More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4942 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4942  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
133 aa  277  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00284868  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  34.23 
 
 
762 aa  67.8  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2921  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 
190 aa  63.9  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 
3145 aa  63.9  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  39.13 
 
 
1764 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
1450 aa  61.6  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  38.37 
 
 
577 aa  60.8  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  38.37 
 
 
577 aa  60.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  38.04 
 
 
589 aa  60.1  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  36.04 
 
 
688 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  35.64 
 
 
875 aa  60.1  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1598  hypothetical protein  32.67 
 
 
208 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000392317  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 
833 aa  58.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.05 
 
 
810 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  30.69 
 
 
585 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 
331 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 
718 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
291 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  37.21 
 
 
603 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  35.05 
 
 
878 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 
927 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  35 
 
 
217 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  32.74 
 
 
681 aa  56.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 
237 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 
265 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
1737 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  31 
 
 
643 aa  55.5  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 
589 aa  54.7  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23400  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 
183 aa  54.3  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000457247  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 
441 aa  53.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.78 
 
 
441 aa  53.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  34.41 
 
 
1252 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  34.41 
 
 
1252 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  41.1 
 
 
1049 aa  53.9  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  31 
 
 
462 aa  53.9  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
356 aa  53.5  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 
4079 aa  53.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  30.93 
 
 
725 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 
637 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 
593 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0915  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 
324 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0051049 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6274  predicted protein  32.05 
 
 
189 aa  53.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000285986  hitchhiker  0.0027813 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
968 aa  53.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1812  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 
189 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 
909 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2168  hypothetical protein  37.97 
 
 
399 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0957  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000843973  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.87 
 
 
565 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  32.95 
 
 
725 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 
708 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 
162 aa  51.6  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 
583 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 
739 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  36.51 
 
 
575 aa  51.2  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1949  putative PAS/PAC sensor protein  37.14 
 
 
461 aa  51.2  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.81 
 
 
249 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 
605 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 
808 aa  50.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 
448 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.81 
 
 
249 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 
685 aa  50.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  36.73 
 
 
789 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  36.96 
 
 
363 aa  50.8  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 
573 aa  50.8  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.79 
 
 
988 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1782  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 
542 aa  50.4  0.000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.300078  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  35.09 
 
 
566 aa  50.1  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 
187 aa  50.4  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.56 
 
 
632 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  31.91 
 
 
550 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.96 
 
 
286 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.9 
 
 
576 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0662  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.14 
 
 
330 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0114263  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 
732 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 
286 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  31.88 
 
 
661 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 
374 aa  50.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  27.19 
 
 
837 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  37.88 
 
 
289 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
3301 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  34 
 
 
936 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 
301 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  35.94 
 
 
1297 aa  50.1  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0965  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.44 
 
 
232 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  38.37 
 
 
290 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.99 
 
 
1034 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  30.68 
 
 
622 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  30.77 
 
 
594 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0342  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 
298 aa  48.9  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 
306 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0992  TPR repeat-containing protein  39.44 
 
 
232 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.999896  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  25.89 
 
 
576 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.85 
 
 
1056 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  29 
 
 
649 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 
1421 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  35.11 
 
 
887 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2674  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 
316 aa  49.3  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.717454  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 
292 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31 
 
 
1056 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5176  family 2 glycosyl transferase  30.69 
 
 
434 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.634801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>