More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE05000 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006687  CNE05000  triose-phosphate isomerase, putative  100 
 
 		 251 aa  511  1e-144  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00881282  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06900  Triosephosphate isomerase (TIM)(EC 5.3.1.1)(Triose-phosphate isomerase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P04828]  61.54 
 
 		 249 aa  318  6e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.762723 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_91105  Triosephosphate isomerase (TIM) (Triose-phosphate isomerase)  55.24 
 
 		 248 aa  272  3e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36521  predicted protein  52.8 
 
 		 266 aa  267  1e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.144318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_24989  predicted protein  52.8 
 
 		 279 aa  267  1e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43602  predicted protein  50.19 
 
 		 338 aa  249  3e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.033956  normal  0.0824901 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25308  triosephosphate isomerase/glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase precursor  51.19 
 
 		 614 aa  247  1e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.165806  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_54738  isomerase triosephosphate isomerase  47.83 
 
 		 268 aa  225  5.0000000000000005e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0597298  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  46.59 
 
 		 249 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  45.6 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  47.77 
 
 		 252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  46.64 
 
 		 257 aa  212  4.9999999999999996e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3448  triosephosphate isomerase  44.71 
 
 		 256 aa  211  5.999999999999999e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  46.83 
 
 		 253 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  45.87 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.12 
 
 		 655 aa  207  9e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  47.58 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  49.37 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  50.24 
 
 		 243 aa  206  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  46.8 
 
 		 253 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4715  triosephosphate isomerase  46.77 
 
 		 251 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151784  hitchhiker  0.00871946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4581  triosephosphate isomerase  46.77 
 
 		 251 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.299699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4716  triosephosphate isomerase  46.77 
 
 		 251 aa  204  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1264  Triose-phosphate isomerase  49.76 
 
 		 240 aa  204  9e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3352  Triose-phosphate isomerase  43.95 
 
 		 252 aa  204  9e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5468  triosephosphate isomerase  45.16 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.50496  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  46 
 
 		 250 aa  202  4e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  48.82 
 
 		 243 aa  202  4e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0775  triosephosphate isomerase  46.37 
 
 		 251 aa  202  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354266  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62830  triosephosphate isomerase  44.35 
 
 		 251 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  44.35 
 
 		 255 aa  201  8e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3565  triosephosphate isomerase  42.46 
 
 		 260 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.147919  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0986  triosephosphate isomerase  43.65 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000192621  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  46.5 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  45.6 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3393  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000164415  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  44.44 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084878  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000257421  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000876569  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2831  triosephosphate isomerase  42.06 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000042953  hitchhiker  0.00389109 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121721  unclonable  0.00000000000528037 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  45.27 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371764  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0717  triosephosphate isomerase  43.95 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1200  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 260 aa  198  5e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 260 aa  199  5e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178614  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1087  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 260 aa  198  5e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059681  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 260 aa  198  5e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000672651  hitchhiker  0.0000521404 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  47.08 
 
 		 255 aa  198  6e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1003  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 260 aa  198  6e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0343606  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0957  triosephosphate isomerase  43.25 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0345759  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3064  triosephosphate isomerase  42.46 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000137173  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4184  triosephosphate isomerase  44.98 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0274  Triose-phosphate isomerase  45.49 
 
 		 265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  46.28 
 
 		 257 aa  195  5.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3869  triosephosphate isomerase  43.43 
 
 		 253 aa  195  6e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0674  triosephosphate isomerase  44.35 
 
 		 250 aa  195  7e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.260735  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4494  triosephosphate isomerase  43.55 
 
 		 251 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.321001  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0738  Triose-phosphate isomerase  47.87 
 
 		 243 aa  195  7e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000147069  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  45.06 
 
 		 257 aa  194  9e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  42.63 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  46.25 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  46.25 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  46.25 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  46.69 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1520  triosephosphate isomerase  45.24 
 
 		 272 aa  193  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128427  decreased coverage  0.0000834169 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  45.11 
 
 		 254 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  46.28 
 
 		 251 aa  192  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3078  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 		 249 aa  193  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.417746  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  42.57 
 
 		 251 aa  192  6e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  47.5 
 
 		 251 aa  191  7e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  45.83 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  46.28 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  42.8 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  46.28 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  43.82 
 
 		 253 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1591  triosephosphate isomerase  44.58 
 
 		 255 aa  190  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  42.8 
 
 		 271 aa  190  2e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  46.28 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 		 248 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  46.28 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  45.42 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2168  triosephosphate isomerase  41.63 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00524142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0870  triosephosphate isomerase  44.67 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695096  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2289  triosephosphate isomerase  41.63 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785898  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1356  triosephosphate isomerase  40.73 
 
 		 246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.688667  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  44.22 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0672  triosephosphate isomerase  43.55 
 
 		 253 aa  189  5e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.649878  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  44.76 
 
 		 250 aa  188  5.999999999999999e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  44.35 
 
 		 248 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0955  triosephosphate isomerase  44.67 
 
 		 250 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301152 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1153  triosephosphate isomerase  44.4 
 
 		 250 aa  188  8e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2538  triosephosphate isomerase  44.13 
 
 		 260 aa  188  8e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00272657  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2815  triosephosphate isomerase  44.19 
 
 		 270 aa  188  9e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.394294  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13483  triosephosphate isomerase  39.92 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.943567  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1574  triosephosphate isomerase  42.17 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0183532  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>