92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1710 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 222 aa  453  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  72.52 
 
 		 229 aa  340  1e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  72.52 
 
 		 229 aa  337  9.999999999999999e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  71.62 
 
 		 229 aa  332  3e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  47.4 
 
 		 208 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  45.79 
 
 		 209 aa  179  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  43.84 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  43.84 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  41.29 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  43.84 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  43.81 
 
 		 194 aa  160  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  42.36 
 
 		 244 aa  159  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  42.36 
 
 		 216 aa  157  8e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  42.36 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  41.87 
 
 		 216 aa  156  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  43.81 
 
 		 193 aa  155  4e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  44.33 
 
 		 192 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  42.78 
 
 		 193 aa  151  8.999999999999999e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  43.81 
 
 		 192 aa  150  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  40.47 
 
 		 215 aa  148  5e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  41.35 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  41.35 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  41.75 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  42.02 
 
 		 195 aa  142  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  41.75 
 
 		 195 aa  142  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  39.04 
 
 		 197 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  38.86 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  40.43 
 
 		 195 aa  139  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  38.86 
 
 		 219 aa  138  4.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  37.97 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  38.57 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  37.95 
 
 		 197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  39.89 
 
 		 207 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  36.19 
 
 		 215 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  36.19 
 
 		 215 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  35.86 
 
 		 208 aa  132  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  35.48 
 
 		 222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  40.72 
 
 		 191 aa  132  6e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  35.71 
 
 		 201 aa  131  6.999999999999999e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  35.68 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  34.56 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  34.1 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  34.48 
 
 		 201 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  35.15 
 
 		 201 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  36.36 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  37.1 
 
 		 195 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  35.08 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  33 
 
 		 203 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  33 
 
 		 203 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  35.38 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  34.83 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  34.92 
 
 		 196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  34.83 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  33.67 
 
 		 219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  36.22 
 
 		 190 aa  105  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  36.22 
 
 		 190 aa  105  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  35.83 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  31.75 
 
 		 212 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  38.06 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  33.17 
 
 		 196 aa  99.8  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  34.59 
 
 		 193 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  36.67 
 
 		 197 aa  99.4  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  27.5 
 
 		 201 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  31.75 
 
 		 194 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  32.07 
 
 		 202 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  30.3 
 
 		 193 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  33.91 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  40.65 
 
 		 162 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  36.88 
 
 		 148 aa  87.8  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  29.69 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1191  Resolvase domain protein  25.98 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1218  resolvase domain protein  26.23 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  34.03 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12900  resolvase  33.15 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0601752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0196  putative site-specific integrase-resolvase, degenerate  46.03 
 
 		 63 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000193839  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  36.63 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3461  regulatory protein, MerR  37.21 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0727  transposon resolvase  49.06 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2084  regulatory protein MerR  40 
 
 		 94 aa  50.4  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2995  N-6 DNA methylase  48.28 
 
 		 707 aa  49.3  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00439445  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1891  transposase OrfA  30.56 
 
 		 74 aa  48.5  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2258  resolvase domain-containing protein  31.94 
 
 		 74 aa  48.5  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.216039  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1467  site-specific recombinase, putative  30 
 
 		 551 aa  45.4  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00705906  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1250  resolvase  37.5 
 
 		 524 aa  45.4  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0886  mercuric resistance operon regulatory protein  40.45 
 
 		 119 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.374839  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4449  mercuric resistance operon regulatory protein  40.45 
 
 		 119 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00937003  normal  0.868186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1189  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 156 aa  42.4  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6360  transcriptional regulator, MerR family  41.51 
 
 		 152 aa  42.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4123  OrfB family transposase  53.66 
 
 		 121 aa  42  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00660809  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5382  transcriptional regulator, MerR family  53.85 
 
 		 301 aa  42  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0923  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 119 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190958  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1960  site-specific integrase-resolvase-like  32.95 
 
 		 147 aa  41.6  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.4652  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>