More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0880 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0880  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 251 aa  509  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1410  Triose-phosphate isomerase  59.52 
 
 		 251 aa  299  4e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0348  Triose-phosphate isomerase  59.52 
 
 		 251 aa  290  2e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0212974 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1989  triosephosphate isomerase  58.96 
 
 		 250 aa  288  4e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1549  triosephosphate isomerase  56.52 
 
 		 252 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.42091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1176  Triose-phosphate isomerase  52.8 
 
 		 255 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.46526  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  48.8 
 
 		 250 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  49.41 
 
 		 254 aa  215  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  46 
 
 		 250 aa  215  7e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  44.8 
 
 		 252 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  44 
 
 		 251 aa  211  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  43.6 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  45.42 
 
 		 256 aa  207  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1356  triosephosphate isomerase  43.43 
 
 		 246 aa  206  3e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.688667  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  44.8 
 
 		 251 aa  205  6e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  45.24 
 
 		 257 aa  205  6e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  47.43 
 
 		 254 aa  204  8e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  43.25 
 
 		 251 aa  203  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  45.53 
 
 		 254 aa  202  5e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  43.6 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  42 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  40.96 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  42.06 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0274  Triose-phosphate isomerase  41.27 
 
 		 265 aa  195  5.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  43.25 
 
 		 257 aa  195  6e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.03 
 
 		 654 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  46.78 
 
 		 243 aa  194  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  42.29 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  43.82 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  40.94 
 
 		 257 aa  192  6e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  44.35 
 
 		 253 aa  191  6e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  45.12 
 
 		 255 aa  191  9e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1236  triosephosphate isomerase  42.23 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000124491  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  41.6 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  42.28 
 
 		 251 aa  189  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1153  triosephosphate isomerase  40.89 
 
 		 250 aa  188  8e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  38.49 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  42 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  44.66 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  38.4 
 
 		 249 aa  186  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  45.49 
 
 		 243 aa  186  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  40.16 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  40.16 
 
 		 250 aa  186  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 		 246 aa  185  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  39.36 
 
 		 263 aa  185  5e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4716  triosephosphate isomerase  46.03 
 
 		 251 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  44.05 
 
 		 255 aa  185  7e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  42.97 
 
 		 249 aa  185  8e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0100  triosephosphate isomerase  39.53 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  41.18 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  39.68 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  41.18 
 
 		 655 aa  184  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  40.48 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  44.49 
 
 		 253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  44.62 
 
 		 687 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4715  triosephosphate isomerase  44.49 
 
 		 251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151784  hitchhiker  0.00871946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4581  triosephosphate isomerase  44.49 
 
 		 251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.299699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0717  triosephosphate isomerase  43.31 
 
 		 251 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  42.11 
 
 		 257 aa  181  7e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  40.55 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  40.16 
 
 		 253 aa  179  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  40.16 
 
 		 253 aa  179  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49960  triosephosphate isomerase  43.9 
 
 		 251 aa  179  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3504  triosephosphate isomerase  38.98 
 
 		 250 aa  179  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.449389  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45770  triosephosphate isomerase  43.9 
 
 		 251 aa  179  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  39.2 
 
 		 248 aa  178  8e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  39.2 
 
 		 248 aa  178  8e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62830  triosephosphate isomerase  45.1 
 
 		 251 aa  178  8e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  41.8 
 
 		 253 aa  178  9e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  40.73 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  39.29 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  38.1 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  42.69 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  42.58 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  38.8 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3290  triosephosphate isomerase  39.53 
 
 		 241 aa  176  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4380  Triose-phosphate isomerase  43.03 
 
 		 254 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0742  triosephosphate isomerase  41.13 
 
 		 256 aa  176  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2017  triosephosphate isomerase  37.7 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.283793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  36.99 
 
 		 252 aa  177  2e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1078  triosephosphate isomerase  38.15 
 
 		 298 aa  176  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  40.87 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15220  triosephosphate isomerase  43.72 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.005965  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1736  triosephosphate isomerase  41.56 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4494  triosephosphate isomerase  42.52 
 
 		 251 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.321001  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5468  triosephosphate isomerase  44.71 
 
 		 251 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.50496  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  44.18 
 
 		 258 aa  176  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1889  triosephosphate isomerase  43.2 
 
 		 252 aa  176  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193197  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1380  triosephosphate isomerase  38.96 
 
 		 241 aa  176  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  40.24 
 
 		 254 aa  175  5e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0947  triosephosphate isomerase  43.43 
 
 		 249 aa  176  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  41.53 
 
 		 245 aa  175  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  45.31 
 
 		 253 aa  175  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  45.31 
 
 		 253 aa  175  5e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  39.76 
 
 		 251 aa  175  6e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10411  triosephosphate isomerase  36.36 
 
 		 241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  39.44 
 
 		 250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  40.48 
 
 		 248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  40.73 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3352  Triose-phosphate isomerase  41.5 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>