147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4061 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4061  Surfeit locus 1 family protein  100 
 
 		 237 aa  474  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.293936 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2219  Surfeit locus 1 family protein  65.71 
 
 		 282 aa  278  6e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127472  normal  0.185361 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2269  Surfeit locus 1 family protein  63.72 
 
 		 269 aa  278  7e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2779  Surfeit locus 1 family protein  63.27 
 
 		 269 aa  275  5e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.764047 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4850  Surfeit locus 1 family protein  54.98 
 
 		 233 aa  238  9e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0599  Surfeit locus 1  53.81 
 
 		 278 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4050  Surfeit locus 1 family protein  60 
 
 		 285 aa  229  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0238  Surfeit protein  56.25 
 
 		 278 aa  224  6e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1735  Surfeit locus 1 family protein  55.42 
 
 		 261 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7139  Surfeit locus 1 family protein  50.7 
 
 		 263 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.503615  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4774  Surfeit locus 1 family protein  56.93 
 
 		 287 aa  215  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4333  Surfeit locus 1 family protein  55.61 
 
 		 244 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.994849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4702  Surfeit locus 1 family protein  55.61 
 
 		 229 aa  211  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.134361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2034  putative SURF1 family protein  58.57 
 
 		 281 aa  210  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5731  Surfeit locus 1 family protein  58.45 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.440846  normal  0.0198979 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4368  Surfeit locus 1 family protein  49.08 
 
 		 251 aa  206  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0528  SurF1 family protein  50 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3555  Surfeit locus 1 family protein  49.79 
 
 		 252 aa  202  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1504  Surfeit locus 1  52.88 
 
 		 233 aa  201  7e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.323689  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6212  SurF1 family protein  46.4 
 
 		 250 aa  201  7e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0458  SurF1 family protein  49.57 
 
 		 253 aa  201  9e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5989  Surfeit locus 1 family protein  52.02 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0076  SurF1 family protein  43.57 
 
 		 268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.219165  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5104  Surfeit locus 1 family protein  52 
 
 		 230 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.009439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0723  Surfeit locus 1 family protein  43.53 
 
 		 247 aa  162  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  43.05 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  40.99 
 
 		 256 aa  155  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0026  Surfeit locus 1 family protein  41.71 
 
 		 254 aa  152  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13352  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0267  Surfeit locus 1 family protein  41.48 
 
 		 253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2342  Surfeit locus 1 family protein  42.61 
 
 		 253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3256  Surfeit locus 1 family protein  40.09 
 
 		 256 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933698 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2288  Surfeit locus 1  38.29 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4641  Surfeit locus 1 family protein  42.42 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136929  normal  0.114046 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0479  SurF1 family protein  38.43 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0474  SurF1 family protein  38.43 
 
 		 249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.901732  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1250  Surfeit locus 1 family protein  45.28 
 
 		 247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0588  Surfeit locus 1 family protein  39.41 
 
 		 264 aa  132  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0160113  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  36.24 
 
 		 246 aa  126  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0747  Surfeit locus 1  35.19 
 
 		 250 aa  123  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00346081  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3456  Surfeit locus 1  34.65 
 
 		 249 aa  122  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4581  surfeit protein  34.63 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1048  cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  38.57 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.520132  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0768  surfeit locus 1  31.22 
 
 		 250 aa  118  9e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0821  putative surfeit 1  34.51 
 
 		 268 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0526  Surfeit locus 1 family protein  36.41 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0259384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4794  Surfeit locus 1  32.76 
 
 		 259 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0906  Surfeit locus 1 family protein  32.46 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0610  Surfeit locus 1 family protein  35.34 
 
 		 244 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0835  putative surfeit 1 protein  34.25 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0650  Surfeit locus 1 family protein  34.09 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767888  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1145  hypothetical protein  32.1 
 
 		 233 aa  99  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0619  hypothetical protein  33.03 
 
 		 223 aa  96.3  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1830  Surf1 protein  32.13 
 
 		 223 aa  92.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0479  SURF1 protein  32.13 
 
 		 223 aa  92  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04753  COX1 assembly protein Shy1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06340)  29.41 
 
 		 324 aa  89.7  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4316  SURF1 protein  29.57 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3150  SURF1 family protein  31.51 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2163  hypothetical protein  33.48 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00150  mitochondrial protein required for respiration, putative  29.08 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303199  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2331  SURF1 family protein  28.44 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.486362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  30.23 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  38.17 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  29.27 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0869  hypothetical protein  23.74 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  31 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  30.29 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  29.72 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0873  putative SURF1 family protein  29.06 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  29.72 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  29.72 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  29.72 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  29.72 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  30.23 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  29.72 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  33.04 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0189  SURF1 family protein  28.17 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  30.71 
 
 		 245 aa  62  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  29.13 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  28.3 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3523  hypothetical protein  33.58 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.766097 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3924  hypothetical protein  28.57 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00286071  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0828  hypothetical protein  30.08 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.315818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1681  putative transmembrane cytochrome oxidase  30.43 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  27.78 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  29.02 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  29.26 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1248  hypothetical protein  25.52 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1081  SURF1 family protein  25.88 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.5204  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1251  putative transmembrane cytochrome oxidase  29.19 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.781859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  29.91 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4385  putative transmembrane cytochrome oxidase  28.96 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  29.71 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  28.21 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3902  hypothetical protein  31.72 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00331503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  29.68 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1413  hypothetical protein  28.46 
 
 		 294 aa  55.1  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517061  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  28.39 
 
 		 347 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  32.89 
 
 		 303 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  31 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55665  mitochondrial protein involved in respiration  27.12 
 
 		 359 aa  54.7  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.585569  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>