More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ecaj_0649 on replicon NC_007354
Organism: Ehrlichia canis str. Jake



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007354  Ecaj_0649  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 230 aa  467  1.0000000000000001e-131  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0301917  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0363  DNA repair protein RadC  83.91 
 
 		 230 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0357  DNA repair protein RadC  52.02 
 
 		 224 aa  255  5e-67  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0335  DNA repair protein RadC  42.66 
 
 		 236 aa  202  5e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.75672 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0575  DNA repair protein RadC  41.28 
 
 		 242 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0430  DNA repair protein RadC  42.66 
 
 		 254 aa  198  5e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2304  DNA repair protein RadC  39.63 
 
 		 263 aa  196  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138327  normal  0.0504467 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0229  DNA repair protein RadC  42.66 
 
 		 236 aa  196  4.0000000000000005e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0416143  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2898  DNA repair protein RadC  41.28 
 
 		 241 aa  192  4e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.80937  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2163  DNA repair protein RadC  42.66 
 
 		 246 aa  192  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1454  DNA repair protein RadC  42.15 
 
 		 251 aa  192  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327679  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2270  DNA repair protein RadC  43.58 
 
 		 278 aa  191  9e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1070  DNA repair protein RadC  38.5 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0324215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0830  RadC family DNA repair protein  41.35 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0533914  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0732  DNA repair protein RadC  39.91 
 
 		 243 aa  190  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1493  DNA repair protein RadC  41.28 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6762  DNA repair protein RadC  42.2 
 
 		 247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00351119  normal  0.181603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2207  DNA repair protein RadC  42.2 
 
 		 248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2599  DNA repair protein RadC  41.7 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.129734  normal  0.187954 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0389  DNA repair protein RadC  42.66 
 
 		 239 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.741641  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0008  DNA repair protein RadC  41.94 
 
 		 258 aa  187  8e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2621  DNA repair protein RadC  39.45 
 
 		 246 aa  187  9e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7509  DNA repair protein RadC  42.2 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2483  DNA repair protein RadC  41.74 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0700  DNA repair protein RadC  41.78 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0152  DNA repair protein RadC  40.83 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1709  DNA repair protein RadC  43.12 
 
 		 275 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1511  DNA repair protein RadC  42.66 
 
 		 275 aa  185  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3569  DNA repair protein RadC  38.71 
 
 		 254 aa  185  7e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1043  DNA repair protein RadC  42.66 
 
 		 226 aa  184  9e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.193077 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1171  DNA repair protein RadC  39.17 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0585  DNA repair protein RadC  42.2 
 
 		 248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.489804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0286  DNA repair protein RadC  39.17 
 
 		 257 aa  181  6e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1459  DNA repair protein RadC  41.78 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.734795  hitchhiker  0.00198862 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1311  DNA repair protein RadC  36.7 
 
 		 245 aa  179  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2077  DNA repair protein RadC  39.27 
 
 		 238 aa  179  4e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1909  DNA repair protein RadC  40.81 
 
 		 249 aa  177  8e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1283  DNA repair protein RadC  40.36 
 
 		 249 aa  176  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0949779  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1246  DNA repair protein RadC  40.83 
 
 		 246 aa  176  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.114408  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0720  DNA repair protein RadC  39.45 
 
 		 273 aa  174  7e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2764  DNA repair protein RadC  40.09 
 
 		 261 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2833  DNA repair protein RadC  41.4 
 
 		 223 aa  168  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7387  DNA repair protein RadC  44.44 
 
 		 203 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4476  DNA repair protein RadC  35.81 
 
 		 230 aa  161  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352364  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0625  DNA repair protein RadC, putative  34.26 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.42242  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2442  DNA repair protein RadC  38.07 
 
 		 225 aa  157  9e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1240  DNA repair protein  36.2 
 
 		 275 aa  153  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.770366  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1462  RadC family DNA repair protein  36.82 
 
 		 271 aa  150  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.457457  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3794  DNA repair protein RadC  39.34 
 
 		 196 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0842954  unclonable  0.000000153517 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2935  DNA repair protein RadC  39.45 
 
 		 227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.144285  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1263  DNA repair protein RadC  35.32 
 
 		 272 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.94843  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1864  DNA repair protein RadC  38.12 
 
 		 225 aa  145  6e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3052  DNA repair protein RadC  36 
 
 		 209 aa  144  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.184717  normal  0.163227 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3086  DNA repair protein RadC  37.61 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.599972 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1362  DNA repair protein RadC  32.89 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0675  DNA repair protein RadC  34.43 
 
 		 253 aa  141  8e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.461756  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  31.46 
 
 		 224 aa  135  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2732  DNA repair protein RadC  33.49 
 
 		 228 aa  135  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  31.46 
 
 		 224 aa  135  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0054  DNA repair protein RadC  32.89 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000185738  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0559  DNA repair protein RadC  35.16 
 
 		 232 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000678315  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0818  DNA repair protein RadC  33.98 
 
 		 253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0585  DNA repair protein RadC  32.86 
 
 		 242 aa  133  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5205  DNA repair protein RadC  35.35 
 
 		 223 aa  133  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1428  DNA repair protein RadC  31.58 
 
 		 228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00255062  normal  0.0926898 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3148  DNA repair protein RadC  34.47 
 
 		 259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.886628  normal  0.925448 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2712  DNA repair protein RadC  30.99 
 
 		 224 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0757  DNA repair protein RadC  34.86 
 
 		 223 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0315  DNA repair protein RadC  33.95 
 
 		 224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1625  DNA repair protein RadC  32.29 
 
 		 229 aa  128  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3283  DNA repair protein RadC  36.24 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2155  DNA repair protein RadC  33.83 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.365065  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0491  DNA repair protein RadC  33.93 
 
 		 226 aa  125  5e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5346  DNA repair protein RadC  33.64 
 
 		 253 aa  125  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.67199 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0948  DNA repair protein RadC  32.24 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4055  DNA repair protein RadC  32.52 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  33.03 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3946  DNA repair protein RadC  32.52 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0929037  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3928  DNA repair protein RadC  32.52 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0713663  hitchhiker  0.00154722 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4116  DNA repair protein RadC  32.52 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00598559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3339  DNA repair protein RadC  31.78 
 
 		 224 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0155907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4009  DNA repair protein RadC  32.52 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.273398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0257  DNA repair protein RadC  32.27 
 
 		 241 aa  122  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2588  DNA repair protein RadC  32.21 
 
 		 224 aa  122  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0281  DNA repair protein RadC  31.34 
 
 		 234 aa  121  7e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0922067 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0236  DNA repair protein RadC  32.56 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1254  DNA repair protein RadC  32.57 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  34.45 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2553  DNA repair protein RadC  29.28 
 
 		 227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0781  DNA repair protein RadC  33.01 
 
 		 262 aa  119  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0208  DNA repair protein RadC  34.88 
 
 		 221 aa  118  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0478736 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0067  DNA repair protein RadC  29.61 
 
 		 222 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000216711  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1020  DNA repair protein RadC  33.01 
 
 		 278 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.569834  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0984  DNA repair protein RadC  33.01 
 
 		 278 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2230  DNA repair protein RadC  33.01 
 
 		 278 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1139  DNA repair protein RadC  33.01 
 
 		 278 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.437404  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2646  DNA repair protein RadC  33.01 
 
 		 278 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0979  DNA repair protein RadC  33.01 
 
 		 278 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2099  DNA repair protein RadC  33.01 
 
 		 278 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.208076  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3847  DNA repair protein RadC  29.61 
 
 		 222 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.55148e-20  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>