More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2735 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  100 
 
 		 278 aa  565  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  75.36 
 
 		 276 aa  436  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  71.58 
 
 		 273 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  65.34 
 
 		 273 aa  369  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  63.77 
 
 		 273 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  62.28 
 
 		 283 aa  358  5e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  64.55 
 
 		 264 aa  351  7e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  49.54 
 
 		 220 aa  186  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  46.12 
 
 		 228 aa  175  9e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  46.15 
 
 		 226 aa  169  6e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  43.33 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  44.5 
 
 		 200 aa  145  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1404  rhomboid family protein  42.13 
 
 		 238 aa  143  4e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.334243 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  39.81 
 
 		 232 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  40 
 
 		 220 aa  139  7e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  40 
 
 		 220 aa  138  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1130  integral membrane protein  42.31 
 
 		 196 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.283045  normal  0.0126937 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2146  Rhomboid family protein  33.73 
 
 		 258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000095331  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  44.3 
 
 		 224 aa  132  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  37.82 
 
 		 197 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07075  rhomboid family protein  36.17 
 
 		 247 aa  122  7e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  34.35 
 
 		 291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0210  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0482  Rhomboid family protein  32.61 
 
 		 241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0016  hypothetical protein  36.17 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4665  rhomboid-like protein  38.24 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0483  Rhomboid family protein  33.78 
 
 		 286 aa  108  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5548  Rhomboid family protein  35.52 
 
 		 198 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1772  hypothetical protein  36.02 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.884699 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0277  Rhomboid family protein  28.19 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.499185  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  34.38 
 
 		 209 aa  105  7e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1588  Rhomboid family protein  36.28 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02331  hypothetical protein  38.38 
 
 		 197 aa  102  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930848 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  41.73 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  33.33 
 
 		 234 aa  98.6  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3809  Rhomboid family protein  29.63 
 
 		 304 aa  96.3  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.199592 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0913  Rhomboid family protein  34.74 
 
 		 247 aa  95.9  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0106896 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1572  S54 family peptidase  32.35 
 
 		 260 aa  95.5  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.013038  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5567  Rhomboid family protein  29.63 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1485  S54 family peptidase  32.35 
 
 		 260 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0073  peptidase  32.35 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104712  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4409  Rhomboid family protein  37.16 
 
 		 197 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.824835 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4542  Rhomboid family protein  37.16 
 
 		 197 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00483276 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1039  serine protease  32.84 
 
 		 202 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224714  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1192  S54 family peptidase  32.84 
 
 		 202 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.970208  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  34.29 
 
 		 207 aa  94  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0021  S54 family peptidase  32.84 
 
 		 202 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0391  S54 family peptidase  32.84 
 
 		 202 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6620  Rhomboid family protein  32.74 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000794004  hitchhiker  0.00987109 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1225  regulatory proteins, IclR  35.75 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0542278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0568  rhomboid family protein  38.56 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1970  rhomboid family protein  36.84 
 
 		 246 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0861  Rhomboid family protein  39.32 
 
 		 277 aa  90.1  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1446  rhomboid family protein  28.86 
 
 		 248 aa  89.4  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.154997  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1812  Rhomboid family protein  32 
 
 		 237 aa  89  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00264176  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  36.02 
 
 		 232 aa  88.2  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3495  rhomboid family protein  28.99 
 
 		 297 aa  88.2  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  34.95 
 
 		 231 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  37.59 
 
 		 205 aa  86.7  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2616  rhomboid family protein  35 
 
 		 253 aa  85.1  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1579  rhomboid family protein  35.33 
 
 		 252 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279558  hitchhiker  0.00570549 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1885  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0593974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1526  Rhomboid family protein  33.67 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0209  rhomboid family protein  29.39 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1165  rhomboid family protein  31.46 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00020927  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  31.67 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2713  Rhomboid family protein  33.01 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07080  putative transmembrane rhomboid family protein  29.29 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0999  Rhomboid family protein  32.89 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.46711  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2049  uncharacterized membrane protein  32.52 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0326  Rhomboid family protein  32.18 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1200  rhomboid family protein  33.91 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.302256  normal  0.536903 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3255  rhomboid-like protein  35.53 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709043  normal  0.549561 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0287  hypothetical protein  33.77 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.742971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  27.83 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0686  rhomboid family protein  31.37 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0078809 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0331  rhomboid family protein  39.58 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1502  rhomboid family protein  35.92 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.175521  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1151  rhomboid-like protein  32.19 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000385696  normal  0.159732 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1727  rhomboid family protein  28.3 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0851  rhomboid family protein  33.1 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0228  Rhomboid family protein  32.23 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1654  hypothetical protein  29.82 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2298  Rhomboid family protein  30.57 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  26.54 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1050  Rhomboid family protein  31.86 
 
 		 220 aa  78.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1000  rhomboid family protein  34.78 
 
 		 247 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0762405 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0742  Rhomboid family protein  34.3 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6787  Rhomboid family protein  30.47 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132625 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3853  Rhomboid family protein  30.87 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1657  rhomboid family protein  31.73 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000107341  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  29.38 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3810  Rhomboid family protein  53.75 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.450903  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  32.18 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  30.57 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1730  rhomboid family protein  31.68 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0105821  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  31.35 
 
 		 239 aa  75.1  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2191  Rhomboid family protein  28.44 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1066  rhomboid-like protein  37.42 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206905  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2204  rhomboid-like protein  34.04 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  0.88573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>