177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1960 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1960  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 360 aa  741    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  50.32 
 
 		 423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0560  Peptidoglycan-binding LysM  51.7 
 
 		 507 aa  162  7e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0820449  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3560  Peptidoglycan-binding LysM  43.92 
 
 		 446 aa  133  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  41.38 
 
 		 762 aa  117  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  40.24 
 
 		 454 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0475  hypothetical protein  40 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1413  peptidoglycan-binding LysM  34.19 
 
 		 323 aa  99.4  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00299984  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2437  hypothetical protein  41.04 
 
 		 292 aa  95.1  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.693761  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4755  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.76 
 
 		 269 aa  94.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1886  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.01 
 
 		 635 aa  92.8  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.14 
 
 		 575 aa  90.9  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.94 
 
 		 508 aa  89.4  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.92 
 
 		 412 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  41.78 
 
 		 450 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2188  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.97 
 
 		 549 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.23 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2755  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.69 
 
 		 170 aa  75.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0221  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.41 
 
 		 447 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0446157  normal  0.633026 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4701  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.4 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.997176  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  37.68 
 
 		 372 aa  69.3  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.17 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.66 
 
 		 160 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.27 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  37.68 
 
 		 462 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.27 
 
 		 306 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.3 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5403  cell wall hydrolase/autolysin  33.77 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.81 
 
 		 382 aa  64.3  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  36.07 
 
 		 396 aa  63.5  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1959  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 487 aa  63.5  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315261  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1518  hypothetical protein  36.49 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  38.05 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7330  cell wall hydrolase/autolysin  35.45 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2804  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.67 
 
 		 364 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  28.82 
 
 		 232 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  38.18 
 
 		 239 aa  62  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  40.22 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  31.48 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  30.14 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0528  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.7 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  49.18 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  40.86 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2464  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.33 
 
 		 201 aa  57  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000202368  normal  0.0272444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5404  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.68 
 
 		 398 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5493  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.68 
 
 		 398 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5780  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.68 
 
 		 398 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.103235  normal  0.0225993 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4311  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 305 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3619  cell wall hydrolase/autolysin  31.21 
 
 		 313 aa  55.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.802629  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6069  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.03 
 
 		 395 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.93 
 
 		 77 aa  54.7  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  28.97 
 
 		 438 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  32 
 
 		 266 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0199  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.85 
 
 		 266 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  42.62 
 
 		 378 aa  53.5  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  42.42 
 
 		 540 aa  53.1  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  42.86 
 
 		 383 aa  53.1  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  44.62 
 
 		 283 aa  53.1  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4844  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.21 
 
 		 266 aa  53.1  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4788  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.76 
 
 		 163 aa  52.8  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.907058  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0837  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.19 
 
 		 395 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265707  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.09 
 
 		 323 aa  52.8  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13950  hydrolase  31.58 
 
 		 406 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1831  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.77 
 
 		 323 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37540  PG-binding-1 domain-containing protein  46.88 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1218  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.62 
 
 		 540 aa  52.4  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5099  cell wall hydrolase/autolysin  29.53 
 
 		 387 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4087  peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.07 
 
 		 249 aa  52.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2115  SCP-like extracellular  49.18 
 
 		 349 aa  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.147298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41210  petidoglycan binding protein  39.74 
 
 		 530 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.052034  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  31.16 
 
 		 358 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  36.78 
 
 		 242 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  37.14 
 
 		 234 aa  50.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0035  spore cortex-lytic enzyme  32.97 
 
 		 231 aa  51.2  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2145  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.93 
 
 		 531 aa  50.8  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.535243  normal  0.625753 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.08 
 
 		 300 aa  50.8  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0581  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.11 
 
 		 330 aa  50.4  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000627689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.55 
 
 		 1089 aa  50.8  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30050  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  40.58 
 
 		 246 aa  50.1  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0031896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  27.85 
 
 		 423 aa  50.1  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1619  hypothetical protein  36.84 
 
 		 536 aa  50.1  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.193231 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0604  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.1 
 
 		 326 aa  50.1  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.94 
 
 		 128 aa  50.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0056  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.08 
 
 		 160 aa  49.7  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1939  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.02 
 
 		 187 aa  49.3  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.19325 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2774  hypothetical protein  25.91 
 
 		 546 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.299675  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4768  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.3 
 
 		 245 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1443  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  37.23 
 
 		 242 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2786  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.1 
 
 		 587 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1416  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.91 
 
 		 546 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3347  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.71 
 
 		 629 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2908  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.31 
 
 		 273 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0270551  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1435  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.25 
 
 		 363 aa  49.3  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.7 
 
 		 559 aa  48.1  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3185  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.29 
 
 		 193 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00515387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4194  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.71 
 
 		 528 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  48.21 
 
 		 225 aa  48.5  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0109  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  37.5 
 
 		 361 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.880335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  39.71 
 
 		 324 aa  48.9  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2470  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.38 
 
 		 549 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.238543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>