1015 aa  235  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.893079  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  32.3 
 
 		 496 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2029  ribonuclease E and G  34.69 
 
 		 646 aa  234  3e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3750  ribonuclease G  34.23 
 
 		 502 aa  234  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.580214  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1282  ribonuclease E  34.92 
 
 		 1068 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783205  hitchhiker  0.0000048225 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1297  ribonuclease E  34.92 
 
 		 1067 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148033 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0715  ribonuclease E  34.7 
 
 		 942 aa  233  6e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.32082  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2003  ribonuclease E  34.92 
 
 		 1067 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000122213  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1253  ribonuclease E  34.92 
 
 		 1067 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.16743 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01080  fused ribonucleaseE: endoribonuclease/RNA-binding protein/RNA degradosome binding protein  34.92 
 
 		 1061 aa  233  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00444981  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1898  ribonuclease E  35.15 
 
 		 1122 aa  233  7.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000446531  hitchhiker  0.000483574 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2562  ribonuclease, Rne/Rng family  34.92 
 
 		 1061 aa  233  7.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000807422  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2187  ribonuclease E  34.92 
 
 		 1068 aa  233  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.33181  hitchhiker  0.00000000773492 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01088  hypothetical protein  34.92 
 
 		 1061 aa  233  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00236445  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2516  ribonuclease E  34.92 
 
 		 1061 aa  233  7.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000196842  hitchhiker  0.0002174 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1207  ribonuclease E  34.92 
 
 		 1061 aa  233  8.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1207  ribonuclease E  34.92 
 
 		 1061 aa  233  8.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>