More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3273 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3273  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 826 aa  1678    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480033  normal  0.0611881 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  44.38 
 
 		 828 aa  679    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  48.06 
 
 		 840 aa  706    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  43.26 
 
 		 828 aa  676    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  43.03 
 
 		 825 aa  657    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  40.33 
 
 		 841 aa  540  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2065  TonB-dependent siderophore receptor  40.7 
 
 		 809 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1678  TonB-dependent siderophore receptor  39.9 
 
 		 830 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  38.16 
 
 		 824 aa  525  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1848  TonB-dependent siderophore receptor  37.46 
 
 		 826 aa  521  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.817483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  39.88 
 
 		 821 aa  518  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5131  TonB-dependent siderophore receptor  37.78 
 
 		 841 aa  503  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0759  TonB-dependent siderophore receptor  39.5 
 
 		 800 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0860  TonB-dependent siderophore receptor  37.81 
 
 		 841 aa  502  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0846  TonB-dependent siderophore receptor  37.38 
 
 		 841 aa  496  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0677  TonB-dependent siderophore receptor  38.47 
 
 		 745 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1961  TonB-dependent siderophore receptor  38.29 
 
 		 803 aa  492  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281016  normal  0.90568 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5294  TonB-dependent siderophore receptor  38.55 
 
 		 727 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117694 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3374  TonB-dependent siderophore receptor  38.55 
 
 		 738 aa  492  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0588335  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4993  TonB-dependent siderophore receptor  38.55 
 
 		 738 aa  492  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0250813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1823  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  39.94 
 
 		 747 aa  484  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0883  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  39.58 
 
 		 719 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2155  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  39.76 
 
 		 752 aa  479  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  36.22 
 
 		 836 aa  477  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0793  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  39.73 
 
 		 719 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.454561  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  35.01 
 
 		 822 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1962  TonB-dependent siderophore receptor  39.57 
 
 		 746 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1732  TonB-dependent siderophore receptor  35.74 
 
 		 864 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0884061  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  38.25 
 
 		 802 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  36.9 
 
 		 810 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2151  TonB-dependent siderophore receptor, putative  36.11 
 
 		 825 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0848793  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2152  TonB-dependent siderophore receptor, putative  38.96 
 
 		 743 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101667  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  38.5 
 
 		 703 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  36 
 
 		 844 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  38.47 
 
 		 822 aa  457  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0879  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  38.16 
 
 		 713 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.871457  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  35.71 
 
 		 812 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0604  TonB-dependent siderophore receptor  34.78 
 
 		 831 aa  445  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09340  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  37.05 
 
 		 720 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1171  TonB-dependent siderophore receptor  37.56 
 
 		 803 aa  429  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  35.22 
 
 		 816 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  36.63 
 
 		 722 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  34.68 
 
 		 802 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1784  TonB-dependent siderophore receptor  36.9 
 
 		 717 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306565  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3692  TonB-dependent siderophore receptor  36.81 
 
 		 722 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  35.45 
 
 		 819 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  33.94 
 
 		 795 aa  403  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  32.74 
 
 		 806 aa  402  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  32.61 
 
 		 808 aa  402  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  33.85 
 
 		 787 aa  400  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  34 
 
 		 799 aa  398  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  35.35 
 
 		 724 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  36.32 
 
 		 827 aa  397  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  34.08 
 
 		 801 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  35.36 
 
 		 817 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  34.52 
 
 		 803 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  32.59 
 
 		 812 aa  392  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  33.92 
 
 		 814 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  34.68 
 
 		 815 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3276  TonB-dependent siderophore receptor  34.89 
 
 		 840 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130164 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  33.13 
 
 		 789 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  32.97 
 
 		 798 aa  376  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  31.15 
 
 		 807 aa  358  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0400  ferripyoverdine receptor  32.93 
 
 		 744 aa  355  2.9999999999999997e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.736403  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4640  TonB-dependent siderophore receptor  36.13 
 
 		 719 aa  349  9e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0269226  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  33.46 
 
 		 833 aa  349  1e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4418  ferripyoverdine receptor  34.38 
 
 		 766 aa  348  3e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4556  TonB-dependent siderophore receptor  34.43 
 
 		 720 aa  347  4e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  35.12 
 
 		 723 aa  347  4e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2539  TonB-dependent siderophore receptor  33.89 
 
 		 753 aa  346  8.999999999999999e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2440  FhuE receptor  33.89 
 
 		 753 aa  346  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  35.96 
 
 		 714 aa  337  3.9999999999999995e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2583  TonB-dependent siderophore receptor  34.6 
 
 		 748 aa  334  3e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1482  TonB-dependent siderophore receptor  34.47 
 
 		 723 aa  335  3e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3182  TonB-dependent siderophore receptor  33.67 
 
 		 735 aa  332  1e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2192  TonB-dependent siderophore receptor  34.69 
 
 		 725 aa  332  2e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2711  TonB-dependent siderophore receptor  33.48 
 
 		 741 aa  332  3e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  34.33 
 
 		 778 aa  331  4e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1082  TonB-dependent siderophore receptor  33.47 
 
 		 730 aa  330  9e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1653  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 741 aa  327  5e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0605702  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2733  TonB-dependent siderophore receptor  33.29 
 
 		 747 aa  326  9e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000321343  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2414  TonB-dependent siderophore receptor  32.71 
 
 		 737 aa  326  1e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.486485  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3182  TonB-dependent receptor family protein  32.49 
 
 		 699 aa  326  1e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.223092 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2165  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.61 
 
 		 724 aa  325  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000331924 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1223  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.15 
 
 		 729 aa  324  5e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000020204  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1981  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.61 
 
 		 724 aa  324  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0489607  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1481  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.15 
 
 		 729 aa  324  5e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00382185  hitchhiker  0.00000310394 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1303  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.94 
 
 		 724 aa  323  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11921  hitchhiker  0.00000000921463 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01098  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.15 
 
 		 729 aa  323  7e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.523255  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1224  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.15 
 
 		 729 aa  323  7e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000059752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2499  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.15 
 
 		 729 aa  323  7e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318087  unclonable  0.0000000283448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01106  hypothetical protein  33.15 
 
 		 729 aa  323  7e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.689576  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1280  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.61 
 
 		 724 aa  323  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.76264 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2222  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.15 
 
 		 729 aa  322  9.999999999999999e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115447  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2025  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.01 
 
 		 729 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000237263  hitchhiker  0.0000045764 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2545  TonB-dependent siderophore receptor  32.79 
 
 		 729 aa  321  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00327648  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2812  TonB-dependent siderophore receptor  32.9 
 
 		 747 aa  321  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215946  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1318  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.47 
 
 		 724 aa  320  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45545  hitchhiker  0.0000000229507 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1617  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.99 
 
 		 728 aa  320  9e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000544721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0298  TonB-dependent siderophore receptor  32.19 
 
 		 765 aa  319  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496708  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>