128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0870 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  100 
 
 		 556 aa  1165    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  50.36 
 
 		 565 aa  561  1e-158  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  50.18 
 
 		 564 aa  558  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  47.77 
 
 		 577 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  47.06 
 
 		 577 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  48 
 
 		 569 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  47.7 
 
 		 581 aa  521  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  48.42 
 
 		 561 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  46.18 
 
 		 573 aa  491  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  45.14 
 
 		 574 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  41.27 
 
 		 581 aa  405  1e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  36.88 
 
 		 568 aa  368  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  37.17 
 
 		 585 aa  347  3e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  33.58 
 
 		 566 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  32.28 
 
 		 590 aa  311  2.9999999999999997e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  32.28 
 
 		 590 aa  311  2.9999999999999997e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  32.28 
 
 		 590 aa  311  2.9999999999999997e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  32.72 
 
 		 564 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  43.8 
 
 		 455 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  36.03 
 
 		 557 aa  300  6e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  32.97 
 
 		 574 aa  298  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  32.4 
 
 		 558 aa  296  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  35.28 
 
 		 521 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  31.92 
 
 		 565 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  31.14 
 
 		 581 aa  289  8e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  31.19 
 
 		 581 aa  286  5e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  33.77 
 
 		 553 aa  280  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  30.29 
 
 		 581 aa  273  7e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  32.1 
 
 		 586 aa  272  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  30.74 
 
 		 579 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  33.87 
 
 		 534 aa  270  7e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  33.67 
 
 		 534 aa  267  4e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  32.12 
 
 		 583 aa  266  7e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  30.3 
 
 		 581 aa  263  6e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  31.48 
 
 		 552 aa  263  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  34.4 
 
 		 535 aa  260  4e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  32.93 
 
 		 535 aa  256  7e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  30.27 
 
 		 572 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  28.57 
 
 		 590 aa  250  4e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  28.57 
 
 		 562 aa  250  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  28.39 
 
 		 591 aa  250  4e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  29.11 
 
 		 571 aa  246  6e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  30.38 
 
 		 602 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  29.02 
 
 		 565 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  32.27 
 
 		 849 aa  243  9e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  31.27 
 
 		 550 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  28.7 
 
 		 563 aa  235  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  28.7 
 
 		 563 aa  235  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  31.4 
 
 		 546 aa  232  1e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  29.63 
 
 		 604 aa  230  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  30.51 
 
 		 563 aa  227  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  29.29 
 
 		 588 aa  223  8e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  28.34 
 
 		 541 aa  220  5e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  29.68 
 
 		 562 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  29.68 
 
 		 562 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  27.22 
 
 		 580 aa  217  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  28.11 
 
 		 602 aa  215  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  29.11 
 
 		 562 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  27.45 
 
 		 561 aa  208  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  27.25 
 
 		 543 aa  208  2e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  29.98 
 
 		 562 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  29.98 
 
 		 562 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  28.24 
 
 		 556 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  27.2 
 
 		 537 aa  192  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  27.85 
 
 		 545 aa  190  5.999999999999999e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  29.82 
 
 		 546 aa  188  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  26.92 
 
 		 530 aa  187  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  26.57 
 
 		 537 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  25.98 
 
 		 584 aa  183  8.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  26.53 
 
 		 542 aa  177  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  26.14 
 
 		 542 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2689  Terminase  25.81 
 
 		 629 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  26.02 
 
 		 535 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  23.44 
 
 		 569 aa  172  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  28.01 
 
 		 540 aa  171  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  27.22 
 
 		 561 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  26.83 
 
 		 510 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  25.36 
 
 		 535 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  25.82 
 
 		 540 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1671  phage terminase  25.78 
 
 		 593 aa  153  8e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  25.26 
 
 		 611 aa  153  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  25.64 
 
 		 529 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  25.24 
 
 		 555 aa  145  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  26.19 
 
 		 498 aa  136  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  25.93 
 
 		 491 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  24.53 
 
 		 606 aa  134  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  24.36 
 
 		 606 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2063  phage terminase large subunit  46.85 
 
 		 163 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150685 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1855  prophage LambdaSa2, terminase large subunit, putative  23.32 
 
 		 570 aa  115  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.526141  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  31.28 
 
 		 229 aa  111  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1117  phage terminase  22.51 
 
 		 629 aa  110  6e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3429  terminase large subunit, N-terminal region  36.84 
 
 		 215 aa  109  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3427  terminase large subunit, C-terminal region  24.93 
 
 		 356 aa  108  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3592  terminase  22.96 
 
 		 555 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156762  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  23.11 
 
 		 503 aa  100  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  22.02 
 
 		 528 aa  99  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1649  Phage terminase-like protein, large subunit  23.55 
 
 		 626 aa  98.6  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1376  putative phage terminase, large subunit  22.59 
 
 		 555 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0389174 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5356  prophage LambdaBa03, terminase, large subunit  23.83 
 
 		 523 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1652  hypothetical protein  50 
 
 		 92 aa  95.5  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>