More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0369 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  52.89 
 
 		 883 aa  650    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  54.25 
 
 		 882 aa  639    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0255  translation initiation factor IF-2  53.69 
 
 		 979 aa  695    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0300  translation initiation factor IF-2  75.1 
 
 		 952 aa  1416    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0137727  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0139  translation initiation factor IF-2  48.36 
 
 		 908 aa  664    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1215  translation initiation factor IF-2  53.97 
 
 		 1148 aa  668    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  53.95 
 
 		 692 aa  642    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1779  translation initiation factor IF-2  83 
 
 		 915 aa  1215    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.0703365 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1462  translation initiation factor IF-2  68.59 
 
 		 1022 aa  1293    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.887341  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  55.38 
 
 		 884 aa  652    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0402  translation initiation factor IF-2  67.98 
 
 		 911 aa  1226    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000176778  normal  0.341297 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  51.62 
 
 		 985 aa  642    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01335  putative translation initiation factor  53.25 
 
 		 943 aa  704    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  52.83 
 
 		 956 aa  691    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  52.86 
 
 		 949 aa  639    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0398  translation initiation factor IF-2  73.4 
 
 		 986 aa  1360    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0010836  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3422  translation initiation factor IF-2  53.4 
 
 		 1008 aa  703    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  54.97 
 
 		 732 aa  641    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  40.68 
 
 		 945 aa  693    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0141  translation initiation factor IF-2  52.91 
 
 		 1010 aa  689    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  59.7 
 
 		 924 aa  722    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  51.95 
 
 		 921 aa  646    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 991 aa  2003    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  76.68 
 
 		 936 aa  1158    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0032  translation initiation factor IF-2  51.96 
 
 		 1016 aa  671    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.247962 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  54.88 
 
 		 739 aa  632  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  53.47 
 
 		 986 aa  635  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  53.12 
 
 		 980 aa  633  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  52.36 
 
 		 971 aa  631  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  51.98 
 
 		 903 aa  627  1e-178  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  54.62 
 
 		 686 aa  625  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  52.46 
 
 		 1029 aa  625  1e-177  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  54.62 
 
 		 686 aa  625  1e-177  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0653  translation initiation factor IF-2  51.95 
 
 		 1204 aa  625  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.696738  normal  0.0609071 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  53.93 
 
 		 686 aa  619  1e-176  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  54.28 
 
 		 686 aa  622  1e-176  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  54.28 
 
 		 686 aa  622  1e-176  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  54.18 
 
 		 689 aa  621  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  41.82 
 
 		 947 aa  622  1e-176  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  53.93 
 
 		 686 aa  619  1e-176  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  54.1 
 
 		 688 aa  620  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  54.1 
 
 		 688 aa  619  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  54.28 
 
 		 686 aa  622  1e-176  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  51.75 
 
 		 907 aa  616  1e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  50.6 
 
 		 896 aa  615  9.999999999999999e-175  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  51.88 
 
 		 888 aa  613  9.999999999999999e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  51.89 
 
 		 920 aa  614  9.999999999999999e-175  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  51.07 
 
 		 822 aa  610  1e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  51.45 
 
 		 885 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  51.45 
 
 		 880 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  50.41 
 
 		 885 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  50.81 
 
 		 962 aa  607  9.999999999999999e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  51.28 
 
 		 889 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  51.37 
 
 		 1079 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  51.48 
 
 		 898 aa  603  1.0000000000000001e-171  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  51.45 
 
 		 880 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  51.45 
 
 		 880 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  51.8 
 
 		 896 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  48.21 
 
 		 885 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  48.21 
 
 		 885 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  50.6 
 
 		 881 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  52.24 
 
 		 879 aa  603  1.0000000000000001e-171  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  51.45 
 
 		 880 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  53.24 
 
 		 845 aa  604  1.0000000000000001e-171  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  51.45 
 
 		 880 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  52.18 
 
 		 720 aa  601  1e-170  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  49.91 
 
 		 889 aa  600  1e-170  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  52.36 
 
 		 705 aa  600  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  52.78 
 
 		 854 aa  601  1e-170  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  51.5 
 
 		 686 aa  602  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  50.94 
 
 		 884 aa  601  1e-170  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  51.11 
 
 		 896 aa  601  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  51.83 
 
 		 882 aa  600  1e-170  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  51.79 
 
 		 882 aa  600  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  52.36 
 
 		 705 aa  600  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  50.31 
 
 		 964 aa  595  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 997 aa  598  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  51.66 
 
 		 894 aa  597  1e-169  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  50.94 
 
 		 894 aa  597  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  51.13 
 
 		 891 aa  595  1e-168  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  51.17 
 
 		 1079 aa  595  1e-168  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 		 1161 aa  592  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 975 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 922 aa  595  1e-168  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 975 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  49.77 
 
 		 976 aa  593  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 975 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  50.24 
 
 		 979 aa  594  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09360  translation initiation factor IF-2  54.43 
 
 		 941 aa  594  1e-168  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912391  normal  0.894138 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  50.43 
 
 		 895 aa  593  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  47.53 
 
 		 949 aa  594  1e-168  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 975 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0131  translation initiation factor IF-2  50.26 
 
 		 871 aa  590  1e-167  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  51.81 
 
 		 964 aa  590  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  49.92 
 
 		 975 aa  592  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  51.81 
 
 		 984 aa  591  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  49.92 
 
 		 975 aa  592  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  51.64 
 
 		 964 aa  590  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  50.92 
 
 		 879 aa  592  1e-167  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  49.92 
 
 		 975 aa  592  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>