More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3527 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  100 
 
 
344 aa  701    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  60.42 
 
 
351 aa  422  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  62.84 
 
 
339 aa  413  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  57.1 
 
 
349 aa  408  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  58.58 
 
 
360 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  56.8 
 
 
351 aa  397  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  57.74 
 
 
347 aa  392  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  58.38 
 
 
351 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  55.52 
 
 
348 aa  390  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  57.65 
 
 
360 aa  390  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  56.65 
 
 
397 aa  390  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  53.8 
 
 
351 aa  390  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  56.27 
 
 
362 aa  388  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  55.56 
 
 
352 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  55.78 
 
 
365 aa  382  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  55.76 
 
 
382 aa  380  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  53.94 
 
 
566 aa  375  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  53.89 
 
 
350 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  54.19 
 
 
350 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  55.59 
 
 
378 aa  372  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  52.84 
 
 
372 aa  368  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  53.1 
 
 
374 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  55.31 
 
 
365 aa  368  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  55 
 
 
366 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  54.69 
 
 
366 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  54.69 
 
 
368 aa  366  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  55 
 
 
366 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  55.39 
 
 
368 aa  366  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05980  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  56.93 
 
 
360 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  51.03 
 
 
350 aa  362  7.0000000000000005e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0532  twitching motility protein  54.77 
 
 
350 aa  361  8e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  54.66 
 
 
356 aa  361  1e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  54.19 
 
 
370 aa  361  1e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  53.59 
 
 
365 aa  360  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  57.41 
 
 
403 aa  360  2e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  53.42 
 
 
366 aa  359  3e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  57.67 
 
 
367 aa  360  3e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  53.42 
 
 
366 aa  359  5e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  55.31 
 
 
365 aa  358  7e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  52.38 
 
 
375 aa  358  7e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  51.61 
 
 
347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  53.12 
 
 
372 aa  356  2.9999999999999997e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  50.3 
 
 
363 aa  355  3.9999999999999996e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  50.6 
 
 
360 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  50.6 
 
 
360 aa  355  3.9999999999999996e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  53.89 
 
 
366 aa  355  5e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  51.04 
 
 
374 aa  355  5.999999999999999e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00181  PilT1-like protein  51.62 
 
 
358 aa  353  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1035  twitching motility protein  53.57 
 
 
360 aa  350  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  51.32 
 
 
347 aa  350  3e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  52.4 
 
 
437 aa  349  4e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  51.86 
 
 
365 aa  349  4e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  52.4 
 
 
427 aa  348  6e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  51.03 
 
 
347 aa  348  6e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  52.4 
 
 
427 aa  348  9e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  54.52 
 
 
362 aa  347  1e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  52.4 
 
 
427 aa  347  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0505  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  52.94 
 
 
347 aa  346  3e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  52.5 
 
 
363 aa  345  5e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3256  twitching motility protein  51.64 
 
 
360 aa  345  1e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1126  twitching motility protein  51.45 
 
 
430 aa  344  2e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  50.15 
 
 
362 aa  343  2.9999999999999997e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1917  twitching motility protein  51.95 
 
 
360 aa  343  4e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.979204 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1054  twitching motility protein  52.2 
 
 
361 aa  342  5e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0267  pilus retraction protein PilT  51.19 
 
 
350 aa  342  5.999999999999999e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1802  twitching motility protein  52.28 
 
 
369 aa  341  1e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.579397 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  50.93 
 
 
374 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1637  twitching motility protein  50.45 
 
 
372 aa  339  4e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.601857  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1611  twitching motility protein  50.45 
 
 
372 aa  339  4e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0293  twitching motility protein  50.3 
 
 
350 aa  339  4e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0084  twitching motility protein  51.98 
 
 
357 aa  339  4e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1066  twitching motility protein  47.88 
 
 
358 aa  338  5.9999999999999996e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  51.46 
 
 
344 aa  338  7e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0067  twitching motility protein  50.74 
 
 
356 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.78052e-25 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  50.3 
 
 
345 aa  338  9.999999999999999e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  48.94 
 
 
358 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0436  twitching motility protein PilT  49.71 
 
 
356 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1695  twitching motility protein  50.76 
 
 
360 aa  337  2.9999999999999997e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  51.06 
 
 
347 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  51.17 
 
 
344 aa  335  5e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0166  twitching motility protein  50.15 
 
 
364 aa  335  5e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.197236 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  49.42 
 
 
345 aa  335  5.999999999999999e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  51.81 
 
 
346 aa  335  5.999999999999999e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  52.11 
 
 
346 aa  335  5.999999999999999e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3053  twitching motility protein  51.79 
 
 
346 aa  335  7e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39006  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  49.42 
 
 
347 aa  335  7e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1167  twitching motility protein  52.87 
 
 
375 aa  335  7.999999999999999e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.69165  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  50.29 
 
 
345 aa  335  1e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3221  twitching motility protein  50.61 
 
 
356 aa  334  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1131  twitching motility protein  51.22 
 
 
360 aa  333  2e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.809253  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  50.29 
 
 
347 aa  334  2e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3400  pilus retraction protein PilT  49.71 
 
 
356 aa  333  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  50.74 
 
 
344 aa  333  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3760  Pili biogenesis ATPase  50.6 
 
 
347 aa  333  2e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112866  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  50.74 
 
 
344 aa  333  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  51.04 
 
 
383 aa  333  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  49.71 
 
 
347 aa  332  4e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  50 
 
 
347 aa  332  4e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  50.15 
 
 
344 aa  333  4e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  49.85 
 
 
344 aa  332  6e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>