93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4546 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4546  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 140 aa  286  4e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000650042  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0958  helix-turn-helix domain-containing protein  42.19 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0163  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 224 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2600  transcriptional regulator  34.29 
 
 		 423 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1626  helix-turn-helix domain protein  39.39 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.365666 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0921  transcriptional regulator, XRE family  36.25 
 
 		 260 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2073  transcriptional regulator, XRE family  28.85 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0932046  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  36.25 
 
 		 192 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2058  transcriptional repressor DicA  28.85 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.211333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0680  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 504 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0917  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 192 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4239  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 510 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0106  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 509 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2675  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 422 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0980951  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1693  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 289 aa  43.9  0.0007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0267924  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  35.16 
 
 		 504 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 211 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1178  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 508 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01539  prophage CP-9330 DicA-like protein  24.3 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0413815  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3866  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 509 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4613  DNA-binding protein  28.95 
 
 		 190 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0432  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  38.71 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000371645  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 211 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0418  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  38.71 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00527482  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01531  hypothetical protein  24.3 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0356913  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 201 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0551  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 198 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  34.85 
 
 		 238 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0622  DNA-binding protein  30.43 
 
 		 190 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.475485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0495  transcriptional regulator, XRE family  32.88 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1608  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 510 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.118934 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  30.43 
 
 		 369 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4434  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 509 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4294  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 510 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4705  transcriptional regulator, putative  37.68 
 
 		 503 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2560  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 510 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3851  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 510 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3944  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 510 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  29.27 
 
 		 248 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4059  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 510 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0584  transcriptional regulator  34.07 
 
 		 495 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 244 aa  41.6  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  32.5 
 
 		 488 aa  42  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2004  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 511 aa  41.6  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.447226  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0218  transciptional regulator  36.23 
 
 		 508 aa  41.6  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  28.97 
 
 		 163 aa  41.6  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1274  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 152 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.222413  normal  0.176639 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31160  hypothetical protein  28.79 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000126154  unclonable  8.75499e-23 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1139  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 232 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0958639 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0134  transcriptional regulator, XRE family  26.98 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000191075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4162  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 98 aa  41.2  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1555  transcriptional regulator  40 
 
 		 181 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4631  DNA-binding protein  27.63 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4400  DNA-binding protein  27.63 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4633  DNA-binding protein  27.63 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4240  DNA-binding protein  27.63 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4252  DNA-binding protein  27.63 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4333  XRE family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4740  DNA-binding protein  27.63 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0075  DNA-binding protein  33.87 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4617  DNA-binding protein  27.63 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04780  putative transcription regulator protein  34.38 
 
 		 205 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 321 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 206 aa  40.8  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05657  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  34.38 
 
 		 205 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0630  helix-turn-helix domain protein  34.15 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0405  putative HTH-type transcriptional regulator  34.62 
 
 		 504 aa  40.8  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0652706  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  29.51 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0355  hypothetical protein  35.59 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3903  transcriptional regulator, XRE family protein  34.33 
 
 		 511 aa  40.4  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2082  transcriptional regulator, XRE family  31.43 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  29.63 
 
 		 188 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4694  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 224 aa  40.4  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.607677 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4781  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00061071  normal  0.699893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4788  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 114 aa  40.4  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200631  normal  0.763075 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4441  transcriptional regulator, XRE family  31.46 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  28.74 
 
 		 185 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2151  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 64 aa  40.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.194811  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2198  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 201 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  39.34 
 
 		 200 aa  40  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2517  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 201 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5175  DNA-binding protein  33.87 
 
 		 73 aa  40  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5184  DNA-binding protein  33.87 
 
 		 73 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0791  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 528 aa  40  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2242  helix-turn-helix domain-containing protein  40.68 
 
 		 201 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.453871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>