183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3634 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3634  hydrogenase expression/formation protein HypD  100 
 
 		 367 aa  753    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4014  hydrogenase expression/formation protein HypD  53.03 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.372388  normal  0.161681 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01200  hydrogenase expression/formation protein HypD  51.15 
 
 		 370 aa  375  1e-103  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00520  hydrogenase expression/formation protein HypD  52.01 
 
 		 359 aa  377  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0308  hydrogenase expression/formation protein HypD  51.1 
 
 		 363 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0142  hydrogenase expression/formation protein HypD  52.86 
 
 		 393 aa  374  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0117  hydrogenase formation HypD protein  50.55 
 
 		 363 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0464  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.03 
 
 		 361 aa  368  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0327148  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1952  hydrogenase expression/formation protein HypD  51.66 
 
 		 363 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1076  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.28 
 
 		 362 aa  365  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.490079  normal  0.158086 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3063  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.72 
 
 		 365 aa  361  1e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454763  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0801  hydrogenase formation HypD protein  52.48 
 
 		 363 aa  360  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1643  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.29 
 
 		 373 aa  359  4e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0139  hydrogenase expression/formation protein HypD  51.06 
 
 		 360 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0327705  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3130  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.62 
 
 		 363 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3796  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.14 
 
 		 371 aa  356  3.9999999999999996e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44763  normal  0.895026 
 
 
-
 
NC_002936  DET1434  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.3 
 
 		 364 aa  355  5e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.736513  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1132  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.34 
 
 		 363 aa  354  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0974  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.14 
 
 		 371 aa  355  1e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.980322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0364  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.32 
 
 		 363 aa  353  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3878  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.07 
 
 		 365 aa  353  2.9999999999999997e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2007  hydrogenase formation HypD protein  50.86 
 
 		 368 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0795  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.03 
 
 		 377 aa  353  2.9999999999999997e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.912366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1216  hydrogenase maturation factor  47.41 
 
 		 364 aa  352  4e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2276  hydrogenase formation HypD protein  47.21 
 
 		 365 aa  352  4e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2049  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.22 
 
 		 364 aa  350  2e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1242  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.48 
 
 		 364 aa  350  3e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2778  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.34 
 
 		 363 aa  348  8e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2177  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.33 
 
 		 377 aa  347  2e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.380266 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2657  hydrogenase formation HypD protein  46.93 
 
 		 365 aa  347  2e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.554139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0472  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.75 
 
 		 384 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.623296 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4604  hydrogenase formation HypD protein  46.63 
 
 		 383 aa  345  5e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0479  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.27 
 
 		 371 aa  339  4e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.140537 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1783  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.55 
 
 		 365 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.146448  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1947  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.31 
 
 		 402 aa  337  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3210  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.43 
 
 		 377 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2595  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.99 
 
 		 369 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1762  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.98 
 
 		 367 aa  334  1e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0724  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.26 
 
 		 363 aa  333  3e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1455  hydrogenase formation HypD protein  46.4 
 
 		 362 aa  333  4e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2405  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.38 
 
 		 366 aa  333  4e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3751  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.9 
 
 		 385 aa  332  6e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3877  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.05 
 
 		 382 aa  332  7.000000000000001e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.848874  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4557  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.21 
 
 		 389 aa  329  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03910  hydrogenase formation HypD protein  46.02 
 
 		 365 aa  329  4e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0474  hydrogenase expression/formation  46.49 
 
 		 382 aa  328  9e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.264843 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2134  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.26 
 
 		 366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2180  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.26 
 
 		 366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2121  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.26 
 
 		 366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164899  normal  0.0352453 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2186  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.75 
 
 		 374 aa  327  3e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185739  normal  0.302113 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2160  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.01 
 
 		 379 aa  325  5e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.397943  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1177  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.87 
 
 		 380 aa  322  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3981  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.26 
 
 		 366 aa  322  9.000000000000001e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  0.745902 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0509  hydrogenase isoenzyme formation protein HypD  45.45 
 
 		 379 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20958  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2485  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.03 
 
 		 378 aa  321  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3010  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.05 
 
 		 373 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0121533 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2361  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.51 
 
 		 367 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255752  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4588  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.71 
 
 		 375 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3062  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.05 
 
 		 373 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0891521 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1705  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.99 
 
 		 371 aa  319  3.9999999999999996e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.340264 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1419  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.51 
 
 		 371 aa  319  3.9999999999999996e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3046  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.78 
 
 		 373 aa  319  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.845766  hitchhiker  0.0038327 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3401  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.8 
 
 		 362 aa  319  6e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2979  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.78 
 
 		 373 aa  319  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0530  hydrogenase formation HypD protein  44.67 
 
 		 361 aa  318  1e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3759  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.99 
 
 		 376 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3167  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.78 
 
 		 373 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.54116 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4509  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.25 
 
 		 364 aa  317  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629717  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2525  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.51 
 
 		 371 aa  316  5e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222339  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0537  hydrogenase formation protein HypD  44.78 
 
 		 396 aa  315  6e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02579  HypD  42.43 
 
 		 373 aa  315  8e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0960  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.43 
 
 		 373 aa  315  8e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.926062  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02544  hypothetical protein  42.43 
 
 		 373 aa  315  8e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0983  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.43 
 
 		 373 aa  315  8e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2866  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.43 
 
 		 373 aa  315  8e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08040  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.37 
 
 		 380 aa  314  9.999999999999999e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1401  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.66 
 
 		 355 aa  315  9.999999999999999e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.416582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3981  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.43 
 
 		 373 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2854  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.43 
 
 		 373 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.422409 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3148  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.43 
 
 		 373 aa  314  9.999999999999999e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3017  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.43 
 
 		 373 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1163  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.09 
 
 		 373 aa  314  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3362  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  45.69 
 
 		 379 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.203707 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3290  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.27 
 
 		 370 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138162  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2888  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.27 
 
 		 370 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.270319  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2538  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.67 
 
 		 371 aa  313  2.9999999999999996e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3912  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.54 
 
 		 358 aa  313  2.9999999999999996e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1169  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.45 
 
 		 380 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.783843  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1641  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.56 
 
 		 364 aa  311  9e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0866  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.57 
 
 		 369 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0892  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.57 
 
 		 369 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26538  normal  0.532572 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0089  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.67 
 
 		 352 aa  310  2e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1070  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.86 
 
 		 368 aa  310  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.250969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0863  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.49 
 
 		 381 aa  310  4e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.948564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0715  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.49 
 
 		 381 aa  310  4e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0389  hydrogenase formation HypD protein  43.68 
 
 		 346 aa  310  4e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.483899  hitchhiker  0.0000000115047 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3236  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.47 
 
 		 376 aa  309  5e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1264  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.27 
 
 		 367 aa  309  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2010  hydrogenase expression/formation  43.96 
 
 		 375 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.256699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3823  hydrogenase expression/formation  43.01 
 
 		 375 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786204  normal  0.0677682 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>