More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1989 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1989  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 250 aa  501  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1410  Triose-phosphate isomerase  63.35 
 
 		 251 aa  310  1e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0348  Triose-phosphate isomerase  62.55 
 
 		 251 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0212974 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0880  triosephosphate isomerase  58.96 
 
 		 251 aa  288  4e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1549  triosephosphate isomerase  59.6 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.42091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1176  Triose-phosphate isomerase  56.13 
 
 		 255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.46526  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1356  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 246 aa  217  1e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.688667  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  43.55 
 
 		 252 aa  210  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  46 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  45.12 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  47.6 
 
 		 257 aa  206  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  45.75 
 
 		 254 aa  201  7e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  45.97 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  45.97 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  44.58 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  43.09 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  42.34 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  44.58 
 
 		 250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  41.13 
 
 		 253 aa  195  6e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  43.25 
 
 		 251 aa  194  8.000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  45.42 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  45.12 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  45.53 
 
 		 243 aa  193  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0971  triosephosphate isomerase  38.62 
 
 		 241 aa  192  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  44.62 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  45.53 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10411  triosephosphate isomerase  38.55 
 
 		 241 aa  192  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  44.4 
 
 		 250 aa  191  7e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  45.16 
 
 		 251 aa  191  8e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0274  Triose-phosphate isomerase  40.4 
 
 		 265 aa  191  8e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  45.11 
 
 		 243 aa  191  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  43.72 
 
 		 253 aa  190  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  42.8 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.35 
 
 		 654 aa  190  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  42.92 
 
 		 655 aa  190  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09041  triosephosphate isomerase  38.62 
 
 		 241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.535393  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  42.69 
 
 		 251 aa  189  4e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  42 
 
 		 249 aa  189  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  45.24 
 
 		 250 aa  188  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  44.75 
 
 		 257 aa  188  9e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1264  Triose-phosphate isomerase  43.83 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0056  triosephosphate isomerase  39.36 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  40.8 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10411  triosephosphate isomerase  38.15 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  43.48 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  43.72 
 
 		 249 aa  186  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2003  triosephosphate isomerase  43.08 
 
 		 256 aa  186  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0534929  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  40.32 
 
 		 248 aa  185  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3352  Triose-phosphate isomerase  44.31 
 
 		 252 aa  185  5e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  41.02 
 
 		 253 aa  184  9e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1380  triosephosphate isomerase  40.89 
 
 		 241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1153  triosephosphate isomerase  40.71 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3290  triosephosphate isomerase  41.37 
 
 		 241 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13911  triosephosphate isomerase  38.21 
 
 		 243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.303825 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  45.87 
 
 		 255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  45.12 
 
 		 253 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0238  triosephosphate isomerase  44.86 
 
 		 249 aa  182  6e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  45.12 
 
 		 253 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  41.73 
 
 		 254 aa  181  7e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  44.35 
 
 		 249 aa  181  7e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  43.92 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  40.8 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  41.11 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  41.2 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2833  triosephosphate isomerase  44.26 
 
 		 251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.091999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  41.27 
 
 		 252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  41.04 
 
 		 251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36521  predicted protein  41.3 
 
 		 266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.144318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  41.13 
 
 		 650 aa  179  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_24989  predicted protein  41.3 
 
 		 279 aa  179  4e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  40.65 
 
 		 248 aa  179  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  40.65 
 
 		 248 aa  179  4e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0343  Triose-phosphate isomerase  44 
 
 		 245 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  43.62 
 
 		 245 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01285  triosephosphate isomerase  45.53 
 
 		 251 aa  179  4.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50738  triosephosphate isomerase  43.87 
 
 		 290 aa  179  4.999999999999999e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0267  triosephosphate isomerase  44.03 
 
 		 249 aa  179  4.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  39.59 
 
 		 250 aa  178  5.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0764  triosephosphate isomerase  44.4 
 
 		 246 aa  179  5.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.641907 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  43.55 
 
 		 258 aa  178  7e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1450  Triose-phosphate isomerase  43.39 
 
 		 252 aa  178  9e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10934  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1236  triosephosphate isomerase  41.43 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000124491  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3166  Triose-phosphate isomerase  41.43 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136531  normal  0.155629 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  40.56 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0742  triosephosphate isomerase  42.8 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1947  triosephosphate isomerase  43.43 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  38.71 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  39.59 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  40.16 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  40.16 
 
 		 271 aa  176  2e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  40.24 
 
 		 250 aa  176  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0598  Triose-phosphate isomerase  43.43 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.441113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1825  triosephosphate isomerase  37.4 
 
 		 248 aa  176  3e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  44.98 
 
 		 251 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308196  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4380  Triose-phosphate isomerase  42.86 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1078  triosephosphate isomerase  39.68 
 
 		 298 aa  176  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4480  triosephosphate isomerase  41.53 
 
 		 251 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  41.04 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>