More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2827 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  100 
 
 		 393 aa  801    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  66.84 
 
 		 387 aa  515  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  65.54 
 
 		 394 aa  499  1e-140  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  60.82 
 
 		 390 aa  484  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  62.7 
 
 		 385 aa  473  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  53.6 
 
 		 377 aa  415  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  55.05 
 
 		 378 aa  413  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  54.71 
 
 		 389 aa  410  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  50.79 
 
 		 385 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  55.38 
 
 		 396 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  52.91 
 
 		 393 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  51.06 
 
 		 391 aa  389  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  49.09 
 
 		 396 aa  381  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  49.2 
 
 		 376 aa  380  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  51.84 
 
 		 390 aa  372  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  52.65 
 
 		 381 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  51.05 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  50.13 
 
 		 380 aa  370  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  52.24 
 
 		 378 aa  371  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  48.33 
 
 		 399 aa  370  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  51.59 
 
 		 390 aa  368  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  51.59 
 
 		 381 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  49.61 
 
 		 382 aa  366  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  51.32 
 
 		 381 aa  364  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  52.88 
 
 		 387 aa  364  2e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  50 
 
 		 395 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  45.27 
 
 		 394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  49.09 
 
 		 395 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  47.42 
 
 		 387 aa  352  8e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  49.21 
 
 		 391 aa  352  8e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  50 
 
 		 371 aa  351  1e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  50.87 
 
 		 346 aa  350  3e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  50.26 
 
 		 383 aa  344  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  46.61 
 
 		 395 aa  344  2e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  49.47 
 
 		 384 aa  341  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  45.85 
 
 		 396 aa  338  9.999999999999999e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  49.47 
 
 		 381 aa  334  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  52.36 
 
 		 390 aa  330  3e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  45.6 
 
 		 377 aa  327  3e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  45.09 
 
 		 373 aa  322  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  44.12 
 
 		 384 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  48.4 
 
 		 364 aa  307  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  39.9 
 
 		 381 aa  306  4.0000000000000004e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  43.78 
 
 		 373 aa  286  5e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  43.2 
 
 		 378 aa  276  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  38.22 
 
 		 377 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  41.99 
 
 		 393 aa  266  4e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  37.01 
 
 		 377 aa  262  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  36.22 
 
 		 377 aa  259  5.0000000000000005e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  35.6 
 
 		 364 aa  258  1e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  40 
 
 		 390 aa  246  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  36.46 
 
 		 389 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  36.72 
 
 		 390 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  37.6 
 
 		 390 aa  239  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  39.19 
 
 		 407 aa  239  8e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  37.37 
 
 		 388 aa  236  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  35.84 
 
 		 389 aa  233  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  35.86 
 
 		 390 aa  232  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  36.03 
 
 		 390 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  36.03 
 
 		 390 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  36.03 
 
 		 390 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  36.62 
 
 		 390 aa  230  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  35.77 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  36.53 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  34.29 
 
 		 392 aa  222  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  35.25 
 
 		 390 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  36.8 
 
 		 382 aa  203  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  31.6 
 
 		 385 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  36.04 
 
 		 382 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  32.26 
 
 		 386 aa  189  5e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  31.41 
 
 		 381 aa  189  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  33.91 
 
 		 384 aa  188  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  31.36 
 
 		 381 aa  179  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  37.77 
 
 		 366 aa  178  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  33.42 
 
 		 374 aa  175  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  34.87 
 
 		 384 aa  171  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  28.84 
 
 		 375 aa  164  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  30.83 
 
 		 390 aa  162  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  30.92 
 
 		 383 aa  158  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 383 aa  157  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  28.64 
 
 		 384 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  28.71 
 
 		 384 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  29.46 
 
 		 380 aa  144  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  29.85 
 
 		 377 aa  139  7e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  27.79 
 
 		 377 aa  139  7.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  40.72 
 
 		 369 aa  136  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  32.14 
 
 		 394 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  32.62 
 
 		 382 aa  132  9e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  33.33 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  34.1 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  30.42 
 
 		 378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  28.61 
 
 		 377 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  28.75 
 
 		 377 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  28.74 
 
 		 397 aa  126  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3006  oxidoreductase domain protein  32.62 
 
 		 347 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3257  oxidoreductase domain protein  32.71 
 
 		 347 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  30.75 
 
 		 378 aa  123  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  28.43 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  32.23 
 
 		 379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  27.37 
 
 		 396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>