250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2423 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 378 aa  768    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  52.59 
 
 		 410 aa  382  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  51.91 
 
 		 376 aa  378  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  51.77 
 
 		 376 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  46.34 
 
 		 381 aa  326  5e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  41.07 
 
 		 384 aa  276  5e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  39.95 
 
 		 384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  37.57 
 
 		 372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  39.36 
 
 		 384 aa  272  7e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  39.73 
 
 		 383 aa  268  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  39.3 
 
 		 384 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  40.37 
 
 		 379 aa  266  5.999999999999999e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  36.63 
 
 		 380 aa  263  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  36.17 
 
 		 380 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  38.03 
 
 		 392 aa  260  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  37.53 
 
 		 387 aa  259  6e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  40.43 
 
 		 383 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  41.27 
 
 		 389 aa  255  8e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  38.87 
 
 		 376 aa  252  6e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  39.84 
 
 		 383 aa  249  8e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  39.84 
 
 		 383 aa  248  8e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  37.03 
 
 		 367 aa  247  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  35.81 
 
 		 371 aa  248  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  37.8 
 
 		 382 aa  247  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  38.33 
 
 		 382 aa  246  3e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  39.32 
 
 		 379 aa  247  3e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  39.57 
 
 		 386 aa  244  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4504  lipid-A-disaccharide synthase  38.7 
 
 		 397 aa  244  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  34.93 
 
 		 368 aa  242  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  38.69 
 
 		 388 aa  239  5e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  38.36 
 
 		 377 aa  239  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  37.17 
 
 		 388 aa  238  1e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  37.17 
 
 		 376 aa  237  2e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  35.39 
 
 		 370 aa  238  2e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  37.77 
 
 		 388 aa  236  4e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  37.11 
 
 		 382 aa  235  8e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  39.14 
 
 		 380 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  34.56 
 
 		 378 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  38.48 
 
 		 392 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  36.93 
 
 		 375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  36.93 
 
 		 375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  35.45 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  38.22 
 
 		 378 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  36.65 
 
 		 375 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  35.96 
 
 		 377 aa  231  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  38.42 
 
 		 375 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  37.96 
 
 		 378 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  37.56 
 
 		 385 aa  231  2e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  36.1 
 
 		 394 aa  229  4e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  36.1 
 
 		 394 aa  229  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  39.41 
 
 		 380 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  35.29 
 
 		 384 aa  229  6e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  34.66 
 
 		 384 aa  229  7e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2967  lipid-A-disaccharide synthase  36.6 
 
 		 382 aa  228  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0634208  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  39.7 
 
 		 376 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  36.22 
 
 		 372 aa  228  1e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  35.14 
 
 		 382 aa  228  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1079  lipid-A-disaccharide synthase  36.1 
 
 		 394 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3347  lipid-A-disaccharide synthase  36.84 
 
 		 383 aa  227  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0192832  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  33.95 
 
 		 389 aa  225  9e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  33.94 
 
 		 380 aa  225  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0954  lipid-A-disaccharide synthase  35.77 
 
 		 383 aa  224  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00185677  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  37.31 
 
 		 385 aa  224  1e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  36.05 
 
 		 383 aa  224  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  34.12 
 
 		 383 aa  222  7e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1224  lipid-A-disaccharide synthase  33.94 
 
 		 411 aa  222  8e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  36.36 
 
 		 385 aa  222  8e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  36.36 
 
 		 385 aa  222  8e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  33.51 
 
 		 379 aa  221  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  41.35 
 
 		 380 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  36.39 
 
 		 385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  37.46 
 
 		 384 aa  220  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  35.47 
 
 		 402 aa  220  3e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  34.86 
 
 		 388 aa  220  3e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  30.79 
 
 		 378 aa  219  5e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  39.08 
 
 		 377 aa  219  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  34.63 
 
 		 388 aa  219  7e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  36.31 
 
 		 393 aa  218  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  32.45 
 
 		 384 aa  218  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  35.75 
 
 		 380 aa  218  1e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3421  lipid-A-disaccharide synthase  36.47 
 
 		 382 aa  217  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000156785  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  36.97 
 
 		 385 aa  218  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0184  lipid-A-disaccharide synthase  36.47 
 
 		 382 aa  217  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000688697  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  35.47 
 
 		 383 aa  218  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0186  lipid-A-disaccharide synthase  36.47 
 
 		 382 aa  217  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000405274  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00180  lipid-A-disaccharide synthase  36.47 
 
 		 382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000177089  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0175  lipid-A-disaccharide synthase  36.47 
 
 		 382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00130827  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  36.65 
 
 		 419 aa  217  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00179  hypothetical protein  36.47 
 
 		 382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000149064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3478  lipid-A-disaccharide synthase  36.47 
 
 		 382 aa  216  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  normal  0.0362862 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0192  lipid-A-disaccharide synthase  36.47 
 
 		 382 aa  216  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.103812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  35.65 
 
 		 398 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0193  lipid-A-disaccharide synthase  36.17 
 
 		 382 aa  216  5e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000445848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0720  lipid-A-disaccharide synthase  37.31 
 
 		 382 aa  215  8e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0165687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  35.65 
 
 		 398 aa  215  8e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  35.65 
 
 		 398 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  35.65 
 
 		 392 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  35.01 
 
 		 385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0267  lipid-A-disaccharide synthase  36.17 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0251  lipid-A-disaccharide synthase  36.17 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.380491  normal  0.659788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>