More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3375 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3375  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  401  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_5004  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 		 194 aa  212  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0270987  normal  0.0251839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 200 aa  199  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2862  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 202 aa  181  8.000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  hitchhiker  0.00695972 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 198 aa  169  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5582  TetR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 198 aa  162  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  40.2 
 
 		 199 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 195 aa  142  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 197 aa  131  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  37.79 
 
 		 196 aa  127  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  35.83 
 
 		 197 aa  122  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  35.03 
 
 		 196 aa  110  9e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0055  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 196 aa  88.6  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.727514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1013  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 196 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3208  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 196 aa  87.8  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000777782  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3448  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3140  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 196 aa  87  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.404836  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0042  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3462  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 196 aa  85.1  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00233938  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3234  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 196 aa  85.1  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3487  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 196 aa  85.1  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.418737  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B3453  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 196 aa  84.3  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0161587  hitchhiker  4.69207e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1893  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0175452  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 195 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  25.37 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
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NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
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NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
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NC_013517  Sterm_1582  transcriptional regulator, TetR family  22.45 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000313158  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_28320  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.115035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 194 aa  62  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  20.73 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
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NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
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NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
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NC_013421  Pecwa_1188  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_0503  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
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NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A0503  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0455  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0937341  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  23.62 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0363  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
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NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
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NC_007908  Rfer_0303  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402109  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3581  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1020  TetR family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13954 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4869  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0370  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0375  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0366  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.100088  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0389  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  24.14 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0433  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  23.73 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5097  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  23.83 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0482  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3099  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 291 aa  57.8  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 208 aa  57.8  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0178  TetR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  27.47 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  21.56 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1972  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.134426  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  21.56 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  27.97 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
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NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
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NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  23.2 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009439  Pmen_0971  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.325702 
 
 
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NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_1896  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.589186 
 
 
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NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  21.91 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_1649  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279043 
 
 
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