More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2210 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
139 aa  282  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  79.14 
 
 
139 aa  236  9e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  67.63 
 
 
139 aa  206  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  66.67 
 
 
139 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2159  heat shock protein Hsp20  69.78 
 
 
139 aa  192  1e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0250  HSP20 family protein  61.87 
 
 
139 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.962825  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  51.8 
 
 
134 aa  150  8e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  45.86 
 
 
134 aa  135  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  46.97 
 
 
132 aa  133  7.000000000000001e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  46.38 
 
 
132 aa  130  5e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  40.91 
 
 
132 aa  124  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0756  heat shock protein Hsp20  45.04 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.16256 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2155  heat shock protein Hsp20  47.86 
 
 
132 aa  105  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  46.09 
 
 
151 aa  101  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  42.48 
 
 
145 aa  100  8e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1695  heat shock protein Hsp20  40.94 
 
 
151 aa  97.8  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  45.63 
 
 
147 aa  97.1  8e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  38.74 
 
 
146 aa  95.5  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  45.54 
 
 
143 aa  95.5  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  38.74 
 
 
146 aa  95.5  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  42.31 
 
 
147 aa  94.7  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  40.3 
 
 
152 aa  93.6  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  40.37 
 
 
153 aa  91.3  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  41.43 
 
 
141 aa  91.3  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  40.32 
 
 
142 aa  90.9  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  38.24 
 
 
148 aa  89.4  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  37.8 
 
 
147 aa  88.6  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
146 aa  88.6  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  41.35 
 
 
148 aa  88.2  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  39.2 
 
 
144 aa  87.8  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
147 aa  87.8  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2938  heat shock protein Hsp20  37.7 
 
 
145 aa  87.8  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491843  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  35.2 
 
 
156 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3125  heat shock protein Hsp20  44.9 
 
 
149 aa  86.3  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  36.72 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  36.22 
 
 
150 aa  85.1  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  38.64 
 
 
211 aa  84.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  34.82 
 
 
189 aa  85.1  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
230 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  40.18 
 
 
143 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1149  heat shock protein Hsp20  44.95 
 
 
140 aa  84.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1219  heat shock protein Hsp20  44.95 
 
 
140 aa  84.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2899  heat shock protein Hsp20  33.86 
 
 
145 aa  84  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0174584 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  36.05 
 
 
158 aa  84  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  34.35 
 
 
146 aa  84  6e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  44.57 
 
 
150 aa  84  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  34.59 
 
 
156 aa  83.6  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  42.72 
 
 
149 aa  83.6  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  37.12 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  29.25 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2086  heat shock protein, Hsp20 family  40 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  40.38 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  45.19 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  36.22 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6221  heat shock protein Hsp20  40.78 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  32 
 
 
158 aa  82  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  38.83 
 
 
147 aa  82  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  32.89 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  39.42 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  44.33 
 
 
148 aa  82  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
136 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4382  heat shock protein Hsp20  44.14 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4514  heat shock protein Hsp20  44.14 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.165488  normal  0.480818 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  30.37 
 
 
189 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  39.42 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  39.42 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  32.06 
 
 
185 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  32.06 
 
 
185 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  30.4 
 
 
160 aa  80.1  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  30.4 
 
 
160 aa  80.1  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  32.46 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  33.04 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  33.98 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  37.11 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1967  heat shock protein Hsp20  30.61 
 
 
178 aa  79  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2250  heat shock protein Hsp20  31.58 
 
 
178 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  31.79 
 
 
167 aa  78.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  29.63 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2459  heat shock protein Hsp20  35.07 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134169  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  34.19 
 
 
176 aa  79  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  41.59 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6319  heat shock protein Hsp20  39.67 
 
 
149 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  42.39 
 
 
162 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3113  heat shock protein Hsp20  34.33 
 
 
142 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.800815  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  35.64 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  35.64 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  40.34 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  37.74 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0686  heat shock protein HSP20  33.57 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  45.19 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  37.14 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  39.33 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0200  putative small HEAT shock protein  38.73 
 
 
140 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.32202 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3917  heat shock protein Hsp20  34.07 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  39.33 
 
 
144 aa  77  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>