169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1416 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2774  hypothetical protein  100 
 
 		 546 aa  1107    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.299675  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1416  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 546 aa  1107    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1035  peptidoglycan binding domain-containing protein  81.32 
 
 		 544 aa  915    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1619  hypothetical protein  53.94 
 
 		 536 aa  560  1e-158  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.193231 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1218  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.58 
 
 		 540 aa  535  1e-150  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2145  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.29 
 
 		 531 aa  511  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.535243  normal  0.625753 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1240  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.47 
 
 		 535 aa  400  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.770213 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2894  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.61 
 
 		 560 aa  278  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0428751  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2320  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.35 
 
 		 560 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.65 
 
 		 559 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2392  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.53 
 
 		 560 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.937016 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06430  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.24 
 
 		 547 aa  270  4e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1790  hypothetical protein  33 
 
 		 563 aa  266  1e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1899  hypothetical protein  32.4 
 
 		 571 aa  264  3e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1674  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.67 
 
 		 560 aa  261  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2142  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.13 
 
 		 563 aa  261  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.79447  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.11 
 
 		 556 aa  261  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2893  hypothetical protein  36.19 
 
 		 563 aa  260  5.0000000000000005e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.724025  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2069  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.73 
 
 		 560 aa  259  7e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.118953  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1895  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.98 
 
 		 565 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0937127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0313  hypothetical protein  33.54 
 
 		 546 aa  254  3e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890514 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2470  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.59 
 
 		 549 aa  249  7e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.238543  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1556  hypothetical protein  35.26 
 
 		 661 aa  247  3e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2580  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.88 
 
 		 629 aa  238  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.294872 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2095  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.93 
 
 		 566 aa  236  7e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.683622 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1075  hypothetical protein  33.91 
 
 		 598 aa  234  3e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.023264  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2068  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.54 
 
 		 672 aa  234  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494147  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1418  hypothetical protein  31.73 
 
 		 558 aa  231  3e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0511098  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1936  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.65 
 
 		 599 aa  229  8e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0941  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.29 
 
 		 549 aa  227  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2015  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.38 
 
 		 636 aa  226  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3586  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.97 
 
 		 525 aa  226  9e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3942  hypothetical protein  35.23 
 
 		 557 aa  224  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2224  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.6 
 
 		 668 aa  224  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0206  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.52 
 
 		 625 aa  223  7e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1003  hypothetical protein  34.4 
 
 		 554 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1575  hypothetical protein  32.44 
 
 		 631 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00305451  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1417  hypothetical protein  29.8 
 
 		 568 aa  221  3e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.118077  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0952  cell wall degradation protein  32.13 
 
 		 656 aa  221  3e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1223  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.45 
 
 		 775 aa  219  7e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.213789  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1407  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.73 
 
 		 716 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2235  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.35 
 
 		 637 aa  219  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.328672 
 
 
-
 
NC_004310  BR0962  hypothetical protein  31.93 
 
 		 572 aa  218  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.918601  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3815  hypothetical protein  34.22 
 
 		 540 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2752  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.76 
 
 		 646 aa  218  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2979  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.76 
 
 		 648 aa  217  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.32051  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1428  hypothetical protein  31.97 
 
 		 718 aa  217  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0991  hypothetical protein  30.41 
 
 		 811 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.95434 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1609  hypothetical protein  36.04 
 
 		 410 aa  215  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.831254  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2078  hypothetical protein  31.04 
 
 		 614 aa  213  4.9999999999999996e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142171  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0141  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.6 
 
 		 624 aa  213  7.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.764176 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1899  hypothetical protein  31.26 
 
 		 561 aa  212  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.131383  hitchhiker  0.000892254 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2875  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.94 
 
 		 662 aa  211  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.929395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1800  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.81 
 
 		 549 aa  211  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.081998  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1767  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.03 
 
 		 526 aa  210  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0815  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.14 
 
 		 443 aa  210  6e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418141  normal  0.712241 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1861  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.48 
 
 		 539 aa  209  8e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4668  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.56 
 
 		 724 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.257633  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0215  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.13 
 
 		 670 aa  207  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2903  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.5 
 
 		 399 aa  206  8e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000818135 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4967  hypothetical protein  30.95 
 
 		 523 aa  206  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6864  hypothetical protein  32.18 
 
 		 702 aa  204  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.337654  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3150  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.72 
 
 		 654 aa  203  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2171  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.66 
 
 		 540 aa  203  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2531  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.56 
 
 		 433 aa  203  6e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3935  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.68 
 
 		 534 aa  201  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444109  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5311  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.47 
 
 		 602 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2592  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.67 
 
 		 543 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000115115  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5236  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.04 
 
 		 586 aa  199  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0586878 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4769  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.04 
 
 		 590 aa  199  7e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.974647  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0008  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.33 
 
 		 516 aa  197  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000297379 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2112  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.49 
 
 		 447 aa  197  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1133  twin-arginine translocation pathway signal  35.05 
 
 		 419 aa  197  5.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01179  putative periplasmic protein  36.27 
 
 		 410 aa  196  8.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.383601  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1632  hypothetical protein  31.63 
 
 		 564 aa  196  9e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0884  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.73 
 
 		 456 aa  196  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.726278  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3977  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.12 
 
 		 730 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1828  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.94 
 
 		 458 aa  195  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1781  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.75 
 
 		 500 aa  195  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0274269 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1371  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.88 
 
 		 434 aa  194  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.389227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41210  petidoglycan binding protein  30.28 
 
 		 530 aa  192  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.052034  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1176  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.01 
 
 		 433 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0293552  normal  0.0832546 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1651  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.12 
 
 		 434 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0270124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1377  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.12 
 
 		 434 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.309518  decreased coverage  0.00000579578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3909  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.04 
 
 		 595 aa  190  5e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0227727  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4662  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.16 
 
 		 545 aa  190  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5373  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.84 
 
 		 432 aa  188  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.018729  normal  0.0376444 
 
 
-
 
NC_004310  BR0762  peptidoglycan-binding protein, putative  34.44 
 
 		 433 aa  187  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1265  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.14 
 
 		 433 aa  188  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0469401  normal  0.170975 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1660  hypothetical protein  31.39 
 
 		 563 aa  187  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0757  putative peptidoglycan-binding protein  34.44 
 
 		 446 aa  187  5e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0166  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.12 
 
 		 533 aa  187  6e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.211257  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3106  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.23 
 
 		 426 aa  187  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319093  normal  0.0282241 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0148  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.8 
 
 		 533 aa  186  8e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.246711  normal  0.747742 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003127  L,D-transpeptidase YcbB  38.31 
 
 		 513 aa  186  8e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00544147  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5299  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.53 
 
 		 426 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4673  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.51 
 
 		 540 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02710  hypothetical protein  30.08 
 
 		 530 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1612  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.5 
 
 		 472 aa  182  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.49 
 
 		 521 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>