221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2840 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2840  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 298 aa  610  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1206  transcriptional regulator, GntR family  73.91 
 
 		 309 aa  460  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1381  transcriptional regulator, GntR family  55.44 
 
 		 297 aa  330  2e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05438  transcription regulator protein  35.35 
 
 		 311 aa  186  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.185679  normal  0.066253 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0364  GntR domain-containing protein  36.88 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.225657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3872  GntR family transcriptional regulator  35.13 
 
 		 311 aa  159  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.600353  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_003296  RS00705  putative transcription regulator protein  34.42 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0312291  normal  0.40859 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3072  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4554  GntR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 325 aa  145  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.189938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6879  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 297 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0423677  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1000  transcriptional regulator, GntR family  31.92 
 
 		 313 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.801369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6189  transcriptional regulator, GntR family  33.57 
 
 		 298 aa  143  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.35302  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04697  putative transcription regulator protein  34.06 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.650808  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4258  GntR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1033  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000187092  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5871  transcriptional regulator GntR family  25.33 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0453  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5826  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000644703 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1603  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1281  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  27.04 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  29.38 
 
 		 233 aa  58.9  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  29.91 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5236  transcriptional regulator, GntR family  23.68 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3939  regulatory protein, GntR  26.6 
 
 		 359 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0992  GntR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0854  GntR domain protein  28.07 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00310833  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1402  GntR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 341 aa  55.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  28.95 
 
 		 228 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2360  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 247 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68775 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  25.26 
 
 		 228 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3969  GntR family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 323 aa  53.9  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  31.98 
 
 		 227 aa  53.5  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0549  GntR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 255 aa  53.5  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 242 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 239 aa  53.1  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3501  GntR domain-containing protein  30.05 
 
 		 234 aa  52.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 247 aa  53.1  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 255 aa  53.1  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1419  GntR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 231 aa  52.8  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.17694 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0031  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 230 aa  52.4  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  21.67 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 242 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 242 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 242 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  34.82 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5539  regulatory protein GntR HTH  24.88 
 
 		 237 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4461  GntR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 230 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5798  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 234 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  27.23 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3370  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 323 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  27.07 
 
 		 245 aa  50.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1099  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 231 aa  50.8  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.322979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 226 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08590  transcriptional regulator  27.08 
 
 		 235 aa  50.4  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.713725  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4205  transcriptional regulator, GntR family  25.99 
 
 		 333 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 230 aa  50.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  28.17 
 
 		 238 aa  50.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1267  GntR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 235 aa  50.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  27.98 
 
 		 235 aa  50.1  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 241 aa  49.7  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3471  GntR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 259 aa  49.7  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2731  GntR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 261 aa  50.1  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000186795  normal  0.0139063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7701  transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 		 212 aa  49.7  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788387  normal  0.631599 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3756  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 243 aa  49.3  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 246 aa  49.3  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2705  GntR domain protein  27.1 
 
 		 234 aa  49.3  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  27.88 
 
 		 234 aa  49.3  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2569  GntR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 251 aa  49.3  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 246 aa  49.3  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5768  GntR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 221 aa  48.9  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 233 aa  49.3  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2114  transcription regulator protein  26.67 
 
 		 243 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2675  transcriptional regulator GntR  25.48 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 230 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3029  GntR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 233 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  25.76 
 
 		 239 aa  48.9  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3949  transcriptional regulator, GntR family  26.06 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5148  GntR domain protein  25.88 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178203  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2728  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 218 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.246809  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  26.14 
 
 		 234 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2539  transcriptional regulator  27.54 
 
 		 229 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.824223  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  29 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0236  GntR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 228 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4561  GntR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 262 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 242 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4672  GntR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 343 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.626925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0185  transcriptional regulator, GntR family  30.22 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.27943  normal  0.15963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>