More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6809 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6809  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 248 aa  502  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117739  hitchhiker  0.00016369 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4127  regulatory protein DeoR  52.82 
 
 		 248 aa  262  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0678  regulatory protein DeoR  50.61 
 
 		 247 aa  260  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.275525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4132  regulatory protein DeoR  51.61 
 
 		 248 aa  259  3e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.391954  normal  0.380185 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2096  regulatory protein DeoR  50.62 
 
 		 249 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.02145 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4140  regulatory protein DeoR  50.2 
 
 		 248 aa  251  8.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3407  regulatory protein DeoR  48.19 
 
 		 249 aa  249  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.161836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0682  regulatory protein DeoR  49.17 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.922623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0673  DeoR family transcriptional regulator  45.42 
 
 		 258 aa  221  7e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  40.16 
 
 		 248 aa  186  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3861  regulatory protein DeoR  42.23 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4658  transcriptional regulator, DeoR family  39.11 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0287988  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4813  DeoR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 231 aa  169  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  37.4 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  36.95 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  37.75 
 
 		 251 aa  162  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5351  transcriptional regulator, DeoR family  38.31 
 
 		 249 aa  159  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.382698  normal  0.4107 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  38.55 
 
 		 254 aa  158  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4860  DeoR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 270 aa  156  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3264  DeoR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 251 aa  152  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 251 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 251 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 251 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 251 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 251 aa  145  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 254 aa  143  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  36.4 
 
 		 253 aa  139  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01190  transcriptional regulator, DeoR family  31.73 
 
 		 252 aa  139  6e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3432  transcriptional regulator, DeoR family  34.66 
 
 		 249 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2141  DeoR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2290  transcriptional regulator, DeoR family  34.77 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2259  DeoR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 251 aa  132  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378185  hitchhiker  0.000108312 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  31.87 
 
 		 253 aa  131  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2702  transcriptional regulator, DeoR family  33.73 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  32.28 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  33.73 
 
 		 253 aa  130  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  32.27 
 
 		 261 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3833  transcriptional regulator, DeoR family  33.2 
 
 		 258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  33.6 
 
 		 259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0785  transcriptional regulator, DeoR family  34.16 
 
 		 251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.162222 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1164  transcriptional regulator DeoR family  32.13 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000280656  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0488  DeoR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  32.28 
 
 		 255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0012  transcriptional regulator, DeoR family  35.46 
 
 		 249 aa  125  6e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000515995  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0841  transcriptional regulator, DeoR family  32.41 
 
 		 249 aa  124  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0901  transcriptional regulator, DeoR family  34.57 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  33.07 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 253 aa  122  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 259 aa  122  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  32.79 
 
 		 248 aa  122  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4161  transcriptional regulator, DeoR family  32.38 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  30 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  32.26 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 250 aa  119  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3792  DeoR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 260 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.643818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  31.08 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7844  transcriptional regulator, DeoR family  31.76 
 
 		 255 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0958205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  29.76 
 
 		 253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  31.58 
 
 		 254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1360  DeoR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.019749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1875  transcriptional regulator, DeoR family  29.64 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4070  DeoR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 266 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  31.4 
 
 		 260 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0910  transcriptional regulator, DeoR family  30.92 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965103 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3064  DeoR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00624963  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  29.88 
 
 		 253 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4218  DeoR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 284 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  32.47 
 
 		 253 aa  112  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2386  DeoR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 268 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216225  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  28.57 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 274 aa  109  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3687  regulatory protein, DeoR  31.08 
 
 		 259 aa  109  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.300297  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2404  transcriptional regulator, DeoR family  31.44 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2220  DeoR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244246 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  30.9 
 
 		 253 aa  108  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4896  transcriptional regulator, DeoR family  31.6 
 
 		 265 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302168  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 284 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5895  DeoR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  31.56 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4660  DeoR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  29.08 
 
 		 269 aa  105  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  29.08 
 
 		 269 aa  105  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.08 
 
 		 269 aa  105  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.08 
 
 		 269 aa  105  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  29.08 
 
 		 269 aa  105  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.08 
 
 		 269 aa  105  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.08 
 
 		 269 aa  105  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5063  DeoR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 251 aa  105  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184796  normal  0.547667 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  29.11 
 
 		 256 aa  105  7e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  32.34 
 
 		 282 aa  105  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0512  transcriptional regulator, DeoR family  31.65 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.826881  normal  0.165905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>