More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_18228 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_18228  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 298 aa  607  1e-173  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.233669  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50738  triosephosphate isomerase  64.41 
 
 		 290 aa  371  1e-102  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  44.84 
 
 		 252 aa  225  7e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_7124  predicted protein  48.16 
 
 		 245 aa  221  9e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000000122567  normal  0.0110543 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  44.4 
 
 		 253 aa  216  5e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  45.49 
 
 		 655 aa  215  7e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  44 
 
 		 252 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  44.18 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  44 
 
 		 254 aa  206  6e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  41.77 
 
 		 250 aa  204  1e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  42.4 
 
 		 251 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  45.06 
 
 		 263 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000945528 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3096  Triose-phosphate isomerase  44.57 
 
 		 263 aa  203  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119937  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  43.85 
 
 		 251 aa  202  5e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1236  triosephosphate isomerase  42.62 
 
 		 250 aa  202  7e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000124491  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  43.37 
 
 		 254 aa  202  7e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  42.57 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  42.74 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  41.34 
 
 		 257 aa  200  3e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  41.6 
 
 		 252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  41.94 
 
 		 253 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  40.96 
 
 		 251 aa  199  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  40.94 
 
 		 254 aa  198  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0738  Triose-phosphate isomerase  46.02 
 
 		 243 aa  197  2.0000000000000003e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000147069  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  48.99 
 
 		 243 aa  196  3e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  42.74 
 
 		 253 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  42.17 
 
 		 254 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1264  Triose-phosphate isomerase  47.6 
 
 		 240 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5606  triosephosphate isomerase  43.97 
 
 		 263 aa  196  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245433  normal  0.85925 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  40.21 
 
 		 275 aa  195  6e-49  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  39.18 
 
 		 249 aa  195  6e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  42 
 
 		 251 aa  195  6e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  43.92 
 
 		 687 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  40.8 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  39.76 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  40.56 
 
 		 248 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1244  triosephosphate isomerase  42.21 
 
 		 252 aa  194  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  40.96 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  47.98 
 
 		 243 aa  193  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  38.46 
 
 		 251 aa  193  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  40.33 
 
 		 251 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308196  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2532  triosephosphate isomerase  41.63 
 
 		 264 aa  192  5e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  44.14 
 
 		 260 aa  192  8e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  38.4 
 
 		 251 aa  192  8e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  39.76 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  39.52 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  40.49 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  39.92 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  41.43 
 
 		 251 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  39.92 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  40.08 
 
 		 251 aa  189  4e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2538  triosephosphate isomerase  43.55 
 
 		 260 aa  189  4e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00272657  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  40.73 
 
 		 250 aa  189  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2365  triosephosphate isomerase  43.08 
 
 		 262 aa  189  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  41.04 
 
 		 253 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  43.43 
 
 		 261 aa  189  5e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  40.8 
 
 		 250 aa  189  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5197  triosephosphate isomerase  43.82 
 
 		 261 aa  189  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  40 
 
 		 250 aa  189  5.999999999999999e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  40.16 
 
 		 248 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  40.16 
 
 		 248 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  42 
 
 		 249 aa  188  8e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  42.06 
 
 		 646 aa  188  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11370  triosephosphate isomerase  41.6 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.413237  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  40.48 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  40.54 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  39.68 
 
 		 251 aa  188  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20010  triosephosphate isomerase  41.98 
 
 		 264 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.627972 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  38.76 
 
 		 650 aa  187  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1026  triosephosphate isomerase  39.51 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00133267  normal  0.306303 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  39.51 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  40.56 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  39.68 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2289  triosephosphate isomerase  39.09 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785898  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2168  triosephosphate isomerase  39.09 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00524142  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  42.23 
 
 		 654 aa  187  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  38.31 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  42 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25308  triosephosphate isomerase/glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase precursor  44.35 
 
 		 614 aa  186  4e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.165806  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  41.98 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15220  triosephosphate isomerase  41.11 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.005965  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1941  triosephosphate isomerase  40 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.36983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  41.6 
 
 		 248 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4717  Triose-phosphate isomerase  39.92 
 
 		 255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000120949  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  42.39 
 
 		 255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  38.8 
 
 		 250 aa  183  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2089  triosephosphate isomerase  40.78 
 
 		 271 aa  183  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19012  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1830  Triose-phosphate isomerase  41.57 
 
 		 271 aa  183  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136952 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  42.39 
 
 		 251 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2015  triosephosphate isomerase  41.63 
 
 		 261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.944897  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  41.83 
 
 		 253 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  40.32 
 
 		 250 aa  182  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  38.96 
 
 		 257 aa  182  6e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  42.39 
 
 		 251 aa  182  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  41.67 
 
 		 252 aa  182  7e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6036  triose-phosphate isomerase  41.96 
 
 		 261 aa  182  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3352  Triose-phosphate isomerase  40.16 
 
 		 252 aa  182  7e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1258  triosephosphate isomerase  40.31 
 
 		 260 aa  182  8.000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  45.56 
 
 		 250 aa  182  8.000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  41.06 
 
 		 248 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.596842 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>