72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1643 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  100 
 
 
516 aa  1029    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  89.93 
 
 
536 aa  924    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  48.78 
 
 
962 aa  448  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  86.67 
 
 
1007 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  82.46 
 
 
1120 aa  344  2e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  65.78 
 
 
1137 aa  335  1e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2098  Tail Collar domain protein  77.59 
 
 
320 aa  330  4e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0113464  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0873  side tail fiber protein  65.78 
 
 
441 aa  327  3e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0833  phage tail collar domain-containing protein  77.59 
 
 
281 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0875  phage tail fiber repeat protein  83.64 
 
 
172 aa  289  1e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872815  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  39.26 
 
 
790 aa  266  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  57.89 
 
 
805 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1123  side tail fiber protein  58.33 
 
 
569 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  58.33 
 
 
463 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  56.94 
 
 
580 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  56.77 
 
 
791 aa  239  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  40.9 
 
 
892 aa  200  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  80.77 
 
 
570 aa  193  5e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2246  tail protein  57.24 
 
 
514 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2249  tail protein  57.64 
 
 
520 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0759311  normal  0.0336742 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  68.93 
 
 
442 aa  148  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  58.71 
 
 
583 aa  134  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4537  gp19  53.29 
 
 
493 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4536  tail fiber domain-containing protein  52.9 
 
 
552 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.371688 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4452  tail fiber domain protein  47.85 
 
 
581 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2918  gp19  56.99 
 
 
701 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217612  hitchhiker  0.00000000528807 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  45.24 
 
 
485 aa  81.6  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  45.26 
 
 
557 aa  81.3  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  49.32 
 
 
682 aa  80.5  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  45.24 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  43.53 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  46.67 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  49.25 
 
 
498 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  46.58 
 
 
259 aa  75.9  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1819  Tail Collar domain protein  38.1 
 
 
166 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  45.21 
 
 
646 aa  75.9  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00848  bacteriophage tail fiber protein  44.87 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00854  hypothetical protein  44.87 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  58 
 
 
401 aa  73.6  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  31.97 
 
 
689 aa  73.2  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2758  tail collar domain-containing protein  36.84 
 
 
177 aa  68.2  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  38.82 
 
 
262 aa  67  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3032  tail Collar domain protein  35.79 
 
 
176 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000835332 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00752  hypothetical protein  75 
 
 
401 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  38.37 
 
 
621 aa  65.5  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10056  Tail fiber protein  75 
 
 
401 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2198  tail collar domain-containing protein  44.29 
 
 
402 aa  63.5  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23854  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2097  Tail Collar domain protein  48.28 
 
 
183 aa  62.4  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1817  Tail Collar domain protein  50 
 
 
196 aa  62.4  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386449  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  84.21 
 
 
645 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0636  Tail Collar domain protein  35.79 
 
 
144 aa  57.4  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266713  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01348  hypothetical protein  26.62 
 
 
501 aa  56.2  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106689  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2427  side tail fiber protein  80 
 
 
280 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1042  putative phage tail fiber protein  64.44 
 
 
469 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1045  tail fiber protein  44.21 
 
 
690 aa  55.1  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3474  phage tail fiber repeat  49.33 
 
 
670 aa  53.9  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858569  hitchhiker  0.000000311784 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2783  phage tail fiber repeat-containing protein  49.33 
 
 
670 aa  53.9  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.572485  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0183  tail fiber repeat 2-containing protein  83.33 
 
 
408 aa  53.5  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  70 
 
 
673 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0634  shufflon domain protein  37.18 
 
 
532 aa  51.2  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1862  phage tail collar domain-containing protein  24.9 
 
 
735 aa  50.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0637  Tail Collar domain protein  32.37 
 
 
140 aa  50.8  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.436358  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0638  Tail Collar domain protein  34.26 
 
 
157 aa  50.4  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.437833  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1062  Tail Collar domain protein  33.33 
 
 
530 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0865  tail fiber repeat 2-containing protein  71.43 
 
 
554 aa  48.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0127303 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0635  Tail Collar domain protein  36.36 
 
 
140 aa  48.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0914  tail fiber repeat 2-containing protein  67.57 
 
 
589 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1333  phage-related tail fiber protein  25.62 
 
 
790 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2885  putative bacteriophage tail fiber protein  71.43 
 
 
462 aa  44.7  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  25.52 
 
 
323 aa  43.9  0.006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  31.55 
 
 
654 aa  43.9  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  31.55 
 
 
654 aa  43.9  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>