More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1549 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1549  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 252 aa  513  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.42091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0348  Triose-phosphate isomerase  58 
 
 		 251 aa  288  4e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0212974 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1989  triosephosphate isomerase  59.6 
 
 		 250 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1410  Triose-phosphate isomerase  58.4 
 
 		 251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0880  triosephosphate isomerase  56.52 
 
 		 251 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1176  Triose-phosphate isomerase  49.21 
 
 		 255 aa  237  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.46526  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  45.82 
 
 		 252 aa  230  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 		 250 aa  223  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 		 254 aa  221  8e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  43.2 
 
 		 251 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  48 
 
 		 254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  47.2 
 
 		 251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  46.64 
 
 		 251 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  44.84 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  45.02 
 
 		 251 aa  215  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  44.76 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1356  triosephosphate isomerase  43.37 
 
 		 246 aa  212  3.9999999999999995e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.688667  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  44.35 
 
 		 257 aa  211  7e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  43.87 
 
 		 252 aa  211  7.999999999999999e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  42.4 
 
 		 250 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  43.6 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  44.98 
 
 		 251 aa  208  7e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  45.82 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  43.53 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  40.08 
 
 		 249 aa  206  3e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 		 255 aa  205  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  42 
 
 		 256 aa  204  9e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10411  triosephosphate isomerase  42.97 
 
 		 241 aa  203  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0274  Triose-phosphate isomerase  43.03 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  45.85 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  41.37 
 
 		 253 aa  202  3e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1835  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 		 250 aa  201  7e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.83515  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1450  Triose-phosphate isomerase  45.42 
 
 		 252 aa  201  9e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  41.73 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1153  triosephosphate isomerase  42.06 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  42.91 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36521  predicted protein  42 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.144318  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  44.22 
 
 		 654 aa  199  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  44.66 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10411  triosephosphate isomerase  42.57 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_24989  predicted protein  42 
 
 		 279 aa  199  3e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 		 249 aa  199  5e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4480  triosephosphate isomerase  44.94 
 
 		 251 aa  198  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3290  triosephosphate isomerase  43.37 
 
 		 241 aa  198  7e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0971  triosephosphate isomerase  42.17 
 
 		 241 aa  197  9e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  40.64 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  42.34 
 
 		 655 aa  197  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  42.69 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1380  triosephosphate isomerase  42.17 
 
 		 241 aa  195  6e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  45.85 
 
 		 258 aa  195  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4008  triosephosphate isomerase  40.56 
 
 		 241 aa  194  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0608629 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09041  triosephosphate isomerase  41.37 
 
 		 241 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.535393  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  43.31 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  42.13 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  41.13 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3166  Triose-phosphate isomerase  44.09 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136531  normal  0.155629 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  43.43 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1736  triosephosphate isomerase  42.97 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  42.06 
 
 		 252 aa  193  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1264  Triose-phosphate isomerase  43.93 
 
 		 240 aa  192  3e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  42.63 
 
 		 253 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  41.5 
 
 		 248 aa  192  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  41.5 
 
 		 248 aa  192  5e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  40.48 
 
 		 250 aa  192  5e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0604  triosephosphate isomerase  42.62 
 
 		 270 aa  192  6e-48  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.783409  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  42.4 
 
 		 250 aa  191  7e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4380  Triose-phosphate isomerase  45.38 
 
 		 254 aa  191  9e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3104  Triose-phosphate isomerase  44 
 
 		 253 aa  190  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  42.06 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1825  triosephosphate isomerase  39.68 
 
 		 248 aa  191  1e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1889  triosephosphate isomerase  42.8 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193197  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2471  triosephosphate isomerase  42.19 
 
 		 257 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2200  triosephosphate isomerase  43.78 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000236653  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  43.09 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  40.94 
 
 		 254 aa  189  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1078  triosephosphate isomerase  41.3 
 
 		 298 aa  189  4e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  41.67 
 
 		 250 aa  189  4e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  42.74 
 
 		 251 aa  189  4e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13911  triosephosphate isomerase  38.96 
 
 		 243 aa  189  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.303825 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  41.27 
 
 		 251 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  43.6 
 
 		 246 aa  188  5.999999999999999e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2230  triosephosphate isomerase  45.12 
 
 		 256 aa  188  9e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  42.45 
 
 		 253 aa  188  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43602  predicted protein  40.08 
 
 		 338 aa  188  9e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.033956  normal  0.0824901 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  40 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0830  triosephosphate isomerase  39.36 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292321  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0764  triosephosphate isomerase  44.22 
 
 		 246 aa  187  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.641907 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  42.23 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  43.53 
 
 		 687 aa  187  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  38.65 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  38.89 
 
 		 251 aa  186  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0717  triosephosphate isomerase  41.63 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4716  triosephosphate isomerase  43.41 
 
 		 251 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1636  triosephosphate isomerase  44.98 
 
 		 254 aa  186  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  41.5 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  40.87 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  40.87 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2769  Triose-phosphate isomerase  42.4 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.216684  hitchhiker  0.00002221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>