290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3462 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  100 
 
 		 246 aa  508  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  98.37 
 
 		 246 aa  500  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  98.37 
 
 		 246 aa  500  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  97.97 
 
 		 246 aa  498  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  97.97 
 
 		 246 aa  498  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  81.3 
 
 		 246 aa  426  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  59.35 
 
 		 245 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  60.41 
 
 		 241 aa  300  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  58.3 
 
 		 241 aa  295  7e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  55.06 
 
 		 247 aa  272  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  47.01 
 
 		 247 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  49.55 
 
 		 250 aa  215  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  48.88 
 
 		 250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  43.9 
 
 		 250 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  43.8 
 
 		 265 aa  206  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  46.46 
 
 		 234 aa  205  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  48.31 
 
 		 244 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  45.26 
 
 		 236 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  45.61 
 
 		 240 aa  198  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  45.61 
 
 		 245 aa  198  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  45.87 
 
 		 243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  41.73 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  45.18 
 
 		 257 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  43.67 
 
 		 246 aa  191  7e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1676  fimbrial assembly chaperone protein  42.98 
 
 		 245 aa  191  9e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315033  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  44.74 
 
 		 241 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  42.98 
 
 		 245 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  40.16 
 
 		 266 aa  189  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  40.16 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1787  pili assembly chaperone  42.54 
 
 		 259 aa  189  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0172451  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  40.85 
 
 		 243 aa  185  6e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  41.35 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  41.35 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  40.93 
 
 		 253 aa  179  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0380  fimbrial chaperone protein  40.16 
 
 		 309 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0692869 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  37.35 
 
 		 249 aa  169  5e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0370  fimbrial chaperone protein  39.52 
 
 		 253 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  37.6 
 
 		 256 aa  169  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0432  fimbrial chaperone protein  39.68 
 
 		 267 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  hitchhiker  0.0000544991 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0372  fimbrial chaperone protein  39.68 
 
 		 267 aa  168  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.577806  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0392  fimbrial chaperone protein  39.52 
 
 		 309 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.533887  normal  0.0135729 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  41.44 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  37.66 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  39.58 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  37.66 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1152  putative pili assembly chaperone protein  39.68 
 
 		 282 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  38.68 
 
 		 260 aa  161  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.17 
 
 		 238 aa  161  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  38.26 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  38.5 
 
 		 248 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1535  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.86 
 
 		 266 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0256445  normal  0.556062 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0762  Pili assembly chaperone, N-terminal  40.38 
 
 		 248 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0172596 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0299  pili assembly chaperone  34.48 
 
 		 242 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1533  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.72 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.981289  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  36.89 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0502  pili assembly chaperone  37.97 
 
 		 243 aa  149  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  hitchhiker  0.00160128 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4043  pili assembly chaperone  37.97 
 
 		 243 aa  149  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127913  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0170  pili assembly chaperone  37.97 
 
 		 243 aa  148  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978477  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1465  pili assembly chaperone  36.52 
 
 		 244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548977 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11090  chaperone CupB4  34.75 
 
 		 246 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  37.92 
 
 		 249 aa  144  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3923  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.98 
 
 		 247 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.358656  normal  0.566628 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3810  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.98 
 
 		 247 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.124157 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4154  pili assembly chaperone  40.62 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37040  chaperone CupA2  34.86 
 
 		 248 aa  141  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2656  pili assembly chaperone  35.71 
 
 		 267 aa  140  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0266347 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1790  pili assembly chaperone  35.71 
 
 		 267 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0241556  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2832  pili assembly chaperone  33.48 
 
 		 252 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1890  pili assembly chaperone  33.19 
 
 		 259 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000417223 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1313  pili assembly chaperone  35.08 
 
 		 250 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654177  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1679  pili assembly chaperone  35.32 
 
 		 267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1666  pili assembly chaperone  33.2 
 
 		 252 aa  135  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.212595  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2229  chaperone protein PapD  36.74 
 
 		 251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.482953  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2038  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  33.91 
 
 		 248 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361686  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  38.43 
 
 		 248 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  34 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1017  chaperone CupB4  32.92 
 
 		 250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3825  pili assembly chaperone  34.48 
 
 		 245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1663  pili assembly chaperone  30.58 
 
 		 275 aa  131  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.44583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  33.47 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59720  putative pili assembly chaperone  34.4 
 
 		 248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000243417  hitchhiker  1.8850500000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0167  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.06 
 
 		 248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1022  fimbrial chaperone protein  32.48 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.490389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2232  fimbrial chaperone protein  32.62 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0389823  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2032  fimbrial assembly chaperone protein  32.62 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2089  fimbrial assembly chaperone protein  32.62 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1500  pili assembly chaperone  37.39 
 
 		 245 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0053  pili assembly chaperone  34.03 
 
 		 255 aa  125  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3022  chaperone CupA2  31.94 
 
 		 248 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4105  pili assembly chaperone protein  34.03 
 
 		 249 aa  125  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1547  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.65 
 
 		 224 aa  125  9e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416561  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4164  pili assembly chaperone protein  34.03 
 
 		 242 aa  125  9e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00562333 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1537  pili assembly chaperone  36.65 
 
 		 224 aa  125  9e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2246  pilus assembly chaperone  36.65 
 
 		 224 aa  125  9e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0470931  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  35.9 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2164  pili assembly chaperone  31.73 
 
 		 243 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2273  pili assembly chaperone  31.73 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59760  putative pili assembly chaperone  31.84 
 
 		 238 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000219223  hitchhiker  1.4963800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3093  gram-negative pilus assembly chaperone  35.78 
 
 		 224 aa  123  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.866269 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1272  gram-negative pili assembly chaperone  33.66 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>