More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50738 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_50738  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 290 aa  587  1e-167  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18228  triosephosphate isomerase  64.41 
 
 		 298 aa  371  1e-102  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.233669  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_7124  predicted protein  48.16 
 
 		 245 aa  222  6e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000000122567  normal  0.0110543 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  46.06 
 
 		 252 aa  218  1e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  44.4 
 
 		 248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  43.2 
 
 		 254 aa  212  7e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  43.25 
 
 		 254 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  44.27 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  45.82 
 
 		 250 aa  209  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  40.94 
 
 		 253 aa  209  3e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  44.22 
 
 		 250 aa  210  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  44.05 
 
 		 251 aa  208  7e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 		 251 aa  208  8e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  42.52 
 
 		 257 aa  208  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  44.58 
 
 		 256 aa  207  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  41.2 
 
 		 650 aa  206  4e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  44.58 
 
 		 251 aa  205  7e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  43.25 
 
 		 254 aa  204  9e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  42.57 
 
 		 253 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  44.58 
 
 		 250 aa  203  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  43.82 
 
 		 251 aa  203  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  42.91 
 
 		 249 aa  202  4e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  41.2 
 
 		 655 aa  201  9.999999999999999e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  42.57 
 
 		 250 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1264  Triose-phosphate isomerase  42.86 
 
 		 240 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  44.4 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  43.08 
 
 		 251 aa  200  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  43.82 
 
 		 248 aa  200  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  42.21 
 
 		 251 aa  199  5e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  41.53 
 
 		 253 aa  198  9e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  45.13 
 
 		 243 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  39.52 
 
 		 251 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 		 253 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  44.69 
 
 		 243 aa  195  6e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  44.67 
 
 		 251 aa  195  7e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  42.97 
 
 		 687 aa  194  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  44.67 
 
 		 251 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  41.37 
 
 		 257 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  44.26 
 
 		 251 aa  193  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  44.26 
 
 		 251 aa  193  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  44.26 
 
 		 251 aa  193  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3096  Triose-phosphate isomerase  42.29 
 
 		 263 aa  193  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119937  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0742  triosephosphate isomerase  40.98 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  43.85 
 
 		 251 aa  192  6e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5606  triosephosphate isomerase  43.02 
 
 		 263 aa  192  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245433  normal  0.85925 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  41.43 
 
 		 253 aa  192  7e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  41.43 
 
 		 253 aa  192  7e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  37.9 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  43.85 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  43.85 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  40.8 
 
 		 248 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  40.8 
 
 		 248 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0674  triosephosphate isomerase  43.5 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.260735  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  43.85 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20010  triosephosphate isomerase  41.31 
 
 		 264 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.627972 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  45.02 
 
 		 251 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  43.85 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  43.85 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  40.23 
 
 		 261 aa  191  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  44.67 
 
 		 255 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  40.24 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  41.77 
 
 		 257 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  40.24 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  38.71 
 
 		 254 aa  189  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  41.9 
 
 		 250 aa  189  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  41.25 
 
 		 254 aa  189  5e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  41.8 
 
 		 260 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1258  triosephosphate isomerase  40.31 
 
 		 260 aa  189  5.999999999999999e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  41.83 
 
 		 261 aa  188  7e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  41.9 
 
 		 263 aa  188  7e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000945528 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  44.8 
 
 		 253 aa  188  8e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  42.13 
 
 		 252 aa  188  8e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  44.8 
 
 		 253 aa  188  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  39.92 
 
 		 251 aa  188  9e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  42.11 
 
 		 646 aa  188  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  42.35 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  41.06 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3869  triosephosphate isomerase  43.03 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  43.25 
 
 		 654 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  42.4 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  41.04 
 
 		 275 aa  186  3e-46  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  44.62 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  39.23 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25308  triosephosphate isomerase/glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase precursor  42.45 
 
 		 614 aa  186  3e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.165806  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3352  Triose-phosphate isomerase  40.49 
 
 		 252 aa  186  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06900  Triosephosphate isomerase (TIM)(EC 5.3.1.1)(Triose-phosphate isomerase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P04828]  41.6 
 
 		 249 aa  186  4e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.762723 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  40.47 
 
 		 251 aa  186  5e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2538  triosephosphate isomerase  41.13 
 
 		 260 aa  186  5e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00272657  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  39.52 
 
 		 251 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  41.43 
 
 		 252 aa  183  3e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2015  triosephosphate isomerase  43.31 
 
 		 261 aa  183  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.944897  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2003  triosephosphate isomerase  38.15 
 
 		 256 aa  183  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0534929  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13483  triosephosphate isomerase  37.75 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.943567  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  38.67 
 
 		 256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0693  triosephosphate isomerase  39.75 
 
 		 257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.444699  unclonable  0.0000000042345 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1244  triosephosphate isomerase  42.04 
 
 		 252 aa  182  5.0000000000000004e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0738  Triose-phosphate isomerase  50 
 
 		 243 aa  182  6e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000147069  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1356  triosephosphate isomerase  39.11 
 
 		 246 aa  182  7e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.688667  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  41.94 
 
 		 252 aa  182  8.000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>