138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0610 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0610  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 189 aa  391  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.442155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1053  hypothetical protein  35.8 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00146188  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0906  hypothetical protein  35.8 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0888  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.845655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0869  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0964  hypothetical protein  35.8 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0874  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1133  hypothetical protein  34.66 
 
 		 188 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1007  hypothetical protein  35.23 
 
 		 188 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.374839  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4295  hypothetical protein  34.66 
 
 		 188 aa  110  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2667  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 185 aa  93.2  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000225339  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04420  transcriptional regulator, tetR family  27.95 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197564 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1048  probable dihydroxyacetone kinase regulator  34.53 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65862e-21 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24520  transcriptional regulator, tetR family  24.85 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1710  hypothetical protein  27.88 
 
 		 289 aa  78.2  0.00000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1164  putative transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.296782  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1648  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00269444  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 192 aa  72  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04470  transcriptional regulator, tetR family  25.27 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000324783 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0361  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00610  transcriptional regulator  25.44 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09210  transcriptional regulator, tetR family  27.89 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.355198  normal  0.265854 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11210  transcriptional regulator, tetR family  28.98 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1478  TetR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0176  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  27.61 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 219 aa  62  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  22.67 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  22.7 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03160  transcriptional regulator  24.4 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  20.22 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2135  TetR family transcriptional regulator  22.35 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000090207  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1946  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3180  putative transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  22.81 
 
 		 184 aa  53.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2378  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.576204  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2424  regulatory protein TetR  25.99 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.428884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  25.86 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  24.42 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 225 aa  52  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 205 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 205 aa  51.6  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 205 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 205 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 205 aa  51.6  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  24.44 
 
 		 205 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2594  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 195 aa  51.2  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2648  regulatory protein TetR  25 
 
 		 195 aa  51.2  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1364  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 206 aa  51.2  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22230  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.158788 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08810  hypothetical protein  24.28 
 
 		 217 aa  50.4  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.239568 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  26.51 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  22.81 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 202 aa  48.5  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 196 aa  48.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6632  transcriptional regulator, TetR family  19.5 
 
 		 226 aa  48.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000455029  decreased coverage  0.000000500161 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1310  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000104064  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0254  hypothetical protein  23.23 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0212  transcriptional regulator, TetR family  21.51 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  23.76 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  23.76 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  34.69 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.852113 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4896  AcrR family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1863  putative transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.318019 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2963  transcriptional regulator, TetR family  19.39 
 
 		 177 aa  45.8  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1970  TetR/AcrR family transcriptional regulator  19.68 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000170577  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  23.37 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 205 aa  45.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1104  AcrR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 243 aa  46.2  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  39.58 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  21.08 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 181 aa  45.1  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0202  putative transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 195 aa  45.1  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>