More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1936 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 221 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.424112  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07591  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  71.49 
 
 		 221 aa  333  7.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14521  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  66.52 
 
 		 221 aa  312  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00861762 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01071  Short-chain dehydrogenases of various substrate specificities  65.16 
 
 		 221 aa  293  1e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.315767  normal  0.657338 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1408  short-chain dehydrogenase/reductase family protein  64.71 
 
 		 224 aa  291  4e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.417919  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0705  short-chain dehydrogenase/reductase  60.63 
 
 		 221 aa  285  4e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.096337  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07571  short-chain dehydrogenase/reductase  61.09 
 
 		 221 aa  285  5e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0975  short-chain dehydrogenase/reductase  62.9 
 
 		 221 aa  283  1.0000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.264766  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07551  short-chain dehydrogenase/reductase  60.63 
 
 		 221 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1087  short-chain dehydrogenase/reductase  65.16 
 
 		 221 aa  281  5.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.236682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08791  short-chain dehydrogenase/reductase  58.82 
 
 		 221 aa  269  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0124  short chain dehydrogenase family protein  59.45 
 
 		 219 aa  254  9e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.635136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.53 
 
 		 223 aa  252  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.14 
 
 		 223 aa  249  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4308  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  51.57 
 
 		 230 aa  222  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.39 
 
 		 223 aa  217  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01860  Short chain dehydrogenase family protein  47.93 
 
 		 219 aa  207  7e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.22 
 
 		 223 aa  206  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.85459  normal  0.0309227 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1267  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.139748 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.36 
 
 		 231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0036356  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2459  csgA protein  40.95 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.54228  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2690  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.48 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608582  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0735  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.24 
 
 		 233 aa  142  5e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.965519  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.21 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1469  short-chain dehydrogenase/reductase  37.83 
 
 		 234 aa  134  7.000000000000001e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1945  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 		 227 aa  134  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2239  short chain dehydrogenase  37.93 
 
 		 231 aa  132  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 		 231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.115059  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02810  hypothetical protein  37.12 
 
 		 247 aa  127  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.36 
 
 		 206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33463  short-chain alcohol dehydrogenase with NAD or NADP as acceptor  38.01 
 
 		 277 aa  126  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0139  short chain dehydrogenase  39.15 
 
 		 226 aa  125  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 		 231 aa  125  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.110275 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.3 
 
 		 231 aa  124  9e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.909495 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10348  predicted protein  40.64 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2058  short chain dehydrogenase / reductase  40.44 
 
 		 221 aa  123  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.252145 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.39 
 
 		 228 aa  122  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.97281  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.93 
 
 		 233 aa  121  8e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002919  short chain dehydrogenase  38.63 
 
 		 229 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1598  putative oxidoreductase protein  36.36 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0979  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.29 
 
 		 232 aa  116  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1086  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0107  short chain dehydrogenase  36.6 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.950091 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00830  cytoplasm protein, putative  32.74 
 
 		 260 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35363  predicted protein  35.59 
 
 		 253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.267844  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0133  short chain dehydrogenase  35.9 
 
 		 237 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.78 
 
 		 213 aa  112  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.77 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03037  hypothetical protein  39.36 
 
 		 193 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0229  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.6 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0125  short chain dehydrogenase  35.04 
 
 		 237 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.330397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.88 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0232972  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 258 aa  102  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1151  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 		 214 aa  101  7e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707447  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03161  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family superfamily (AFU_orthologue; AFUA_3G13450)  31.74 
 
 		 257 aa  99.8  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.560163  normal  0.771081 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000794  cell-cell signaling protein C-factor  30.93 
 
 		 235 aa  97.8  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.36 
 
 		 256 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00155018 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0275  short chain dehydrogenase  33.48 
 
 		 236 aa  96.3  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0287555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3390  short chain dehydrogenase  30.63 
 
 		 226 aa  96.7  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.47762 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.76 
 
 		 237 aa  95.9  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.77 
 
 		 217 aa  95.5  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.325387 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3129  short chain dehydrogenase  30.63 
 
 		 226 aa  95.5  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.78 
 
 		 228 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0722078 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54817  putative short chain dehydrogenase  31.2 
 
 		 255 aa  95.1  8e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.176178  normal  0.315077 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32277  short chain dehydrogenase  29.48 
 
 		 256 aa  94.4  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.741112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.39 
 
 		 244 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.120829  normal  0.282186 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.43 
 
 		 284 aa  94.4  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0460  short chain dehydrogenase  34.19 
 
 		 225 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.790746 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 		 252 aa  94  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.519755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  35.1 
 
 		 240 aa  94.4  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37020  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  35.32 
 
 		 279 aa  94.4  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32278  putative short chain dehydrogenase  29.2 
 
 		 255 aa  93.6  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3270  short chain dehydrogenase  29.73 
 
 		 226 aa  92.8  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36622  Predicted short chain-type dehydrogenase  31.1 
 
 		 250 aa  92.4  5e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06691  C factor cell-cell signaling protein  31.22 
 
 		 235 aa  92.4  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 		 227 aa  92  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02039  short chain oxidoreductase (CsgA), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00910)  28.24 
 
 		 251 aa  91.7  7e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.049775  normal  0.21203 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03636  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family protein  29.66 
 
 		 241 aa  91.7  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.246288  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 		 238 aa  90.9  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3424  hypothetical protein  32.47 
 
 		 264 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10130  short chain dehydrogenase  35.56 
 
 		 238 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206354  normal  0.858478 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09378  conserved hypothetical protein  34.55 
 
 		 282 aa  90.5  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.141306 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3970  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.65 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000119913  decreased coverage  0.00103281 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 		 279 aa  90.1  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.43 
 
 		 244 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.18 
 
 		 233 aa  90.1  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 228 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122274  normal  0.0405726 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1645  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.02 
 
 		 233 aa  90.1  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.138611  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0819  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 228 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2584  short chain dehydrogenase  30.61 
 
 		 254 aa  89.7  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.567266 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 		 277 aa  89.7  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4256  short chain dehydrogenase  32.05 
 
 		 225 aa  89.4  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55035  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.59 
 
 		 249 aa  89.4  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3873  C factor cell-cell signaling protein  31.22 
 
 		 235 aa  89  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0083  C factor  30.04 
 
 		 232 aa  89  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.61 
 
 		 233 aa  89  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1457  hypothetical protein  31.11 
 
 		 213 aa  89  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.74 
 
 		 228 aa  88.2  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.506179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>