More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2259 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2633  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 257 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2259  Triose-phosphate isomerase  100 
 
 		 246 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.174039  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  52.73 
 
 		 253 aa  228  6e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  50.44 
 
 		 250 aa  227  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  50.43 
 
 		 249 aa  224  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.11 
 
 		 655 aa  222  3e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1401  triosephosphate isomerase  51.27 
 
 		 251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0615206  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  49.38 
 
 		 256 aa  218  8.999999999999998e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  45.96 
 
 		 255 aa  216  2e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  54.17 
 
 		 246 aa  216  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  47.7 
 
 		 249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  45.96 
 
 		 271 aa  215  4e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0154  triosephosphate isomerase  52.97 
 
 		 255 aa  215  7e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0169  triosephosphate isomerase  52.51 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.543601  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  54.34 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3448  triosephosphate isomerase  48.86 
 
 		 256 aa  212  4.9999999999999996e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1140  triosephosphate isomerase  53.27 
 
 		 248 aa  211  1e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.766646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  52.38 
 
 		 248 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  53.52 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03804  triosephosphate isomerase  51.85 
 
 		 255 aa  209  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4066  Triose-phosphate isomerase  51.85 
 
 		 255 aa  209  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4453  triosephosphate isomerase  51.85 
 
 		 255 aa  209  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2064  triosephosphate isomerase  48.94 
 
 		 248 aa  209  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0168982  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03753  hypothetical protein  51.85 
 
 		 255 aa  209  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4150  triosephosphate isomerase  51.85 
 
 		 255 aa  209  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4359  triosephosphate isomerase  51.85 
 
 		 255 aa  209  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.626096 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0103  triosephosphate isomerase  52.53 
 
 		 256 aa  209  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4399  triosephosphate isomerase  51.85 
 
 		 255 aa  209  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4099  triosephosphate isomerase  51.85 
 
 		 255 aa  209  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5374  triosephosphate isomerase  51.85 
 
 		 255 aa  209  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  51.87 
 
 		 254 aa  209  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  47.3 
 
 		 253 aa  208  6e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  52.11 
 
 		 250 aa  208  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4052  triosephosphate isomerase  51.85 
 
 		 255 aa  208  7e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0274  Triose-phosphate isomerase  49.09 
 
 		 265 aa  208  7e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0947  triosephosphate isomerase  49.56 
 
 		 249 aa  208  8e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3808  triosephosphate isomerase  53.88 
 
 		 255 aa  208  8e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.102844  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  49.3 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  51.69 
 
 		 248 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0717  triosephosphate isomerase  49.17 
 
 		 251 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  48.52 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  48.83 
 
 		 243 aa  206  3e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  52.36 
 
 		 251 aa  205  6e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4412  triosephosphate isomerase  50.69 
 
 		 255 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0292909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4480  triosephosphate isomerase  50.69 
 
 		 255 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  48.87 
 
 		 255 aa  204  7e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4410  triosephosphate isomerase  50.69 
 
 		 255 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4297  triosephosphate isomerase  50.69 
 
 		 255 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4327  triosephosphate isomerase  50.69 
 
 		 255 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49960  triosephosphate isomerase  52.71 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45770  triosephosphate isomerase  52.71 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1499  Triose-phosphate isomerase  49.36 
 
 		 248 aa  203  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0165539 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0775  triosephosphate isomerase  49.17 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354266  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  48.83 
 
 		 243 aa  203  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  49.07 
 
 		 257 aa  202  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  45.42 
 
 		 646 aa  202  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2838  triosephosphate isomerase  46.95 
 
 		 249 aa  202  4e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2707  triosephosphate isomerase  46.95 
 
 		 249 aa  202  5e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3352  Triose-phosphate isomerase  50.7 
 
 		 252 aa  201  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  50.96 
 
 		 251 aa  201  8e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  44.49 
 
 		 253 aa  201  8e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  48.85 
 
 		 245 aa  201  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  44.92 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1520  triosephosphate isomerase  48.39 
 
 		 272 aa  200  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128427  decreased coverage  0.0000834169 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4805  triosephosphate isomerase  50.97 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000667098 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1591  triosephosphate isomerase  51.69 
 
 		 255 aa  200  9.999999999999999e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4118  triosephosphate isomerase  51.94 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0738  Triose-phosphate isomerase  45.8 
 
 		 243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000147069  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1200  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0096  triosephosphate isomerase  51.94 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0095  triosephosphate isomerase  51.94 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371764  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000257421  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000876569  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2831  triosephosphate isomerase  48.21 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000042953  hitchhiker  0.00389109 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084878  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178614  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1087  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059681  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121721  unclonable  0.00000000000528037 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000672651  hitchhiker  0.0000521404 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1264  Triose-phosphate isomerase  45.19 
 
 		 240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  46.26 
 
 		 249 aa  199  3e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  47.48 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  48.39 
 
 		 245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 		 250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0957  triosephosphate isomerase  48.66 
 
 		 260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0345759  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0986  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 260 aa  199  5e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000192621  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  50.23 
 
 		 251 aa  199  5e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  45.19 
 
 		 251 aa  198  6e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  48.83 
 
 		 252 aa  198  6e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  47.69 
 
 		 251 aa  198  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3393  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 		 260 aa  198  6e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000164415  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  52.4 
 
 		 255 aa  198  7e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  45.7 
 
 		 650 aa  198  7.999999999999999e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  49.53 
 
 		 253 aa  197  9e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13130  triosephosphate isomerase  50.9 
 
 		 263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.751982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3565  triosephosphate isomerase  47.77 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.147919  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01285  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1003  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0343606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>