266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3262 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  44.95 
 
 		 1068 aa  907    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  53.57 
 
 		 1053 aa  1147    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  56.42 
 
 		 1066 aa  1249    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  56.92 
 
 		 1071 aa  1271    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  58.81 
 
 		 1052 aa  1311    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  100 
 
 		 1067 aa  2192    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  25.86 
 
 		 1041 aa  230  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  24.5 
 
 		 1097 aa  220  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  23.86 
 
 		 1129 aa  215  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  24.82 
 
 		 1125 aa  213  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1077 aa  211  7e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  23.84 
 
 		 1100 aa  210  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  22.85 
 
 		 1074 aa  198  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  24.87 
 
 		 1081 aa  192  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  23.65 
 
 		 1056 aa  184  6e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  22.29 
 
 		 1071 aa  173  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1105 aa  172  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  29.47 
 
 		 1074 aa  154  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  31.83 
 
 		 1176 aa  137  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  30.41 
 
 		 1116 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  30.81 
 
 		 1066 aa  132  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  25.62 
 
 		 1125 aa  130  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  30.49 
 
 		 1075 aa  128  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  33 
 
 		 1123 aa  128  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  23.43 
 
 		 1061 aa  126  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  31.27 
 
 		 1069 aa  124  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  32 
 
 		 1008 aa  120  9e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  30.74 
 
 		 1173 aa  120  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  29.09 
 
 		 1008 aa  120  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 1105 aa  119  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 1232 aa  119  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 1041 aa  118  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  28.93 
 
 		 1075 aa  118  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  22.8 
 
 		 1051 aa  117  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  28.37 
 
 		 1210 aa  116  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 1206 aa  115  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 1153 aa  114  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  29.87 
 
 		 1162 aa  112  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  31.72 
 
 		 1141 aa  111  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  30.48 
 
 		 986 aa  110  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  22.18 
 
 		 1114 aa  110  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  27.81 
 
 		 1010 aa  110  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 1065 aa  108  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 1016 aa  108  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  28.07 
 
 		 1196 aa  108  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 1105 aa  107  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  27.78 
 
 		 511 aa  107  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  24.88 
 
 		 1068 aa  106  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  25.76 
 
 		 1195 aa  105  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  30.41 
 
 		 992 aa  105  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  28.2 
 
 		 1194 aa  105  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 1167 aa  103  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  28.3 
 
 		 1161 aa  102  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  28.97 
 
 		 1203 aa  100  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 1149 aa  100  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  22.24 
 
 		 966 aa  98.6  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  27.95 
 
 		 1162 aa  97.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  21.74 
 
 		 1008 aa  96.7  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 1123 aa  95.9  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  28.79 
 
 		 1122 aa  95.1  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  28.03 
 
 		 1257 aa  94.7  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 1026 aa  94  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  20.51 
 
 		 1057 aa  90.5  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 1124 aa  89.7  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  30.07 
 
 		 1132 aa  89.7  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  28.26 
 
 		 1012 aa  89.7  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  26.42 
 
 		 1122 aa  85.9  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  26.42 
 
 		 1120 aa  85.5  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  26.18 
 
 		 1126 aa  84.7  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 1066 aa  84  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 897 aa  83.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  27.3 
 
 		 1066 aa  82.8  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0900  hypothetical protein  27.34 
 
 		 1194 aa  81.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  25.54 
 
 		 1001 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  25.71 
 
 		 1007 aa  79.7  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 993 aa  78.2  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  27.76 
 
 		 1109 aa  77.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  26.94 
 
 		 979 aa  76.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  26.6 
 
 		 1298 aa  76.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  28.35 
 
 		 972 aa  76.6  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2820  TonB-dependent receptor plug  32.39 
 
 		 1057 aa  75.1  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 1188 aa  74.3  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 952 aa  73.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 1089 aa  74.3  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 		 888 aa  73.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  25.52 
 
 		 1054 aa  73.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  27.97 
 
 		 1037 aa  73.2  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.54 
 
 		 1050 aa  71.6  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 991 aa  68.9  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 1010 aa  65.5  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 1049 aa  64.3  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  27.78 
 
 		 1066 aa  63.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 1064 aa  62.8  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  23.69 
 
 		 783 aa  62.4  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  27.85 
 
 		 1079 aa  61.6  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  29.17 
 
 		 791 aa  61.6  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 791 aa  61.6  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  29.35 
 
 		 1060 aa  61.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 1087 aa  60.1  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 1019 aa  60.1  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>