More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0264 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0264  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 256 aa  520  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00966775  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1022  IclR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.767316  normal  0.65898 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2422  IclR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  29.51 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2600  IclR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 249 aa  89.4  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.248836 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  25.5 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  30.22 
 
 		 251 aa  86.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1798  regulatory protein IclR  26.19 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4369  IclR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  27.95 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1594  IclR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1621  IclR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706324  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1646  IclR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0462  regulatory proteins, IclR  29.55 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  26.46 
 
 		 252 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0686  regulatory protein, IclR  28.82 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  31.69 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  23.67 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  22.45 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0868  IclR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  25.41 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0596  regulatory protein, IclR  31.19 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.691457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  23.9 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  25.49 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3835  transcriptional regulator, IclR family  27.9 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.790714  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1042  IclR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00956933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  23.98 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  22.67 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4894  regulatory proteins, IclR  29.85 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  23.63 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  28.67 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1596  regulatory proteins, IclR  28.12 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.134859 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  26.85 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  27.31 
 
 		 261 aa  72  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  22.48 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0440  IclR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0373  IclR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3829  transcriptional regulator, IclR family  26.94 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4215  regulatory proteins, IclR  32.84 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3839  IclR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0041  IclR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  25 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  25.1 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  24.34 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0681  regulatory proteins, IclR  31.39 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5473  regulatory protein IclR  25.12 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  26.67 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0439  transcriptional regulator IclR  27.43 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  25.3 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  27.68 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2713  IclR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0235576  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  28.85 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3524  transcriptional regulator, IclR family  29.82 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2967  IclR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  26.14 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5822  IclR family transcriptional regulator  24 
 
 		 294 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0813  transcriptional regulator, IclR family  25.23 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  26.46 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 265 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0297  IclR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  24.11 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  25.43 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5040  transcriptional regulator, IclR family  29.3 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0605  regulatory proteins, IclR  28.66 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2586  IclR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.556667  normal  0.947412 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2369  regulatory proteins, IclR  24.77 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3872  regulatory protein, IclR  26.29 
 
 		 245 aa  67  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.207868  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1993  IclR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 275 aa  67  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.080856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  24 
 
 		 259 aa  67  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1546  IclR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00070993  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6219  IclR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0162  transcriptional regulator, IclR family  29.39 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3326  transcriptional regulator, IclR family  27.57 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.021393  hitchhiker  0.00795692 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  30.48 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  30.99 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  24.45 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  29.34 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1583  IclR-type transcriptional regulator  28.64 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0417  IclR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0284942  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  29.61 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  25.51 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4521  IclR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.948737 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 550 aa  65.9  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  31.77 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  19.34 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20720  transcriptional regulator  26.64 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.439734  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1123  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  26.11 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25.5 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25.5 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3302  transcriptional regulator, IclR family  25.79 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>