More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1438 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1438  secretion protein HlyD  100 
 
 		 442 aa  842    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.16508 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1497  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.06 
 
 		 407 aa  150  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.30393  hitchhiker  0.00778895 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2117  secretion protein HlyD  33.24 
 
 		 428 aa  145  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.893928 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2246  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.9 
 
 		 413 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.489161  normal  0.829342 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.86 
 
 		 432 aa  94.4  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.77 
 
 		 448 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2366  multidrug efflux system subunit MdtA  27.21 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.67 
 
 		 467 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.21 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2216  multidrug efflux system subunit MdtA  27.21 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1567  multidrug efflux system subunit MdtA  27.21 
 
 		 455 aa  76.3  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.331208 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01979  multidrug efflux system, subunit A  26.98 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  24.01 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  26.44 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01971  hypothetical protein  26.98 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1159  multidrug efflux system subunit MdtA  26.98 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3014  multidrug efflux system subunit MdtA  26.98 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.105913 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.15 
 
 		 496 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2684  multidrug efflux system subunit MdtA  26.79 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0986  multidrug efflux system subunit MdtA  26.74 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  28.76 
 
 		 467 aa  73.2  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2312  multidrug efflux system subunit MdtA  27.05 
 
 		 413 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.92 
 
 		 496 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.68 
 
 		 509 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.24 
 
 		 381 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2363  multidrug efflux system subunit MdtA  27.69 
 
 		 413 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.67985 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2356  multidrug efflux system subunit MdtA  26.67 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3103  multidrug efflux system subunit MdtA  24.94 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3552  multidrug efflux system subunit MdtA  24.75 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1215  multidrug efflux system subunit MdtA  24.94 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.7 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1332  multidrug efflux system subunit MdtA  24.94 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.713792  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1206  multidrug efflux system subunit MdtA  26.17 
 
 		 419 aa  69.7  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0570202  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2256  multidrug efflux system subunit MdtA  26.92 
 
 		 413 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2472  multidrug efflux system subunit MdtA  26.67 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.957345 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1526  RND family efflux transporter MFP subunit  26.56 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.692168  normal  0.0164989 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.81 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  27.75 
 
 		 463 aa  67.4  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2966  multidrug efflux system subunit MdtA  26.7 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.874422  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1312  multidrug efflux system subunit MdtA  26.63 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164615  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.88 
 
 		 421 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.88 
 
 		 421 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0573  macrolide secretion protein MacA  28.57 
 
 		 455 aa  67  0.0000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000123833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0563  secretion protein HlyD  28.09 
 
 		 456 aa  66.6  0.0000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5231  HlyD family secretion protein  29.89 
 
 		 426 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.18 
 
 		 462 aa  66.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0508  secretion protein HlyD family protein  30.18 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000010598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2702  multidrug efflux system subunit MdtA  24.52 
 
 		 411 aa  65.1  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0259  RND family efflux transporter MFP subunit  26.32 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  26.4 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.98 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  27.86 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  27.36 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0242  secretion protein HlyD  26.79 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000372515  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.04 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14330  Secretion protein HlyD family  25.06 
 
 		 401 aa  63.9  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774042  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  25.26 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60760  hypothetical protein  30.48 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  25.79 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  25.25 
 
 		 331 aa  62.8  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1575  RND membrane fusion protein AcrA  25.96 
 
 		 448 aa  62.4  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.853878 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.77 
 
 		 448 aa  62  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3839  secretion protein HlyD  25.96 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  26.1 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01444  hypothetical protein  21.95 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2097  RND family efflux transporter MFP subunit  24.07 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.902105  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1967  RND family efflux transporter MFP subunit  23.86 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0310111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1083  RND family efflux transporter MFP subunit  25.85 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0380532  normal  0.959663 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.45 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2492  RND family efflux transporter subunit MFP  25.99 
 
 		 437 aa  61.2  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.311613  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  30.16 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0119  CmeA  21.86 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0710  RND family efflux transporter MFP subunit  23.24 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0695  periplasmic component of efflux system  23.01 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0380  secretion protein HlyD  26.19 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  28.46 
 
 		 509 aa  60.1  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0096  putative macrolide-specific efflux protein MacA  26.28 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4410  secretion protein HlyD family protein  26.69 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2586  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.32 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  25.7 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  34.1 
 
 		 397 aa  59.3  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0801  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.58 
 
 		 403 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0709  periplasmic component of efflux system  22.71 
 
 		 367 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2803  secretion protein HlyD  26.52 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.602838  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0330  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  30.34 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.24 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4484  hypothetical protein  23.51 
 
 		 368 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0119004 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2119  multidrug resistance protein MdtN  31.14 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1757  secretion protein HlyD  25.41 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.05 
 
 		 372 aa  58.9  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0273609  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  29.91 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  23.16 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.16 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00317162  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  28.3 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0942  acriflavine resistance protein E  21.35 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  22.96 
 
 		 431 aa  58.2  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0558  secretion protein HlyD  25.14 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177986  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  28.57 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0760  hypothetical protein  22.71 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>