232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1663 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1663  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 		 445 aa  895    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.861892  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1712  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  33.87 
 
 		 435 aa  226  6e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.661952  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2347  lipopolysaccharide biosynthesis  23.28 
 
 		 426 aa  109  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000937745  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.82 
 
 		 474 aa  103  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  28.53 
 
 		 804 aa  101  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3001  lipopolysaccharide biosynthesis  50.54 
 
 		 234 aa  90.5  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.28 
 
 		 720 aa  87.4  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4108  lipopolysaccharide biosynthesis protein  59.15 
 
 		 221 aa  87  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201794 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2880  lipopolysaccharide biosynthesis  26.98 
 
 		 487 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  25.25 
 
 		 745 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3388  lipopolysaccharide biosynthesis protein  44.09 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  24.64 
 
 		 753 aa  83.6  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  24.78 
 
 		 790 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3275  lipopolysaccharide biosynthesis protein  42.39 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000161203  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2364  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.95 
 
 		 507 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2733  chain length determinant protein  25.58 
 
 		 475 aa  79.7  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2274  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.42 
 
 		 315 aa  79.7  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.302253  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  23.6 
 
 		 721 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  23.27 
 
 		 736 aa  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2236  lipopolysaccharide biosynthesis protein  47.83 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0452  chain length determinant protein  40.66 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000687641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  36.54 
 
 		 464 aa  76.6  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1984  polysaccharide chain length determinant protein, putative  24.42 
 
 		 490 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5553  capsular polysaccharide biosynthesis  43.53 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000105771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0464  capsule chain length determinant protein  39.56 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000492666  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1770  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  23.32 
 
 		 499 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5399  chain length determinant protein  43.48 
 
 		 247 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0873019  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5452  chain length regulator  42.35 
 
 		 247 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00443539  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5074  lipopolysaccharide biosynthesis protein  38.3 
 
 		 247 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4959  chain length regulator (capsular polysaccharide biosynthesis)  42.35 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000799386  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5397  capsular polysaccharide biosynthesis  55.17 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.65 
 
 		 477 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.704444  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  22.58 
 
 		 737 aa  68.9  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  22.65 
 
 		 772 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0737  chain length determinant protein  27.19 
 
 		 478 aa  67.8  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  40 
 
 		 727 aa  68.2  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1179  lipopolysaccharide biosynthesis protein  39.81 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3191  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.61 
 
 		 477 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  21.83 
 
 		 734 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  26.01 
 
 		 743 aa  66.6  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2477  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  22.25 
 
 		 499 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0659  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.16 
 
 		 671 aa  65.9  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.79 
 
 		 642 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49921  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  22.52 
 
 		 779 aa  66.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  24.66 
 
 		 737 aa  66.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  21.19 
 
 		 806 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  46.97 
 
 		 730 aa  64.3  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  24.26 
 
 		 711 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0285  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.5 
 
 		 643 aa  64.7  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0918  capsule chain length determinant protein  42.03 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000182566  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  25.34 
 
 		 726 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  25.34 
 
 		 726 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  25.34 
 
 		 726 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  24.32 
 
 		 759 aa  62.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5769  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.94 
 
 		 778 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2029  lipopolysaccharide biosynthesis  22.8 
 
 		 518 aa  62.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.911023  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  25.34 
 
 		 726 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  25.34 
 
 		 726 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  25.34 
 
 		 726 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  25.34 
 
 		 726 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  25.34 
 
 		 726 aa  62.8  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0845  capsular exopolysaccharide family  23.58 
 
 		 784 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3269  lipopolysaccharide biosynthesis protein  38.89 
 
 		 223 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.316861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  24 
 
 		 741 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  24.66 
 
 		 739 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  33.09 
 
 		 740 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  44.12 
 
 		 529 aa  61.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2474  lipopolysaccharide biosynthesis  22.27 
 
 		 499 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2652  lipopolysaccharide biosynthesis  34.78 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  38.83 
 
 		 756 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  24.57 
 
 		 797 aa  60.5  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  23.43 
 
 		 872 aa  60.1  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  37.93 
 
 		 730 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1878  lipopolysaccharide biosynthesis  26.15 
 
 		 466 aa  59.7  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.950622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  20.84 
 
 		 731 aa  59.7  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  24.41 
 
 		 789 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  29.75 
 
 		 496 aa  58.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  23.57 
 
 		 802 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  37.63 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  35.63 
 
 		 732 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0978  lipopolysaccharide biosynthesis  24.14 
 
 		 509 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2020  lipopolysaccharide biosynthesis  27.7 
 
 		 530 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.607405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  25.36 
 
 		 722 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  22.28 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  23.99 
 
 		 739 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  28.57 
 
 		 734 aa  57.8  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  23.99 
 
 		 739 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  23.99 
 
 		 739 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4032  PEP-CTERM locus polysaccharide chain length determinant  30.39 
 
 		 507 aa  57.4  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077437  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  25.8 
 
 		 723 aa  57.4  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  41.18 
 
 		 750 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3667  lipopolysaccharide biosynthesis protein  50 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1354  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.13 
 
 		 463 aa  55.8  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  23.08 
 
 		 739 aa  56.2  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  24.14 
 
 		 755 aa  56.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.16 
 
 		 800 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22890  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.1 
 
 		 380 aa  56.2  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.68 
 
 		 741 aa  56.2  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0149  chain length determinant protein  39.78 
 
 		 472 aa  55.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22388  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  27.91 
 
 		 770 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>