262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2287 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  72.63 
 
 
539 aa  820    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  100 
 
 
539 aa  1088    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  79.22 
 
 
538 aa  863    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1573  flagellar M-ring protein FliF  60.95 
 
 
547 aa  630  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  52.61 
 
 
537 aa  545  1e-154  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  38.64 
 
 
525 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  37.12 
 
 
530 aa  316  6e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  41.04 
 
 
528 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  36.83 
 
 
522 aa  311  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  39.11 
 
 
527 aa  307  3e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  35.8 
 
 
523 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  40.35 
 
 
527 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  35.02 
 
 
533 aa  282  9e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  38.49 
 
 
519 aa  279  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  35.06 
 
 
551 aa  277  4e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  33.94 
 
 
552 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0691  flagellar MS-ring protein  33.33 
 
 
540 aa  262  8.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  33.97 
 
 
593 aa  262  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  32.83 
 
 
600 aa  259  8e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1457  flagellar MS-ring protein  33.15 
 
 
538 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0599  flagellar MS-ring protein  31.99 
 
 
541 aa  258  2e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1272  flagellar MS-ring protein  31.78 
 
 
532 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000378845  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  32.95 
 
 
677 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  32.18 
 
 
587 aa  253  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5059  flagellar MS-ring protein  34.09 
 
 
525 aa  252  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48638  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  31.94 
 
 
603 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  34.65 
 
 
597 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0545  flagellar MS-ring protein  32.17 
 
 
551 aa  250  4e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  33.02 
 
 
598 aa  250  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  33.02 
 
 
598 aa  250  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  33.02 
 
 
598 aa  250  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0569  flagellar M-ring protein FliF  34.35 
 
 
504 aa  249  1e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  34.24 
 
 
567 aa  248  2e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2044  flagellar MS-ring protein  38.65 
 
 
498 aa  248  2e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  34.23 
 
 
598 aa  247  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  32.95 
 
 
598 aa  246  6e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  32.95 
 
 
598 aa  246  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  32.95 
 
 
598 aa  246  6e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  32.95 
 
 
598 aa  246  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1591  flagellar MS-ring protein  33.62 
 
 
565 aa  246  9.999999999999999e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4573  flagellar MS-ring protein  36.1 
 
 
538 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.628076  normal  0.449535 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  31.85 
 
 
587 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  31.85 
 
 
587 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  34.49 
 
 
552 aa  244  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3846  flagellar MS-ring protein  31.6 
 
 
532 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184331  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6057  flagellar MS-ring protein  36.7 
 
 
541 aa  243  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0632593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  34.49 
 
 
552 aa  243  9e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  34.49 
 
 
552 aa  243  9e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  34.49 
 
 
552 aa  243  9e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2184  flagellar M-ring protein FliF  31.87 
 
 
552 aa  242  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  34.49 
 
 
552 aa  242  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  34.49 
 
 
552 aa  241  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  31.87 
 
 
590 aa  240  4e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  32.12 
 
 
548 aa  240  5e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  31.43 
 
 
576 aa  239  8e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  33.6 
 
 
592 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  35.35 
 
 
579 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  33.4 
 
 
587 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  35.53 
 
 
519 aa  239  1e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  35.35 
 
 
576 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5126  flagellar MS-ring protein  36.89 
 
 
539 aa  238  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0640822 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0771  flagellar MS-ring protein  36.3 
 
 
524 aa  238  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107573 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  35.35 
 
 
579 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  35.35 
 
 
579 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  31.98 
 
 
587 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  31.98 
 
 
587 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  31.98 
 
 
587 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  35.35 
 
 
579 aa  238  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  32.71 
 
 
567 aa  238  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  31.82 
 
 
566 aa  236  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  32.85 
 
 
611 aa  236  8e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1876  flagellar MS-ring protein  32.58 
 
 
535 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518241  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1576  flagellar MS-ring protein  35.06 
 
 
568 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1498  flagellar MS-ring protein  32.93 
 
 
592 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583587  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  32.58 
 
 
569 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  32.54 
 
 
562 aa  235  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4369  flagellar MS-ring protein  32.93 
 
 
592 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443151  normal  0.963228 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  34.82 
 
 
571 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  31.23 
 
 
561 aa  233  7.000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0550  flagellar M-ring protein FliF  31.92 
 
 
588 aa  233  8.000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  34.18 
 
 
563 aa  233  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0218  flagellar M-ring protein FliF  34.03 
 
 
574 aa  232  1e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  33.08 
 
 
566 aa  232  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  34.18 
 
 
567 aa  231  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  31.84 
 
 
611 aa  232  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  31.84 
 
 
611 aa  232  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0472  flagellar MS-ring protein  33.87 
 
 
566 aa  231  3e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3448  flagellar MS-ring protein  33.19 
 
 
558 aa  231  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  32.17 
 
 
570 aa  229  9e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  32.17 
 
 
570 aa  229  9e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  33.13 
 
 
560 aa  229  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  32.39 
 
 
570 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0688  flagellar MS-ring protein  34.52 
 
 
512 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  33.77 
 
 
580 aa  228  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1536  flagellar MS-ring protein  33.47 
 
 
595 aa  228  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  32.53 
 
 
565 aa  227  4e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  33.84 
 
 
594 aa  227  4e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0978  flagellar M-ring protein FliF  33.65 
 
 
527 aa  226  6e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.102842  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3694  flagellar MS-ring protein  33.33 
 
 
592 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  31.73 
 
 
595 aa  224  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>