More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1220 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1220  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 399 aa  801    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0163733  hitchhiker  0.0019262 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2220  TPR repeat-containing protein  34.33 
 
 		 430 aa  222  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1642  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 		 352 aa  90.5  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0305016  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 		 649 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.66 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  26.7 
 
 		 725 aa  77.4  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  24.73 
 
 		 1694 aa  76.6  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 		 711 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 465 aa  75.1  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  25.09 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  24.32 
 
 		 1979 aa  74.7  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  25.27 
 
 		 462 aa  74.7  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  25.11 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  26.05 
 
 		 417 aa  72.8  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 		 593 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.59 
 
 		 878 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 3035 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 3145 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 762 aa  70.9  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.19 
 
 		 810 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.51 
 
 		 742 aa  70.1  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 		 1094 aa  70.1  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  30.3 
 
 		 733 aa  70.1  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 		 1192 aa  70.1  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.74 
 
 		 1056 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_002950  PG2200  TPR domain-containing protein  27.68 
 
 		 695 aa  68.9  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  22.55 
 
 		 4079 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.48 
 
 		 1056 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 		 808 aa  68.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0580  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.79 
 
 		 1022 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  25.44 
 
 		 4489 aa  68.6  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  24.25 
 
 		 605 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  22.47 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  22.74 
 
 		 594 aa  67.8  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  21.86 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  24.03 
 
 		 562 aa  67.8  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 		 1276 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 		 792 aa  67.4  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1773  TPR repeat-containing protein  21.82 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.6 
 
 		 988 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  23.23 
 
 		 764 aa  67.4  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.92 
 
 		 1737 aa  66.2  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  24.83 
 
 		 706 aa  66.6  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 		 955 aa  65.9  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 1827 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  27.56 
 
 		 875 aa  65.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  22.31 
 
 		 676 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 		 662 aa  65.5  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  23.31 
 
 		 1138 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  23.38 
 
 		 828 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 1276 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.13 
 
 		 784 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  24.41 
 
 		 804 aa  65.1  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  25.34 
 
 		 448 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  23.11 
 
 		 1067 aa  64.7  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 		 750 aa  64.3  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.45 
 
 		 818 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.42 
 
 		 632 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 		 1297 aa  63.9  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  23.38 
 
 		 828 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 754 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.62 
 
 		 784 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 		 1406 aa  63.2  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.35 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0420  TPR-domain containing protein  31.5 
 
 		 791 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  26.97 
 
 		 299 aa  62.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3735  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 707 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2796  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 		 621 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 		 754 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  21.17 
 
 		 1056 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.4 
 
 		 1676 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  24.66 
 
 		 706 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.01 
 
 		 778 aa  62  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 740 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.76 
 
 		 629 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 		 681 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  25.09 
 
 		 837 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  29.38 
 
 		 725 aa  61.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 3560 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  21.89 
 
 		 1421 aa  61.6  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  24.82 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  23.44 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6467  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.69 
 
 		 511 aa  60.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  23.27 
 
 		 1154 aa  60.5  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 		 3172 aa  60.5  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  25.62 
 
 		 1764 aa  60.1  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 		 713 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  27.45 
 
 		 3301 aa  59.7  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  27.5 
 
 		 564 aa  59.7  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  25.29 
 
 		 626 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  23.44 
 
 		 486 aa  59.7  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  22.22 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.17 
 
 		 839 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>