More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_43602 on replicon NC_009374
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009374  OSTLU_43602  predicted protein  100 
 
 
338 aa  696    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.033956  normal  0.0824901 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36521  predicted protein  61.29 
 
 
266 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.144318  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_24989  predicted protein  59.86 
 
 
279 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06900  Triosephosphate isomerase (TIM)(EC 5.3.1.1)(Triose-phosphate isomerase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P04828]  51.54 
 
 
249 aa  251  1e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.762723 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05000  triose-phosphate isomerase, putative  49.43 
 
 
251 aa  239  4e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00881282  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  47.73 
 
 
253 aa  220  3e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  47.91 
 
 
253 aa  220  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_91105  Triosephosphate isomerase (TIM) (Triose-phosphate isomerase)  46.95 
 
 
248 aa  219  7.999999999999999e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25308  triosephosphate isomerase/glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase precursor  46.92 
 
 
614 aa  215  8e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.165806  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  46.54 
 
 
249 aa  211  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  46.44 
 
 
252 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0717  triosephosphate isomerase  45.63 
 
 
251 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  45.28 
 
 
256 aa  209  7e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4716  triosephosphate isomerase  45.25 
 
 
251 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_54738  isomerase triosephosphate isomerase  42.39 
 
 
268 aa  208  1e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0597298  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  48.06 
 
 
249 aa  208  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4715  triosephosphate isomerase  44.87 
 
 
251 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151784  hitchhiker  0.00871946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4581  triosephosphate isomerase  44.87 
 
 
251 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.299699  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  47.71 
 
 
253 aa  206  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  47.71 
 
 
253 aa  206  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  44.66 
 
 
655 aa  206  5e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  43.45 
 
 
257 aa  205  8e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0775  triosephosphate isomerase  45.63 
 
 
251 aa  205  9e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354266  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3448  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 
256 aa  204  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62830  triosephosphate isomerase  45.63 
 
 
251 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13483  triosephosphate isomerase  42.21 
 
 
250 aa  203  4e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.943567  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5468  triosephosphate isomerase  45.63 
 
 
251 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.50496  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  42.8 
 
 
251 aa  202  8e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 
257 aa  201  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  43.77 
 
 
250 aa  199  5e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  45.77 
 
 
251 aa  199  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4184  triosephosphate isomerase  44.11 
 
 
251 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4494  triosephosphate isomerase  43.77 
 
 
251 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.321001  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  44.44 
 
 
253 aa  198  9e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  44.19 
 
 
254 aa  198  9e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1574  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 
249 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0183532  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  46.92 
 
 
251 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  45.77 
 
 
251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  45.77 
 
 
251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  43.85 
 
 
250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  45.77 
 
 
251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  44.11 
 
 
255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1264  Triose-phosphate isomerase  47.19 
 
 
240 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  45.77 
 
 
251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  45.77 
 
 
251 aa  197  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2831  triosephosphate isomerase  42.21 
 
 
260 aa  196  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000042953  hitchhiker  0.00389109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  44.11 
 
 
256 aa  197  3e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  45.77 
 
 
251 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  43.63 
 
 
252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  45.98 
 
 
248 aa  196  6e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.9 
 
 
646 aa  195  7e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  46.54 
 
 
248 aa  196  7e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  46.54 
 
 
248 aa  196  7e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  40.89 
 
 
254 aa  195  8.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0957  triosephosphate isomerase  41.22 
 
 
260 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0345759  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3104  Triose-phosphate isomerase  41.2 
 
 
253 aa  195  9e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 
251 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 
251 aa  195  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  45.08 
 
 
252 aa  194  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 
251 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  43.89 
 
 
248 aa  194  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  43.35 
 
 
249 aa  195  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 
251 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  45.04 
 
 
250 aa  194  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 
251 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1591  triosephosphate isomerase  45.42 
 
 
255 aa  194  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  44.79 
 
 
250 aa  194  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  44.79 
 
 
253 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0169  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 
255 aa  193  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.543601  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  41.15 
 
 
254 aa  193  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0103  triosephosphate isomerase  46.27 
 
 
256 aa  193  4e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0154  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 
255 aa  192  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3565  triosephosphate isomerase  41.06 
 
 
260 aa  192  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.147919  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2838  triosephosphate isomerase  44.23 
 
 
249 aa  192  6e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0604  triosephosphate isomerase  38.58 
 
 
270 aa  192  7e-48  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.783409  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  44.36 
 
 
255 aa  192  8e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  41.44 
 
 
260 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121721  unclonable  0.00000000000528037 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  41.44 
 
 
260 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371764  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1200  triosephosphate isomerase  41.44 
 
 
260 aa  191  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3808  triosephosphate isomerase  46.33 
 
 
255 aa  191  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.102844  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  41.44 
 
 
260 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000876569  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3393  triosephosphate isomerase  41.51 
 
 
260 aa  191  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000164415  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  44.36 
 
 
271 aa  191  1e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3612  triosephosphate isomerase  44.11 
 
 
251 aa  192  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1520  triosephosphate isomerase  43.94 
 
 
272 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128427  decreased coverage  0.0000834169 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4052  triosephosphate isomerase  46.01 
 
 
255 aa  191  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  41.44 
 
 
260 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178614  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1087  triosephosphate isomerase  41.44 
 
 
260 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059681  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  41.44 
 
 
260 aa  191  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000672651  hitchhiker  0.0000521404 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  41.44 
 
 
260 aa  191  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084878  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  41.44 
 
 
260 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000257421  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  42.64 
 
 
275 aa  191  2e-47  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  45.59 
 
 
252 aa  191  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  40.38 
 
 
253 aa  191  2e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3064  triosephosphate isomerase  40.68 
 
 
260 aa  190  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000137173  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  43.89 
 
 
249 aa  191  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4480  triosephosphate isomerase  44.49 
 
 
255 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4327  triosephosphate isomerase  44.49 
 
 
255 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4297  triosephosphate isomerase  44.49 
 
 
255 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4410  triosephosphate isomerase  44.49 
 
 
255 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909919  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>