More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_91105 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009047  PICST_91105  Triosephosphate isomerase (TIM) (Triose-phosphate isomerase)  100 
 
 		 248 aa  504  9.999999999999999e-143  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06900  Triosephosphate isomerase (TIM)(EC 5.3.1.1)(Triose-phosphate isomerase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P04828]  59.6 
 
 		 249 aa  296  2e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.762723 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05000  triose-phosphate isomerase, putative  54.84 
 
 		 251 aa  268  8e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00881282  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36521  predicted protein  50.41 
 
 		 266 aa  246  2e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.144318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_24989  predicted protein  50.41 
 
 		 279 aa  247  2e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25308  triosephosphate isomerase/glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase precursor  49.6 
 
 		 614 aa  236  4e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.165806  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  45.78 
 
 		 249 aa  219  5e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43602  predicted protein  46.95 
 
 		 338 aa  218  5e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.033956  normal  0.0824901 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_54738  isomerase triosephosphate isomerase  43.2 
 
 		 268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0597298  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0775  triosephosphate isomerase  46.77 
 
 		 251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354266  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3808  triosephosphate isomerase  52.03 
 
 		 255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.102844  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03804  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 255 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4066  Triose-phosphate isomerase  49.4 
 
 		 255 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4359  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 255 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.626096 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4453  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 255 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4399  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 255 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03753  hypothetical protein  49.4 
 
 		 255 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4150  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 255 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4052  triosephosphate isomerase  51 
 
 		 255 aa  212  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5374  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 255 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4099  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 255 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4716  triosephosphate isomerase  47.18 
 
 		 251 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0717  triosephosphate isomerase  46.37 
 
 		 251 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0103  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 		 256 aa  208  7e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4715  triosephosphate isomerase  47.18 
 
 		 251 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151784  hitchhiker  0.00871946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4581  triosephosphate isomerase  47.18 
 
 		 251 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.299699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0169  triosephosphate isomerase  51.41 
 
 		 255 aa  207  9e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.543601  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4410  triosephosphate isomerase  49 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4412  triosephosphate isomerase  49 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0292909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4327  triosephosphate isomerase  49 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4297  triosephosphate isomerase  49 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4480  triosephosphate isomerase  49 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4494  triosephosphate isomerase  47.18 
 
 		 251 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.321001  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0154  triosephosphate isomerase  51 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4184  triosephosphate isomerase  46.77 
 
 		 251 aa  205  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0095  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 255 aa  201  7e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  45.8 
 
 		 252 aa  201  7e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4118  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 255 aa  201  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0096  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 255 aa  201  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5468  triosephosphate isomerase  46.37 
 
 		 251 aa  201  8e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.50496  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62830  triosephosphate isomerase  45.56 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1591  triosephosphate isomerase  46.83 
 
 		 255 aa  198  7e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4805  triosephosphate isomerase  48.37 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000667098 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  44.94 
 
 		 655 aa  195  5.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 		 253 aa  195  6e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2633  triosephosphate isomerase  46.59 
 
 		 257 aa  194  8.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  44.98 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3504  triosephosphate isomerase  44.53 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.449389  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  44.53 
 
 		 250 aa  192  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3352  Triose-phosphate isomerase  46.61 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1356  triosephosphate isomerase  44.86 
 
 		 246 aa  192  6e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.688667  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  41.3 
 
 		 248 aa  191  8e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3448  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0623  triosephosphate isomerase  42.57 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.524933 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3612  triosephosphate isomerase  43.95 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  44.27 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0283  triosephosphate isomerase  46.25 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  46.25 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  43.25 
 
 		 251 aa  188  5.999999999999999e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3869  triosephosphate isomerase  40.87 
 
 		 253 aa  187  9e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2838  triosephosphate isomerase  43.32 
 
 		 249 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  41.43 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3104  Triose-phosphate isomerase  44.17 
 
 		 253 aa  186  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  42.97 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2707  triosephosphate isomerase  42.91 
 
 		 249 aa  186  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0169  triosephosphate isomerase  45.82 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1401  triosephosphate isomerase  42.68 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0615206  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  42.29 
 
 		 254 aa  185  5e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  41.77 
 
 		 250 aa  185  5e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2259  Triose-phosphate isomerase  46.44 
 
 		 246 aa  185  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.174039  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001760  triosephosphate isomerase  46.89 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01285  triosephosphate isomerase  42.5 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  43.78 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  43.35 
 
 		 243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  42.69 
 
 		 253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  42.51 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1574  triosephosphate isomerase  42.68 
 
 		 249 aa  182  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0183532  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0100  triosephosphate isomerase  44.94 
 
 		 249 aa  182  3e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5608  triosephosphate isomerase  41.34 
 
 		 254 aa  183  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  44.62 
 
 		 250 aa  183  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1410  Triose-phosphate isomerase  45.61 
 
 		 251 aa  183  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13483  triosephosphate isomerase  41.13 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.943567  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2243  triosephosphate isomerase  47.72 
 
 		 265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0870  triosephosphate isomerase  45.12 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695096  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  42.64 
 
 		 253 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00709  triosephosphate isomerase  46.81 
 
 		 250 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  41.9 
 
 		 250 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  42.06 
 
 		 243 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1341  triosephosphate isomerase  43.78 
 
 		 259 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000463974  normal  0.0307092 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 251 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308196  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  43.53 
 
 		 255 aa  181  9.000000000000001e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 251 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 251 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  42.63 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0348  Triose-phosphate isomerase  49.54 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0212974 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  42.74 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1549  triosephosphate isomerase  42.23 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.42091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0693  triosephosphate isomerase  42.04 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.444699  unclonable  0.0000000042345 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  41.84 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  41.37 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>