More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54738 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_54738  isomerase triosephosphate isomerase  100 
 
 		 268 aa  551  1e-156  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0597298  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_24989  predicted protein  48.05 
 
 		 279 aa  240  2e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36521  predicted protein  48.05 
 
 		 266 aa  240  2e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.144318  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06900  Triosephosphate isomerase (TIM)(EC 5.3.1.1)(Triose-phosphate isomerase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P04828]  46.61 
 
 		 249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.762723 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25308  triosephosphate isomerase/glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase precursor  46.59 
 
 		 614 aa  224  1e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.165806  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05000  triose-phosphate isomerase, putative  47.83 
 
 		 251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00881282  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4715  triosephosphate isomerase  46.99 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151784  hitchhiker  0.00871946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4581  triosephosphate isomerase  46.99 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.299699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4716  triosephosphate isomerase  46.59 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  49.2 
 
 		 253 aa  215  8e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_91105  Triosephosphate isomerase (TIM) (Triose-phosphate isomerase)  43.2 
 
 		 248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  47.6 
 
 		 256 aa  212  5.999999999999999e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0717  triosephosphate isomerase  44.18 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0775  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 		 251 aa  209  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354266  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  47.37 
 
 		 257 aa  208  7e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3612  triosephosphate isomerase  44.98 
 
 		 251 aa  208  7e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62830  triosephosphate isomerase  44.58 
 
 		 251 aa  208  9e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43602  predicted protein  43.13 
 
 		 338 aa  207  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.033956  normal  0.0824901 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4494  triosephosphate isomerase  44.58 
 
 		 251 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.321001  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4184  triosephosphate isomerase  44.58 
 
 		 251 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5468  triosephosphate isomerase  44.58 
 
 		 251 aa  205  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.50496  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  47.24 
 
 		 254 aa  205  6e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  46.06 
 
 		 253 aa  205  7e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13483  triosephosphate isomerase  44.05 
 
 		 250 aa  205  8e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.943567  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  45.53 
 
 		 253 aa  204  9e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  43.82 
 
 		 655 aa  201  9.999999999999999e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  43.6 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  44.4 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1591  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0154  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 		 255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0103  triosephosphate isomerase  47.01 
 
 		 256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0169  triosephosphate isomerase  46.99 
 
 		 255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.543601  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  45.93 
 
 		 253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  43.14 
 
 		 251 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308196  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  44.53 
 
 		 257 aa  199  6e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  44.88 
 
 		 250 aa  198  7.999999999999999e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  43.31 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  43.31 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  43.31 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  43.31 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01285  triosephosphate isomerase  43.5 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  45.53 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  43.7 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  46.9 
 
 		 251 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  42.75 
 
 		 251 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  42.75 
 
 		 251 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  42.46 
 
 		 252 aa  195  5.000000000000001e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3808  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 		 255 aa  195  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.102844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  43.31 
 
 		 251 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  43.31 
 
 		 251 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  42.35 
 
 		 249 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4052  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 		 255 aa  195  6e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  43.31 
 
 		 251 aa  195  7e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  43.31 
 
 		 251 aa  195  7e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1003  triosephosphate isomerase  44.88 
 
 		 260 aa  195  7e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0343606  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0706  triosephosphate isomerase  46.89 
 
 		 255 aa  194  9e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.423457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4118  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  43.2 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_7124  predicted protein  43.78 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000000122567  normal  0.0110543 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2168  triosephosphate isomerase  42.75 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00524142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  44.86 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2289  triosephosphate isomerase  42.75 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785898  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0095  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0096  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03804  triosephosphate isomerase  44.58 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4066  Triose-phosphate isomerase  44.58 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4359  triosephosphate isomerase  44.58 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.626096 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  42.75 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4453  triosephosphate isomerase  44.58 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4150  triosephosphate isomerase  44.58 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  45.06 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5374  triosephosphate isomerase  44.58 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4099  triosephosphate isomerase  44.58 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03753  hypothetical protein  44.58 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4399  triosephosphate isomerase  44.58 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3504  triosephosphate isomerase  43.09 
 
 		 250 aa  193  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.449389  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3216  triosephosphate isomerase  44.22 
 
 		 258 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00012954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  43.43 
 
 		 251 aa  192  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  44.53 
 
 		 253 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  44.49 
 
 		 260 aa  192  5e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084878  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  44.49 
 
 		 260 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121721  unclonable  0.00000000000528037 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  44.49 
 
 		 260 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000257421  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  44.49 
 
 		 260 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000876569  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  44.49 
 
 		 260 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371764  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  44.49 
 
 		 260 aa  192  6e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178614  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1200  triosephosphate isomerase  44.49 
 
 		 260 aa  191  7e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1087  triosephosphate isomerase  44.49 
 
 		 260 aa  191  7e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059681  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  44.49 
 
 		 260 aa  191  7e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000672651  hitchhiker  0.0000521404 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  45.34 
 
 		 250 aa  191  9e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0957  triosephosphate isomerase  44.88 
 
 		 260 aa  191  9e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0345759  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  45.14 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_002950  PG0623  triosephosphate isomerase  43.15 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.524933 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3448  triosephosphate isomerase  41.09 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  43.78 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0986  triosephosphate isomerase  44.88 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000192621  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1401  triosephosphate isomerase  44.66 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0615206  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4327  triosephosphate isomerase  44.18 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1341  triosephosphate isomerase  43.14 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000463974  normal  0.0307092 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4297  triosephosphate isomerase  44.18 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4412  triosephosphate isomerase  44.18 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0292909  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>