101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3737 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3737  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 135 aa  275  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107824  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4006  cupin 2 domain-containing protein  77.06 
 
 		 137 aa  188  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.52 
 
 		 132 aa  163  6.9999999999999995e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  53.72 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3906  cupin 2 domain-containing protein  55.64 
 
 		 133 aa  139  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000227782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.17 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  54.21 
 
 		 141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.77 
 
 		 128 aa  124  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  51.3 
 
 		 133 aa  120  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3695  cupin region  42.37 
 
 		 127 aa  88.6  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1767  cupin 2, barrel  40.91 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0773162  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1605  cupin 2, barrel  38.98 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4530  cupin 2 domain-containing protein  36.76 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.812738  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1779  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.78 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.35 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0766179  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2205  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.58 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5386  hypothetical protein  45.19 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272839  normal  0.670212 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0116  cupin 2 domain-containing protein  32 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4123  hypothetical protein  36.36 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.685288  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  31.45 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0348  hypothetical protein  30.34 
 
 		 135 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5346  cupin 2 domain-containing protein  29.03 
 
 		 171 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870556 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4505  cupin 2 domain-containing protein  40.54 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  28.35 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4181  cupin 2, barrel  30.77 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4247  cupin 2 domain-containing protein  30.77 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4403  cupin 2 domain-containing protein  30.77 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707936  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03510  hypothetical protein  28.89 
 
 		 135 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866507  hitchhiker  0.00000000000000348857 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1503  cupin 2 domain-containing protein  28.69 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  50 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2102  cupin 2 domain-containing protein  39.19 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0865  cupin 2 domain-containing protein  50 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2285  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.03 
 
 		 173 aa  47.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5056  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.03 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0370159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5435  hypothetical protein  34.25 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.534413  normal  0.706923 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3204  cupin region  28.92 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134576 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0365  AraC family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 261 aa  45.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0791032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1863  cupin 2 domain-containing protein  42.37 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.524548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0588  cupin 2 domain-containing protein  28.03 
 
 		 173 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00966189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1460  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0253836 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1526  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 261 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.14 
 
 		 192 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1417  AraC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 261 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17982  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  31.18 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5062  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.25 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2711  hypothetical protein  28.92 
 
 		 170 aa  43.5  0.0009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1396  cupin 2 domain-containing protein  37.29 
 
 		 102 aa  43.5  0.0009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1426  hypothetical protein  27.07 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416507  normal  0.349881 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0735  cupin 2 domain-containing protein  32.35 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4890  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.54 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.625882 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7693  transcriptional regulator MerR family  28.41 
 
 		 271 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1067  Pirin domain protein  32.89 
 
 		 235 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000189042 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0274  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  32.95 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2830  cupin region  35.19 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1424  cupin 2 domain-containing protein  42.55 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.000000123197 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0273  cupin 2 domain-containing protein  38.18 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2443  helix-turn-helix domain-containing protein  32.5 
 
 		 258 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04818  cupin domain  26.83 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3559  transcriptional regulator, AraC family  35.85 
 
 		 267 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3060  cupin domain protein  35.09 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3922  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.22 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1980  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2490  hypothetical protein  34.85 
 
 		 132 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440666  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1706  cupin 2 protein  26.98 
 
 		 136 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2638  cupin 2, barrel  33.33 
 
 		 135 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.746968  hitchhiker  0.000814118 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5448  cupin 2, barrel  39.06 
 
 		 147 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.708388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6385  cupin 2 domain-containing protein  27.82 
 
 		 138 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.128861 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  38.46 
 
 		 111 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5845  cupin 2 domain-containing protein  39.06 
 
 		 147 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2453  cupin domain-containing protein  35.82 
 
 		 137 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.03 
 
 		 172 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2343  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.11 
 
 		 139 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.19 
 
 		 135 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.21 
 
 		 165 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000592158  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4136  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.35 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0889  hypothetical protein  34.33 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3716  cupin 2, barrel  39.29 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000701811  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2589  pectin degradation protein KdgF  34.33 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933509  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0483  cupin 2 domain-containing protein  28.36 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 234 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1190  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.87 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3157  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.61 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.737145  normal  0.282512 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3898  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.29 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5737  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.69 
 
 		 139 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  38.46 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0914  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.38 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2195  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192313  decreased coverage  0.00112961 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0837  cupin 2 domain-containing protein  44.19 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.03 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796075 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.46 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3109  cupin region  42.31 
 
 		 175 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2626  cupin 2, barrel  31.48 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.542859  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2041  cupin 2 domain-containing protein  35.38 
 
 		 110 aa  40.4  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267736 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0909  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.79 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4149  hypothetical protein  40.82 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26535  decreased coverage  0.0023385 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.71 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3707  cupin 2, barrel  33.33 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.602346 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  32.88 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0750  transcriptional regulator, AraC family  31.08 
 
 		 256 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.72 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>