More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0006 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0006  silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 271 aa  557  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.030337 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2049  Silent information regulator protein Sir2  60.58 
 
 		 276 aa  332  5e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044542  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5523  silent information regulator protein Sir2  58.65 
 
 		 273 aa  315  4e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0448394  normal  0.0436843 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2765  silent information regulator protein Sir2  59.84 
 
 		 285 aa  297  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2799  silent information regulator protein Sir2  54.98 
 
 		 282 aa  293  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4831  silent information regulator protein Sir2  56.87 
 
 		 269 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.588637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0813  silent information regulator protein Sir2  55.85 
 
 		 297 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1518  Sir2 family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 343 aa  280  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000624517  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0803  silent information regulator protein Sir2  55.85 
 
 		 273 aa  278  9e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1312  Silent information regulator protein Sir2  51.33 
 
 		 274 aa  276  2e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2165  Sir2 family transcriptional regulator  54.34 
 
 		 450 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3116  Sir2 family transcriptional regulator  54.34 
 
 		 351 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2035  Sir2 family transcriptional regulator  54.34 
 
 		 416 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0745  Sir2 family transcriptional regulator  54.34 
 
 		 416 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2578  Sir2 family transcriptional regulator  54.34 
 
 		 416 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3035  NAD-dependent deacetylase  54.34 
 
 		 343 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365939  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2452  silent information regulator protein Sir2  56.69 
 
 		 290 aa  275  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0906  silent information regulator protein Sir2  55.09 
 
 		 288 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.737005 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3089  NAD-dependent deacetylase  53.58 
 
 		 416 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0465  silent information regulator protein Sir2  55.09 
 
 		 289 aa  272  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0944  silent information regulator protein Sir2  55.09 
 
 		 289 aa  272  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35400  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  52.43 
 
 		 273 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2808  Silent information regulator protein Sir2  52.55 
 
 		 280 aa  267  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0484605  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4046  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  55.42 
 
 		 290 aa  265  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1402  Silent information regulator protein Sir2  52.19 
 
 		 277 aa  263  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472225 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0913  silent information regulator protein Sir2  50.74 
 
 		 274 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186981  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0024  Sir2 family transcriptional regulator  52 
 
 		 255 aa  252  6e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361903 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3087  Sir2 family transcriptional regulator  50 
 
 		 275 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0397  silent information regulator protein Sir2  49.44 
 
 		 279 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2770  Silent information regulator protein Sir2  49.08 
 
 		 278 aa  249  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0919  Silent information regulator protein Sir2  45.62 
 
 		 283 aa  248  5e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0338  Silent information regulator protein Sir2  54.81 
 
 		 256 aa  249  5e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227897  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3520  silent information regulator protein Sir2  49.64 
 
 		 280 aa  240  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2043  silent information regulator protein Sir2  46.52 
 
 		 272 aa  237  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000115379  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4302  silent information regulator protein Sir2  52.17 
 
 		 289 aa  235  7e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.421117 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0825  anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuA  47.47 
 
 		 272 aa  234  8e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000209586  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0890  NAD-dependent protein deacetylase (SIR2 family), putative  44.4 
 
 		 275 aa  229  4e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0094897  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0817  silent information regulator protein Sir2  44.24 
 
 		 350 aa  216  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5036  Silent information regulator protein Sir2  28.35 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  32.26 
 
 		 249 aa  92.4  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  31.75 
 
 		 244 aa  92.4  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  32.28 
 
 		 249 aa  90.1  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1313  phosphatase  28 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703264 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  33.51 
 
 		 251 aa  88.6  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  31.95 
 
 		 246 aa  85.1  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  32.95 
 
 		 244 aa  85.5  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  29.48 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1847  NAD-dependent deacetylase  30.27 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.54805e-22  decreased coverage  0.00894214 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  27.99 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  30.34 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01782  SIR2 family histone deacetylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09210)  32.31 
 
 		 320 aa  82  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0364048 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0397  silent information regulator protein Sir2  29.53 
 
 		 270 aa  82  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.470368  hitchhiker  0.0010644 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  31.38 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  26.1 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  29.05 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4029  silent information regulator protein Sir2  26.42 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0118269  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  31.11 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  30.9 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  32 
 
 		 259 aa  78.6  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4171  Silent information regulator protein Sir2  25.61 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0151723  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  26.01 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4145  Silent information regulator protein Sir2  25.61 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2432  hypothetical protein  25.77 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928742 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  30.85 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1359  silent information regulator protein Sir2  26.84 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0689  NAD-dependent deacetylase  25.81 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  26.47 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  30.34 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11190  conserved hypothetical protein  28.36 
 
 		 612 aa  74.7  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.650799  normal  0.436192 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  31.75 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0653  hypothetical protein  25.51 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0671  hypothetical protein  23.63 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.40153e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  28.02 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35457  transcriptional regulatory protein  26.27 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0738163  normal  0.450522 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33190  NAD-dependent deacetylase  28.26 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  29.6 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  29.51 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1401  Silent information regulator protein Sir2  29.26 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0218049 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1336  Sir2 family regulator  28.57 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.690541  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48810  NAD-dependent deacetylase  26.14 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.831332  hitchhiker  0.00000000423039 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4088  silent information regulator protein Sir2  29.78 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000992713  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  28.98 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  27.5 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0362  Silent information regulator protein Sir2  28.57 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  25.62 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  29.94 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  30.51 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1612  Silent information regulator protein Sir2  31.89 
 
 		 260 aa  72  0.000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  27.5 
 
 		 249 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  33.08 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  30.51 
 
 		 248 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  29.41 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3228  silent information regulator protein Sir2  26.36 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120892  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2262  silent information regulator protein Sir2  31.69 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.695636 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  28.21 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4181  NAD-dependent deacetylase  25.52 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000834887  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  27.02 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  27.92 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1453  NAD-dependent deacetylase  24 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0321606  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  25.18 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>